MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_004741	CAAA	2	8	3671055	3671062	75 %	0 %	0 %	25 %	30064812
57502	NC_004741	CGC	2	6	3671070	3671075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064812
57503	NC_004741	TGC	2	6	3671135	3671140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064812
57504	NC_004741	CTT	2	6	3671151	3671156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064812
57505	NC_004741	CGG	2	6	3671162	3671167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064812
57506	NC_004741	CCG	2	6	3671213	3671218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064812
57507	NC_004741	GCG	2	6	3671249	3671254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064812
57508	NC_004741	CAGT	2	8	3671265	3671272	25 %	25 %	25 %	25 %	30064812
57509	NC_004741	CAT	2	6	3671310	3671315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064812
57510	NC_004741	TTG	2	6	3671321	3671326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064812
57511	NC_004741	CGC	2	6	3671391	3671396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064812
57512	NC_004741	CGG	2	6	3671429	3671434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064812
57513	NC_004741	GCG	2	6	3671455	3671460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064812
57514	NC_004741	AGGA	2	8	3671496	3671503	50 %	0 %	50 %	0 %	30064812
57515	NC_004741	CG	3	6	3671526	3671531	0 %	0 %	50 %	50 %	30064812
57516	NC_004741	TAT	2	6	3671539	3671544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30064812
57517	NC_004741	CAT	2	6	3671599	3671604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064812
57518	NC_004741	CAC	2	6	3671605	3671610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064812
57519	NC_004741	CTT	2	6	3671646	3671651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064812
57520	NC_004741	ATC	2	6	3671683	3671688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064812
57521	NC_004741	CGC	2	6	3671690	3671695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064812
57522	NC_004741	T	7	7	3671757	3671763	0 %	100 %	0 %	0 %	30064812
57523	NC_004741	AC	3	6	3671791	3671796	50 %	0 %	0 %	50 %	30064812
57524	NC_004741	GGCA	2	8	3672007	3672014	25 %	0 %	50 %	25 %	30064813
57525	NC_004741	CTG	2	6	3672077	3672082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064813
57526	NC_004741	A	6	6	3672163	3672168	100 %	0 %	0 %	0 %	30064813
57527	NC_004741	ATCT	2	8	3672178	3672185	25 %	50 %	0 %	25 %	30064813
57528	NC_004741	TGG	2	6	3672252	3672257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064813
57529	NC_004741	GCA	2	6	3672322	3672327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064813
57530	NC_004741	ATCGC	2	10	3672351	3672360	20 %	20 %	20 %	40 %	30064813
57531	NC_004741	TGA	2	6	3672366	3672371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064813
57532	NC_004741	AAG	2	6	3672372	3672377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064813
57533	NC_004741	TG	3	6	3672450	3672455	0 %	50 %	50 %	0 %	30064813
57534	NC_004741	CG	3	6	3672503	3672508	0 %	0 %	50 %	50 %	30064813
57535	NC_004741	ACCA	2	8	3672599	3672606	50 %	0 %	0 %	50 %	30064813
57536	NC_004741	TCG	2	6	3672633	3672638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064813
57537	NC_004741	CGC	2	6	3672655	3672660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064813
57538	NC_004741	GATC	2	8	3672730	3672737	25 %	25 %	25 %	25 %	30064813
57539	NC_004741	CGG	3	9	3672753	3672761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064813
57540	NC_004741	ACT	2	6	3672768	3672773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064813
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57542	NC_004741	CGTG	2	8	3672892	3672899	0 %	25 %	50 %	25 %	30064813
57543	NC_004741	ACG	2	6	3672936	3672941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064813
57544	NC_004741	TCC	2	6	3672965	3672970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30064813
57545	NC_004741	GAT	2	6	3673237	3673242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064813
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57547	NC_004741	CGG	3	9	3673273	3673281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064813
57548	NC_004741	ACCT	2	8	3673397	3673404	25 %	25 %	0 %	50 %	30064813
57549	NC_004741	GCT	2	6	3673426	3673431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064813
57550	NC_004741	ACT	2	6	3673446	3673451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064813
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57553	NC_004741	CTT	2	6	3673492	3673497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064813
57554	NC_004741	CGG	2	6	3673512	3673517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064813
57555	NC_004741	ACG	2	6	3673563	3673568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064813
57556	NC_004741	GAT	2	6	3673585	3673590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064813
57557	NC_004741	AACAAA	2	12	3673652	3673663	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	30064813
57558	NC_004741	TGTC	2	8	3673673	3673680	0 %	50 %	25 %	25 %	30064813
57559	NC_004741	TCG	2	6	3673769	3673774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064813
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57566	NC_004741	CGT	2	6	3674216	3674221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064813
57567	NC_004741	GCTGG	2	10	3674254	3674263	0 %	20 %	60 %	20 %	30064813
57568	NC_004741	GCATGG	2	12	3674264	3674275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	30064813
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57570	NC_004741	CAGCG	2	10	3674401	3674410	20 %	0 %	40 %	40 %	30064813
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57572	NC_004741	GCA	2	6	3674443	3674448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064813
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57578	NC_004741	CAAAGC	2	12	3674803	3674814	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	30064813
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57581	NC_004741	TCCT	2	8	3674981	3674988	0 %	50 %	0 %	50 %	30064813
57582	NC_004741	GAC	2	6	3675015	3675020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064813
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57589	NC_004741	ATTGC	2	10	3675435	3675444	20 %	40 %	20 %	20 %	30064814
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57592	NC_004741	GCTGA	2	10	3675623	3675632	20 %	20 %	40 %	20 %	30064814
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57600	NC_004741	GGGCT	2	10	3676015	3676024	0 %	20 %	60 %	20 %	30064815
57601	NC_004741	TCA	3	9	3676124	3676132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064815
57602	NC_004741	AATC	2	8	3676161	3676168	50 %	25 %	0 %	25 %	30064815
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57615	NC_004741	CGAG	2	8	3676591	3676598	25 %	0 %	50 %	25 %	30064816
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