MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_004741	GAA	2	6	3510692	3510697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064691
55002	NC_004741	CGT	2	6	3510743	3510748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064691
55003	NC_004741	TGC	2	6	3510757	3510762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064691
55004	NC_004741	CAG	2	6	3510765	3510770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064691
55005	NC_004741	GTTT	2	8	3510902	3510909	0 %	75 %	25 %	0 %	30064691
55006	NC_004741	TGA	2	6	3511081	3511086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064692
55007	NC_004741	GTG	2	6	3511104	3511109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064692
55008	NC_004741	TAA	2	6	3511164	3511169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064692
55009	NC_004741	CGC	2	6	3511241	3511246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064692
55010	NC_004741	CAG	3	9	3511283	3511291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064692
55011	NC_004741	CCAT	2	8	3511381	3511388	25 %	25 %	0 %	50 %	30064692
55012	NC_004741	CGGAA	2	10	3511423	3511432	40 %	0 %	40 %	20 %	30064692
55013	NC_004741	T	6	6	3511440	3511445	0 %	100 %	0 %	0 %	30064692
55014	NC_004741	ATA	2	6	3511476	3511481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064692
55015	NC_004741	CAG	2	6	3511496	3511501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064692
55016	NC_004741	GCC	2	6	3511541	3511546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064692
55017	NC_004741	AAG	2	6	3511577	3511582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064692
55018	NC_004741	GCCA	2	8	3511620	3511627	25 %	0 %	25 %	50 %	30064692
55019	NC_004741	T	6	6	3511643	3511648	0 %	100 %	0 %	0 %	30064692
55020	NC_004741	CAG	2	6	3511652	3511657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064692
55021	NC_004741	CAG	2	6	3511808	3511813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064692
55022	NC_004741	GCC	2	6	3511932	3511937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064692
55023	NC_004741	CGGA	2	8	3511949	3511956	25 %	0 %	50 %	25 %	30064692
55024	NC_004741	TGT	2	6	3511957	3511962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064692
55025	NC_004741	CGT	2	6	3511975	3511980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064692
55026	NC_004741	GAT	2	6	3511982	3511987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064692
55027	NC_004741	GCG	2	6	3512081	3512086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064692
55028	NC_004741	CAG	2	6	3512087	3512092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064692
55029	NC_004741	GCA	2	6	3512107	3512112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064692
55030	NC_004741	GCC	2	6	3512151	3512156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064692
55031	NC_004741	ACC	2	6	3512157	3512162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064692
55032	NC_004741	TGG	2	6	3512189	3512194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064692
55033	NC_004741	GAAGAC	2	12	3512213	3512224	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	30064692
55034	NC_004741	TAA	2	6	3512249	3512254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064692
55035	NC_004741	ACC	2	6	3512267	3512272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064692
55036	NC_004741	TAT	2	6	3512303	3512308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30064692
55037	NC_004741	TG	3	6	3512332	3512337	0 %	50 %	50 %	0 %	30064692
55038	NC_004741	AGT	2	6	3512929	3512934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064693
55039	NC_004741	ACGGTA	2	12	3512948	3512959	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	30064693
55040	NC_004741	CCAG	2	8	3513016	3513023	25 %	0 %	25 %	50 %	30064693
55041	NC_004741	TCG	2	6	3513075	3513080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064693
55042	NC_004741	GCGT	2	8	3513124	3513131	0 %	25 %	50 %	25 %	30064693
55043	NC_004741	GCG	2	6	3513139	3513144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064693
55044	NC_004741	CGA	2	6	3513162	3513167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064693
55045	NC_004741	GCT	2	6	3513185	3513190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064693
55046	NC_004741	ATA	2	6	3513224	3513229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064693
55047	NC_004741	GCC	2	6	3513259	3513264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064693
55048	NC_004741	GGA	2	6	3513368	3513373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30064693
55049	NC_004741	ATCAC	2	10	3513381	3513390	40 %	20 %	0 %	40 %	30064693
55050	NC_004741	CG	3	6	3513399	3513404	0 %	0 %	50 %	50 %	30064693
55051	NC_004741	CGT	2	6	3513592	3513597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064693
55052	NC_004741	TAAT	2	8	3513604	3513611	50 %	50 %	0 %	0 %	30064693
55053	NC_004741	ATC	2	6	3513618	3513623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064693
55054	NC_004741	A	6	6	3513658	3513663	100 %	0 %	0 %	0 %	30064694
55055	NC_004741	TG	3	6	3513665	3513670	0 %	50 %	50 %	0 %	30064694
55056	NC_004741	TGC	2	6	3513699	3513704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064694
55057	NC_004741	TGT	2	6	3513722	3513727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064694
55058	NC_004741	CTCG	2	8	3513750	3513757	0 %	25 %	25 %	50 %	30064694
55059	NC_004741	CAT	2	6	3513822	3513827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064694
55060	NC_004741	CAGC	2	8	3513844	3513851	25 %	0 %	25 %	50 %	30064694
55061	NC_004741	CG	3	6	3514027	3514032	0 %	0 %	50 %	50 %	30064694
55062	NC_004741	A	6	6	3514049	3514054	100 %	0 %	0 %	0 %	30064694
55063	NC_004741	CAG	2	6	3514084	3514089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064694
55064	NC_004741	AG	3	6	3514088	3514093	50 %	0 %	50 %	0 %	30064694
55065	NC_004741	AAT	2	6	3514166	3514171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064694
55066	NC_004741	GAT	2	6	3514306	3514311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064694
55067	NC_004741	TCG	2	6	3514376	3514381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064694
55068	NC_004741	CGGCG	2	10	3514382	3514391	0 %	0 %	60 %	40 %	30064694
55069	NC_004741	ACC	2	6	3514421	3514426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064694
55070	NC_004741	CGC	2	6	3514524	3514529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064694
55071	NC_004741	ACG	2	6	3514544	3514549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064694
55072	NC_004741	CTT	2	6	3514551	3514556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064694
55073	NC_004741	T	7	7	3514629	3514635	0 %	100 %	0 %	0 %	30064694
55074	NC_004741	ATA	2	6	3514686	3514691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064694
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55078	NC_004741	CAG	2	6	3514963	3514968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064694
55079	NC_004741	T	6	6	3515023	3515028	0 %	100 %	0 %	0 %	30064694
55080	NC_004741	TTG	2	6	3515087	3515092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064694
55081	NC_004741	CAC	2	6	3515143	3515148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064694
55082	NC_004741	AATG	2	8	3515237	3515244	50 %	25 %	25 %	0 %	30064694
55083	NC_004741	TCA	2	6	3515247	3515252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064694
55084	NC_004741	TG	3	6	3515260	3515265	0 %	50 %	50 %	0 %	30064694
55085	NC_004741	CA	3	6	3515706	3515711	50 %	0 %	0 %	50 %	161486417
55086	NC_004741	CAG	2	6	3515731	3515736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486417
55087	NC_004741	AGC	2	6	3515787	3515792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486417
55088	NC_004741	AGGA	2	8	3515825	3515832	50 %	0 %	50 %	0 %	161486417
55089	NC_004741	CTG	2	6	3515840	3515845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486417
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55096	NC_004741	TGGA	2	8	3516099	3516106	25 %	25 %	50 %	0 %	161486416
55097	NC_004741	GCC	2	6	3516109	3516114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486416
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55100	NC_004741	TCG	2	6	3516191	3516196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486416
55101	NC_004741	GCT	2	6	3516206	3516211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486416
55102	NC_004741	CTG	2	6	3516307	3516312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486416
55103	NC_004741	GAAA	2	8	3516353	3516360	75 %	0 %	25 %	0 %	161486416
55104	NC_004741	CTG	2	6	3516395	3516400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486416
55105	NC_004741	GA	4	8	3516409	3516416	50 %	0 %	50 %	0 %	161486416
55106	NC_004741	CTG	2	6	3516440	3516445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486416
55107	NC_004741	GCACT	2	10	3516456	3516465	20 %	20 %	20 %	40 %	161486416
55108	NC_004741	CGG	2	6	3516479	3516484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486416
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55110	NC_004741	CGT	2	6	3516553	3516558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486416
55111	NC_004741	AGTGG	2	10	3516563	3516572	20 %	20 %	60 %	0 %	161486416
55112	NC_004741	GAA	2	6	3516644	3516649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161486416
55113	NC_004741	CGG	2	6	3516652	3516657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486416
55114	NC_004741	AG	3	6	3516686	3516691	50 %	0 %	50 %	0 %	161486416
55115	NC_004741	GCA	2	6	3516753	3516758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486416
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55238	NC_004741	GC	3	6	3523541	3523546	0 %	0 %	50 %	50 %	30064704
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55243	NC_004741	AATT	2	8	3523765	3523772	50 %	50 %	0 %	0 %	30064704
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