MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52005	NC_004741	CTG	2	6	3325078	3325083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064535
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52008	NC_004741	ATG	2	6	3325263	3325268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064535
52009	NC_004741	TGA	2	6	3325351	3325356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064535
52010	NC_004741	G	6	6	3325361	3325366	0 %	0 %	100 %	0 %	30064535
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52117	NC_004741	CG	3	6	3331173	3331178	0 %	0 %	50 %	50 %	30064543
52118	NC_004741	GCAT	2	8	3331265	3331272	25 %	25 %	25 %	25 %	30064544
52119	NC_004741	GCT	2	6	3331377	3331382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064544
52120	NC_004741	TTGAAG	2	12	3331412	3331423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064544
52121	NC_004741	AGGAAG	2	12	3331436	3331447	50 %	0 %	50 %	0 %	30064544
52122	NC_004741	GCC	2	6	3331453	3331458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064544
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52124	NC_004741	TCA	2	6	3331501	3331506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064544
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52133	NC_004741	GTT	2	6	3332353	3332358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064545
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52136	NC_004741	GTG	2	6	3333151	3333156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064546
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52142	NC_004741	CG	3	6	3333500	3333505	0 %	0 %	50 %	50 %	30064546
52143	NC_004741	CTG	2	6	3333582	3333587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064546
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52149	NC_004741	CGT	2	6	3333990	3333995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064547
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52200	NC_004741	CGA	2	6	3336051	3336056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064547
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52208	NC_004741	TTCA	2	8	3336432	3336439	25 %	50 %	0 %	25 %	30064548
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52211	NC_004741	GGT	2	6	3336530	3336535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064548
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52215	NC_004741	AC	3	6	3336765	3336770	50 %	0 %	0 %	50 %	30064548
52216	NC_004741	GATGC	2	10	3336837	3336846	20 %	20 %	40 %	20 %	30064548
52217	NC_004741	CGGG	2	8	3336951	3336958	0 %	0 %	75 %	25 %	30064548
52218	NC_004741	AC	3	6	3336964	3336969	50 %	0 %	0 %	50 %	30064548
52219	NC_004741	CTG	2	6	3336999	3337004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064548
52220	NC_004741	GCA	2	6	3337016	3337021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064548
52221	NC_004741	TGC	3	9	3337129	3337137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064548
52222	NC_004741	CCA	2	6	3337177	3337182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064548
52223	NC_004741	CCG	2	6	3337219	3337224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064548
52224	NC_004741	ACG	2	6	3337257	3337262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064548
52225	NC_004741	CAC	2	6	3337271	3337276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064548
52226	NC_004741	TGT	2	6	3337983	3337988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486426
52227	NC_004741	GCA	2	6	3338098	3338103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486426
52228	NC_004741	T	6	6	3338174	3338179	0 %	100 %	0 %	0 %	161486426
52229	NC_004741	A	6	6	3338215	3338220	100 %	0 %	0 %	0 %	161486426
52230	NC_004741	CGC	2	6	3338263	3338268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486426
52231	NC_004741	CGC	2	6	3338276	3338281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486426
52232	NC_004741	GAA	3	9	3338288	3338296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161486426
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52466	NC_004741	GAAT	2	8	3351134	3351141	50 %	25 %	25 %	0 %	30064557
52467	NC_004741	GTT	2	6	3351147	3351152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064557
52468	NC_004741	GACT	2	8	3351160	3351167	25 %	25 %	25 %	25 %	30064557
52469	NC_004741	CCA	2	6	3351283	3351288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064557
52470	NC_004741	GAT	2	6	3351330	3351335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064557
52471	NC_004741	GA	3	6	3351353	3351358	50 %	0 %	50 %	0 %	30064557
52472	NC_004741	GTT	2	6	3351375	3351380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064557
52473	NC_004741	ACG	2	6	3351501	3351506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064557
52474	NC_004741	ATC	2	6	3351511	3351516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064557
52475	NC_004741	CTT	2	6	3351527	3351532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064557
52476	NC_004741	CCA	2	6	3351533	3351538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064557
52477	NC_004741	T	6	6	3351549	3351554	0 %	100 %	0 %	0 %	30064557
52478	NC_004741	GCGG	2	8	3351563	3351570	0 %	0 %	75 %	25 %	30064557
52479	NC_004741	GAA	2	6	3351598	3351603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064557
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52481	NC_004741	GTG	2	6	3352127	3352132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064558
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52483	NC_004741	GTGAT	2	10	3352376	3352385	20 %	40 %	40 %	0 %	30064558
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52485	NC_004741	GGA	2	6	3352472	3352477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30064559
52486	NC_004741	TCT	2	6	3352527	3352532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064559
52487	NC_004741	CTG	2	6	3352537	3352542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064559
52488	NC_004741	TGGC	2	8	3352575	3352582	0 %	25 %	50 %	25 %	30064559
52489	NC_004741	AATCTG	2	12	3352657	3352668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	30064559
52490	NC_004741	ACA	2	6	3352671	3352676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30064559
52491	NC_004741	CAA	2	6	3352792	3352797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30064559
52492	NC_004741	ATTA	2	8	3352826	3352833	50 %	50 %	0 %	0 %	30064560
52493	NC_004741	GGT	2	6	3352871	3352876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064560
52494	NC_004741	GCTG	2	8	3352877	3352884	0 %	25 %	50 %	25 %	30064560
52495	NC_004741	TGA	2	6	3352900	3352905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064560
52496	NC_004741	GGT	2	6	3352929	3352934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064560
52497	NC_004741	AGC	2	6	3352953	3352958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064560
52498	NC_004741	TCG	2	6	3352969	3352974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064560
52499	NC_004741	GCC	2	6	3353107	3353112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064560
52500	NC_004741	TCGC	2	8	3353126	3353133	0 %	25 %	25 %	50 %	30064560

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