MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_004741	GCA	2	6	3208804	3208809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064423
50003	NC_004741	GAA	2	6	3208817	3208822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064423
50004	NC_004741	GAA	2	6	3208828	3208833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064423
50005	NC_004741	CG	3	6	3208869	3208874	0 %	0 %	50 %	50 %	30064423
50006	NC_004741	GCGGT	2	10	3208923	3208932	0 %	20 %	60 %	20 %	30064423
50007	NC_004741	CG	3	6	3209063	3209068	0 %	0 %	50 %	50 %	30064423
50008	NC_004741	TCT	2	6	3209070	3209075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064423
50009	NC_004741	GCGT	2	8	3209100	3209107	0 %	25 %	50 %	25 %	30064423
50010	NC_004741	GTG	2	6	3209163	3209168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064423
50011	NC_004741	GGC	2	6	3209174	3209179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064423
50012	NC_004741	GAAC	2	8	3209185	3209192	50 %	0 %	25 %	25 %	30064423
50013	NC_004741	GCC	2	6	3209213	3209218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064423
50014	NC_004741	TGG	2	6	3209286	3209291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064423
50015	NC_004741	TGG	2	6	3209303	3209308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064423
50016	NC_004741	GCG	2	6	3209385	3209390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064423
50017	NC_004741	A	6	6	3209408	3209413	100 %	0 %	0 %	0 %	30064423
50018	NC_004741	AGA	2	6	3209422	3209427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064423
50019	NC_004741	AAC	2	6	3209444	3209449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30064423
50020	NC_004741	GTG	2	6	3209459	3209464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064423
50021	NC_004741	CGT	2	6	3209511	3209516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064423
50022	NC_004741	TGA	2	6	3209530	3209535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064423
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50032	NC_004741	CGG	2	6	3210027	3210032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064423
50033	NC_004741	GGCGCG	2	12	3210069	3210080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064423
50034	NC_004741	TGA	2	6	3210136	3210141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064423
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50040	NC_004741	GCG	2	6	3210333	3210338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064423
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50042	NC_004741	GGA	2	6	3210628	3210633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30064424
50043	NC_004741	GGCT	2	8	3210654	3210661	0 %	25 %	50 %	25 %	30064424
50044	NC_004741	GCG	2	6	3210708	3210713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064424
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50047	NC_004741	GGC	2	6	3210821	3210826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064424
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50050	NC_004741	GCG	2	6	3211092	3211097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064424
50051	NC_004741	AGT	2	6	3211129	3211134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064424
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50053	NC_004741	GGC	3	9	3211208	3211216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064424
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50055	NC_004741	CG	3	6	3211332	3211337	0 %	0 %	50 %	50 %	30064424
50056	NC_004741	ACC	2	6	3211394	3211399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064424
50057	NC_004741	CGA	2	6	3211426	3211431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064424
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50059	NC_004741	GCG	2	6	3211443	3211448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064424
50060	NC_004741	CTG	2	6	3211496	3211501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064424
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50109	NC_004741	CAGT	2	8	3214155	3214162	25 %	25 %	25 %	25 %	30064427
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50113	NC_004741	T	6	6	3214241	3214246	0 %	100 %	0 %	0 %	30064427
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50118	NC_004741	CGG	2	6	3214447	3214452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064427
50119	NC_004741	TCA	2	6	3214479	3214484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064427
50120	NC_004741	CG	3	6	3214507	3214512	0 %	0 %	50 %	50 %	30064427
50121	NC_004741	GC	3	6	3214567	3214572	0 %	0 %	50 %	50 %	30064427
50122	NC_004741	CAT	2	6	3214591	3214596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064427
50123	NC_004741	GTC	2	6	3214628	3214633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064427
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50125	NC_004741	CCT	2	6	3214755	3214760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30064427
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50144	NC_004741	CTCG	2	8	3215991	3215998	0 %	25 %	25 %	50 %	30064429
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50146	NC_004741	AAT	2	6	3216103	3216108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064429
50147	NC_004741	TCG	2	6	3216232	3216237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064430
50148	NC_004741	GCC	2	6	3216240	3216245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064430
50149	NC_004741	CCG	2	6	3216271	3216276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064430
50150	NC_004741	GCC	2	6	3216498	3216503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064430
50151	NC_004741	GC	3	6	3216513	3216518	0 %	0 %	50 %	50 %	30064430
50152	NC_004741	GGT	2	6	3216527	3216532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064430
50153	NC_004741	GCCT	2	8	3216555	3216562	0 %	25 %	25 %	50 %	30064430
50154	NC_004741	TTG	2	6	3216576	3216581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064430
50155	NC_004741	CGG	2	6	3216745	3216750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064430
50156	NC_004741	GCG	2	6	3216805	3216810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064430
50157	NC_004741	GTG	3	9	3216825	3216833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064430
50158	NC_004741	GCA	2	6	3216863	3216868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064430
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50200	NC_004741	TCG	2	6	3219730	3219735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064432
50201	NC_004741	TGC	2	6	3219753	3219758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064432
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50203	NC_004741	CTT	2	6	3219787	3219792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064432
50204	NC_004741	TG	3	6	3219834	3219839	0 %	50 %	50 %	0 %	30064432
50205	NC_004741	CCA	2	6	3219891	3219896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064432
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50207	NC_004741	GCTG	2	8	3219937	3219944	0 %	25 %	50 %	25 %	30064432
50208	NC_004741	GCT	2	6	3219985	3219990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064432
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50210	NC_004741	G	6	6	3220039	3220044	0 %	0 %	100 %	0 %	30064432
50211	NC_004741	TGC	2	6	3220050	3220055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064432
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50214	NC_004741	TAAT	2	8	3220243	3220250	50 %	50 %	0 %	0 %	30064432
50215	NC_004741	ATC	2	6	3220375	3220380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064433
50216	NC_004741	GCC	2	6	3220383	3220388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064433
50217	NC_004741	GAT	2	6	3220526	3220531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064433
50218	NC_004741	GCGT	2	8	3220595	3220602	0 %	25 %	50 %	25 %	30064433
50219	NC_004741	TGGCAC	2	12	3220634	3220645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	30064433
50220	NC_004741	AGA	2	6	3220663	3220668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30064433
50221	NC_004741	A	7	7	3220668	3220674	100 %	0 %	0 %	0 %	30064433
50222	NC_004741	GCT	2	6	3220706	3220711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064433
50223	NC_004741	TGT	2	6	3220743	3220748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064433
50224	NC_004741	GCCA	2	8	3220786	3220793	25 %	0 %	25 %	50 %	30064433
50225	NC_004741	TTC	2	6	3220990	3220995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30064434
50226	NC_004741	T	6	6	3221056	3221061	0 %	100 %	0 %	0 %	30064434
50227	NC_004741	CGC	2	6	3221065	3221070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064434
50228	NC_004741	TGG	2	6	3221082	3221087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064434
50229	NC_004741	GCA	2	6	3221250	3221255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30064434
50230	NC_004741	GTG	2	6	3221315	3221320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30064434
50231	NC_004741	CCGC	2	8	3221324	3221331	0 %	0 %	25 %	75 %	30064434
50232	NC_004741	TCG	2	6	3221432	3221437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064434
50233	NC_004741	GTA	2	6	3221498	3221503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064434
50234	NC_004741	CCG	2	6	3221504	3221509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30064434
50235	NC_004741	ACC	2	6	3221578	3221583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064434
50236	NC_004741	TCA	2	6	3221687	3221692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064434
50237	NC_004741	CTG	2	6	3221695	3221700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064434
50238	NC_004741	ATGAA	2	10	3221711	3221720	60 %	20 %	20 %	0 %	30064434
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50329	NC_004741	TGC	2	6	3226107	3226112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064437
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50335	NC_004741	CCTGAA	2	12	3226823	3226834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	30064438
50336	NC_004741	CAC	2	6	3226860	3226865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064438
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50339	NC_004741	T	6	6	3227049	3227054	0 %	100 %	0 %	0 %	30064438
50340	NC_004741	TAA	2	6	3227070	3227075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30064438
50341	NC_004741	CAA	2	6	3227136	3227141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30064438
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50345	NC_004741	CAA	2	6	3227219	3227224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30064438
50346	NC_004741	AAC	2	6	3227251	3227256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30064438
50347	NC_004741	AC	3	6	3227255	3227260	50 %	0 %	0 %	50 %	30064438
50348	NC_004741	CTGC	2	8	3227290	3227297	0 %	25 %	25 %	50 %	30064438
50349	NC_004741	CT	3	6	3227326	3227331	0 %	50 %	0 %	50 %	30064438
50350	NC_004741	CCA	2	6	3227360	3227365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30064438
50351	NC_004741	CAGC	2	8	3227426	3227433	25 %	0 %	25 %	50 %	30064438
50352	NC_004741	GAT	2	6	3227465	3227470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30064438
50353	NC_004741	TGAA	2	8	3227606	3227613	50 %	25 %	25 %	0 %	30064438
50354	NC_004741	TGT	2	6	3227705	3227710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064438
50355	NC_004741	GTC	2	6	3227766	3227771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064438
50356	NC_004741	TGT	2	6	3227889	3227894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30064438
50357	NC_004741	CTG	2	6	3227922	3227927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064438
50358	NC_004741	ATC	2	6	3227946	3227951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064438
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50360	NC_004741	CAT	2	6	3227982	3227987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30064438
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50384	NC_004741	TGC	2	6	3229758	3229763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30064441
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50393	NC_004741	GGC	2	6	3230196	3230201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064441
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50395	NC_004741	A	6	6	3230248	3230253	100 %	0 %	0 %	0 %	30064441
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50459	NC_004741	A	6	6	3235284	3235289	100 %	0 %	0 %	0 %	30064448
50460	NC_004741	GCG	2	6	3235314	3235319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30064448
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