MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004631	CGG	2	6	140274	140279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140663
2502	NC_004631	GC	3	6	140298	140303	0 %	0 %	50 %	50 %	29140663
2503	NC_004631	CCGCA	2	10	140344	140353	20 %	0 %	20 %	60 %	29140663
2504	NC_004631	GCC	2	6	140411	140416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140663
2505	NC_004631	CAT	2	6	140475	140480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140663
2506	NC_004631	GCG	2	6	140515	140520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140663
2507	NC_004631	GCT	2	6	140572	140577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140663
2508	NC_004631	TGA	2	6	140665	140670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140663
2509	NC_004631	TCG	2	6	140719	140724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140663
2510	NC_004631	G	6	6	141359	141364	0 %	0 %	100 %	0 %	29140664
2511	NC_004631	CATC	2	8	141468	141475	25 %	25 %	0 %	50 %	29140664
2512	NC_004631	CTG	2	6	141484	141489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140664
2513	NC_004631	CCTG	2	8	141498	141505	0 %	25 %	25 %	50 %	29140664
2514	NC_004631	ATT	2	6	141514	141519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140664
2515	NC_004631	GATG	2	8	141606	141613	25 %	25 %	50 %	0 %	29140664
2516	NC_004631	AAG	2	6	141668	141673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140664
2517	NC_004631	CAA	2	6	141693	141698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140664
2518	NC_004631	GAT	2	6	141811	141816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140664
2519	NC_004631	AC	3	6	141829	141834	50 %	0 %	0 %	50 %	29140665
2520	NC_004631	CGG	2	6	141913	141918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140665
2521	NC_004631	CGAT	2	8	141969	141976	25 %	25 %	25 %	25 %	29140665
2522	NC_004631	CAT	2	6	142030	142035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140665
2523	NC_004631	GCTG	2	8	142054	142061	0 %	25 %	50 %	25 %	29140665
2524	NC_004631	TCT	2	6	142124	142129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140665
2525	NC_004631	CG	3	6	142203	142208	0 %	0 %	50 %	50 %	29140665
2526	NC_004631	GCC	2	6	142217	142222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140665
2527	NC_004631	CGG	2	6	142236	142241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140665
2528	NC_004631	AGG	2	6	142242	142247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140665
2529	NC_004631	GAG	2	6	142280	142285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140665
2530	NC_004631	TTG	2	6	142314	142319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140665
2531	NC_004631	GCG	3	9	142373	142381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140665
2532	NC_004631	GGA	2	6	142459	142464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140665
2533	NC_004631	GCTC	2	8	142485	142492	0 %	25 %	25 %	50 %	29140665
2534	NC_004631	GGCG	2	8	142508	142515	0 %	0 %	75 %	25 %	29140665
2535	NC_004631	ATC	2	6	142523	142528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140665
2536	NC_004631	CGG	2	6	142599	142604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140665
2537	NC_004631	A	6	6	142631	142636	100 %	0 %	0 %	0 %	29140665
2538	NC_004631	AGTTC	2	10	142715	142724	20 %	40 %	20 %	20 %	29140665
2539	NC_004631	AG	3	6	142735	142740	50 %	0 %	50 %	0 %	29140665
2540	NC_004631	CAG	2	6	142755	142760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140666
2541	NC_004631	TGCCT	2	10	142815	142824	0 %	40 %	20 %	40 %	29140666
2542	NC_004631	CAT	2	6	142884	142889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140666
2543	NC_004631	CGG	2	6	142895	142900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140666
2544	NC_004631	GGT	2	6	142905	142910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140666
2545	NC_004631	ACG	2	6	142912	142917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140666
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2547	NC_004631	GAA	2	6	143008	143013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140666
2548	NC_004631	GCA	2	6	143070	143075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140666
2549	NC_004631	AGC	2	6	143136	143141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140667
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2551	NC_004631	TCA	2	6	143186	143191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140667
2552	NC_004631	T	7	7	143237	143243	0 %	100 %	0 %	0 %	29140667
2553	NC_004631	CG	3	6	143251	143256	0 %	0 %	50 %	50 %	29140667
2554	NC_004631	ACCG	2	8	143353	143360	25 %	0 %	25 %	50 %	29140667
2555	NC_004631	AAG	2	6	143417	143422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140667
2556	NC_004631	CGG	2	6	143433	143438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140667
2557	NC_004631	TTTA	2	8	143536	143543	25 %	75 %	0 %	0 %	29140667
2558	NC_004631	GC	3	6	143548	143553	0 %	0 %	50 %	50 %	29140667
2559	NC_004631	A	6	6	143584	143589	100 %	0 %	0 %	0 %	29140667
2560	NC_004631	GAA	2	6	143617	143622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140667
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2562	NC_004631	TAC	2	6	143632	143637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140667
2563	NC_004631	GCGA	2	8	143744	143751	25 %	0 %	50 %	25 %	29140667
2564	NC_004631	TCC	2	6	143794	143799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140667
2565	NC_004631	TGA	2	6	143838	143843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140667
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2567	NC_004631	TGGCGA	2	12	143948	143959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29140667
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2570	NC_004631	TGA	2	6	144071	144076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140667
2571	NC_004631	GC	3	6	144163	144168	0 %	0 %	50 %	50 %	29140667
2572	NC_004631	TAG	2	6	144257	144262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140667
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2574	NC_004631	GGT	2	6	144347	144352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140667
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2582	NC_004631	TGG	2	6	144713	144718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140667
2583	NC_004631	TCA	2	6	144722	144727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140667
2584	NC_004631	TAC	2	6	144748	144753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140667
2585	NC_004631	GGC	2	6	144754	144759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140667
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2587	NC_004631	GCG	2	6	144794	144799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140667
2588	NC_004631	A	7	7	144845	144851	100 %	0 %	0 %	0 %	29140667
2589	NC_004631	TAAT	2	8	144860	144867	50 %	50 %	0 %	0 %	29140667
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2591	NC_004631	GTGG	2	8	144919	144926	0 %	25 %	75 %	0 %	29140668
2592	NC_004631	CG	3	6	144937	144942	0 %	0 %	50 %	50 %	29140668
2593	NC_004631	GA	3	6	144951	144956	50 %	0 %	50 %	0 %	29140668
2594	NC_004631	GCG	2	6	144980	144985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140668
2595	NC_004631	GTG	2	6	145004	145009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140668
2596	NC_004631	TCA	2	6	145012	145017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140668
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2599	NC_004631	GTC	2	6	145133	145138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140668
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2601	NC_004631	TGG	2	6	145215	145220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140668
2602	NC_004631	ACC	4	12	145244	145255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140668
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2605	NC_004631	TCT	2	6	145436	145441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140668
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2620	NC_004631	GC	3	6	145997	146002	0 %	0 %	50 %	50 %	29140668
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2624	NC_004631	GAG	2	6	146138	146143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140668
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2994	NC_004631	TC	3	6	165172	165177	0 %	50 %	0 %	50 %	29140684
2995	NC_004631	CGC	2	6	165178	165183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140684
2996	NC_004631	GAG	2	6	165266	165271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140684
2997	NC_004631	CTGC	2	8	165275	165282	0 %	25 %	25 %	50 %	29140684
2998	NC_004631	TAT	2	6	165302	165307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140684
2999	NC_004631	CG	3	6	165314	165319	0 %	0 %	50 %	50 %	29140684
3000	NC_004631	TATT	2	8	165342	165349	25 %	75 %	0 %	0 %	29140684

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