MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_004631	GC	3	6	112562	112567	0 %	0 %	50 %	50 %	29140641
2003	NC_004631	CATC	2	8	112618	112625	25 %	25 %	0 %	50 %	29140641
2004	NC_004631	CAA	2	6	112627	112632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140641
2005	NC_004631	AGT	2	6	112895	112900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140642
2006	NC_004631	GAA	2	6	112926	112931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140642
2007	NC_004631	TTCC	2	8	112932	112939	0 %	50 %	0 %	50 %	29140642
2008	NC_004631	GCG	2	6	112983	112988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140642
2009	NC_004631	CTG	2	6	112990	112995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140642
2010	NC_004631	GAC	2	6	113067	113072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140642
2011	NC_004631	GCG	2	6	113105	113110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140642
2012	NC_004631	CGCC	2	8	113193	113200	0 %	0 %	25 %	75 %	29140642
2013	NC_004631	GCG	2	6	113292	113297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140642
2014	NC_004631	GCTG	2	8	113340	113347	0 %	25 %	50 %	25 %	29140642
2015	NC_004631	T	6	6	113377	113382	0 %	100 %	0 %	0 %	29140642
2016	NC_004631	CCGCG	2	10	113394	113403	0 %	0 %	40 %	60 %	29140642
2017	NC_004631	GC	3	6	113454	113459	0 %	0 %	50 %	50 %	29140642
2018	NC_004631	TGT	2	6	113474	113479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140642
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2021	NC_004631	GC	4	8	113553	113560	0 %	0 %	50 %	50 %	29140642
2022	NC_004631	GAC	2	6	113669	113674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140642
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2024	NC_004631	GGCA	2	8	113822	113829	25 %	0 %	50 %	25 %	29140642
2025	NC_004631	ATCA	2	8	113920	113927	50 %	25 %	0 %	25 %	29140642
2026	NC_004631	GCC	2	6	114016	114021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140642
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2029	NC_004631	CCG	2	6	114119	114124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140642
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2041	NC_004631	CGG	2	6	114889	114894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140642
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2047	NC_004631	GCG	2	6	115107	115112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140642
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2052	NC_004631	GAT	2	6	115222	115227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140642
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2058	NC_004631	CTG	2	6	115833	115838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140643
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2072	NC_004631	ACCA	2	8	116631	116638	50 %	0 %	0 %	50 %	29140644
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2125	NC_004631	AGT	3	9	120151	120159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140647
2126	NC_004631	GCC	2	6	120172	120177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140647
2127	NC_004631	GC	3	6	120211	120216	0 %	0 %	50 %	50 %	29140647
2128	NC_004631	GGCG	2	8	120259	120266	0 %	0 %	75 %	25 %	29140647
2129	NC_004631	GCT	2	6	120277	120282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140647
2130	NC_004631	TCGCCG	2	12	120311	120322	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	29140647
2131	NC_004631	CAC	2	6	120331	120336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140647
2132	NC_004631	ATTTG	2	10	120381	120390	20 %	60 %	20 %	0 %	29140647
2133	NC_004631	GTCA	2	8	120409	120416	25 %	25 %	25 %	25 %	29140647
2134	NC_004631	GAC	2	6	120544	120549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140647
2135	NC_004631	TGC	2	6	120554	120559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140647
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2137	NC_004631	GCC	2	6	120595	120600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140647
2138	NC_004631	GGTTCA	2	12	120612	120623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29140647
2139	NC_004631	GCG	2	6	120656	120661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140647
2140	NC_004631	AGT	2	6	120683	120688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140647
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2143	NC_004631	TGT	2	6	121059	121064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140648
2144	NC_004631	CTG	2	6	121082	121087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2145	NC_004631	GCG	2	6	121091	121096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2146	NC_004631	GGC	2	6	121175	121180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
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2148	NC_004631	GCG	2	6	121224	121229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2149	NC_004631	CGA	2	6	121255	121260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140648
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2152	NC_004631	GC	5	10	121386	121395	0 %	0 %	50 %	50 %	29140648
2153	NC_004631	CAC	2	6	121523	121528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140648
2154	NC_004631	GCT	2	6	121585	121590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2155	NC_004631	CTGG	2	8	121592	121599	0 %	25 %	50 %	25 %	29140648
2156	NC_004631	TGC	2	6	121626	121631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2157	NC_004631	GTT	2	6	121639	121644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140648
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2160	NC_004631	CAC	2	6	121904	121909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140648
2161	NC_004631	CGG	2	6	121969	121974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
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2189	NC_004631	AT	3	6	123253	123258	50 %	50 %	0 %	0 %	29140649
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2230	NC_004631	TGC	2	6	125254	125259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140651
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2233	NC_004631	CAA	2	6	125397	125402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140651
2234	NC_004631	CGC	2	6	125417	125422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140651
2235	NC_004631	CGC	2	6	125447	125452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140651
2236	NC_004631	ATG	2	6	125484	125489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140651
2237	NC_004631	ATCA	2	8	125505	125512	50 %	25 %	0 %	25 %	29140651
2238	NC_004631	AGC	2	6	125567	125572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140652
2239	NC_004631	CTG	2	6	125623	125628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140652
2240	NC_004631	CGA	2	6	125676	125681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140652
2241	NC_004631	CGG	2	6	125904	125909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140652
2242	NC_004631	AAG	2	6	125945	125950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140652
2243	NC_004631	CAG	2	6	126058	126063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140652
2244	NC_004631	CAT	2	6	126064	126069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140652
2245	NC_004631	CAC	2	6	126076	126081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140652
2246	NC_004631	AC	3	6	126080	126085	50 %	0 %	0 %	50 %	29140652
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2248	NC_004631	ACC	2	6	126185	126190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140652
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2493	NC_004631	CGT	2	6	139419	139424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140662
2494	NC_004631	CG	3	6	139433	139438	0 %	0 %	50 %	50 %	29140662
2495	NC_004631	AAAGC	2	10	139811	139820	60 %	0 %	20 %	20 %	29140663
2496	NC_004631	CTG	2	6	140021	140026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140663
2497	NC_004631	CCG	2	6	140123	140128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140663
2498	NC_004631	TCG	2	6	140172	140177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140663
2499	NC_004631	CG	3	6	140186	140191	0 %	0 %	50 %	50 %	29140663
2500	NC_004631	GAT	2	6	140234	140239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140663

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