MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_004631	TCT	2	6	1025813	1025818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141416
18502	NC_004631	GTG	2	6	1025955	1025960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141417
18503	NC_004631	GC	3	6	1025995	1026000	0 %	0 %	50 %	50 %	29141417
18504	NC_004631	TGG	2	6	1026112	1026117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141417
18505	NC_004631	TGG	2	6	1026156	1026161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141417
18506	NC_004631	GCG	2	6	1026174	1026179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141417
18507	NC_004631	GAT	2	6	1026182	1026187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141417
18508	NC_004631	ATT	2	6	1026198	1026203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141417
18509	NC_004631	TCTGC	2	10	1026207	1026216	0 %	40 %	20 %	40 %	29141417
18510	NC_004631	ATGG	2	8	1026221	1026228	25 %	25 %	50 %	0 %	29141417
18511	NC_004631	AGT	2	6	1026246	1026251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141417
18512	NC_004631	TGG	2	6	1026295	1026300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141417
18513	NC_004631	CCA	2	6	1027744	1027749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141420
18514	NC_004631	GAC	2	6	1027750	1027755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141420
18515	NC_004631	ATT	2	6	1027833	1027838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141420
18516	NC_004631	CAA	2	6	1027910	1027915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141420
18517	NC_004631	ATT	2	6	1027941	1027946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141420
18518	NC_004631	A	8	8	1028006	1028013	100 %	0 %	0 %	0 %	29141420
18519	NC_004631	GCA	2	6	1028015	1028020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141420
18520	NC_004631	G	6	6	1028073	1028078	0 %	0 %	100 %	0 %	29141420
18521	NC_004631	AGG	2	6	1028112	1028117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141420
18522	NC_004631	GAC	2	6	1028213	1028218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141420
18523	NC_004631	GGCG	2	8	1028242	1028249	0 %	0 %	75 %	25 %	29141420
18524	NC_004631	CTGG	2	8	1028364	1028371	0 %	25 %	50 %	25 %	29141420
18525	NC_004631	GCTC	2	8	1028428	1028435	0 %	25 %	25 %	50 %	29141420
18526	NC_004631	TAT	2	6	1028492	1028497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141420
18527	NC_004631	CGGG	2	8	1028540	1028547	0 %	0 %	75 %	25 %	29141420
18528	NC_004631	GCG	2	6	1028561	1028566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141420
18529	NC_004631	GCA	2	6	1028577	1028582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141420
18530	NC_004631	CG	3	6	1028588	1028593	0 %	0 %	50 %	50 %	29141420
18531	NC_004631	CTG	2	6	1028808	1028813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141420
18532	NC_004631	GGT	2	6	1028818	1028823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141420
18533	NC_004631	TAC	2	6	1028887	1028892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141420
18534	NC_004631	GCTG	2	8	1029082	1029089	0 %	25 %	50 %	25 %	29141420
18535	NC_004631	TA	3	6	1029113	1029118	50 %	50 %	0 %	0 %	29141420
18536	NC_004631	AACGAG	2	12	1029919	1029930	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29141423
18537	NC_004631	GAT	2	6	1029943	1029948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141423
18538	NC_004631	AATAC	2	10	1029959	1029968	60 %	20 %	0 %	20 %	29141423
18539	NC_004631	G	7	7	1030070	1030076	0 %	0 %	100 %	0 %	29141423
18540	NC_004631	CGTA	2	8	1030082	1030089	25 %	25 %	25 %	25 %	29141423
18541	NC_004631	GCC	2	6	1030159	1030164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141423
18542	NC_004631	TTG	2	6	1030238	1030243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141423
18543	NC_004631	GAA	2	6	1030348	1030353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141423
18544	NC_004631	TGG	2	6	1030441	1030446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141423
18545	NC_004631	ACG	2	6	1030462	1030467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141423
18546	NC_004631	A	6	6	1030537	1030542	100 %	0 %	0 %	0 %	29141423
18547	NC_004631	TGC	2	6	1030552	1030557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141423
18548	NC_004631	CCAGCG	2	12	1030715	1030726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29141424
18549	NC_004631	GCC	2	6	1030734	1030739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141424
18550	NC_004631	AGT	2	6	1030804	1030809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141424
18551	NC_004631	GCG	2	6	1030886	1030891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141424
18552	NC_004631	GCG	2	6	1030938	1030943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141424
18553	NC_004631	AAT	2	6	1030969	1030974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141424
18554	NC_004631	CGCCAG	2	12	1031001	1031012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29141424
18555	NC_004631	GCA	2	6	1031075	1031080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141424
18556	NC_004631	TGGC	2	8	1031098	1031105	0 %	25 %	50 %	25 %	29141424
18557	NC_004631	A	6	6	1031159	1031164	100 %	0 %	0 %	0 %	29141424
18558	NC_004631	CTG	2	6	1031313	1031318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141424
18559	NC_004631	AAG	2	6	1031331	1031336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141424
18560	NC_004631	ATG	2	6	1031374	1031379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141424
18561	NC_004631	CA	4	8	1031442	1031449	50 %	0 %	0 %	50 %	29141424
18562	NC_004631	CCACC	2	10	1031450	1031459	20 %	0 %	0 %	80 %	29141424
18563	NC_004631	CAA	2	6	1031462	1031467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141424
18564	NC_004631	CAG	2	6	1031475	1031480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141424
18565	NC_004631	TTA	2	6	1031518	1031523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141424
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18567	NC_004631	CAT	2	6	1031589	1031594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141424
18568	NC_004631	AGCCC	2	10	1031648	1031657	20 %	0 %	20 %	60 %	29141424
18569	NC_004631	CCG	2	6	1031663	1031668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141424
18570	NC_004631	TAG	2	6	1031694	1031699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141424
18571	NC_004631	CAA	2	6	1031733	1031738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141424
18572	NC_004631	GTG	2	6	1031806	1031811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141424
18573	NC_004631	ATG	2	6	1032112	1032117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141425
18574	NC_004631	GGC	2	6	1032156	1032161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141425
18575	NC_004631	GC	3	6	1032169	1032174	0 %	0 %	50 %	50 %	29141425
18576	NC_004631	CGG	3	9	1032221	1032229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141425
18577	NC_004631	GGC	2	6	1032246	1032251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141425
18578	NC_004631	GAAAG	2	10	1032252	1032261	60 %	0 %	40 %	0 %	29141425
18579	NC_004631	GGA	2	6	1032273	1032278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141425
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18584	NC_004631	CTGG	2	8	1032526	1032533	0 %	25 %	50 %	25 %	29141426
18585	NC_004631	T	6	6	1032561	1032566	0 %	100 %	0 %	0 %	29141426
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18587	NC_004631	GCT	2	6	1032576	1032581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141426
18588	NC_004631	CG	3	6	1032595	1032600	0 %	0 %	50 %	50 %	29141426
18589	NC_004631	GAA	2	6	1032638	1032643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141426
18590	NC_004631	TCT	2	6	1032713	1032718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141426
18591	NC_004631	CGA	2	6	1032728	1032733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141426
18592	NC_004631	TTG	2	6	1032784	1032789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141426
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18594	NC_004631	TAA	3	9	1033102	1033110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141427
18595	NC_004631	AAACG	2	10	1033221	1033230	60 %	0 %	20 %	20 %	29141427
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18597	NC_004631	A	6	6	1033305	1033310	100 %	0 %	0 %	0 %	29141427
18598	NC_004631	GGCT	2	8	1033352	1033359	0 %	25 %	50 %	25 %	29141427
18599	NC_004631	ACG	2	6	1033786	1033791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141428
18600	NC_004631	CTT	2	6	1033850	1033855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141428
18601	NC_004631	CTG	3	9	1033884	1033892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141428
18602	NC_004631	CAT	2	6	1033931	1033936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141428
18603	NC_004631	TCC	2	6	1033993	1033998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141428
18604	NC_004631	TTC	2	6	1034016	1034021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141428
18605	NC_004631	AG	3	6	1034023	1034028	50 %	0 %	50 %	0 %	29141428
18606	NC_004631	CAT	2	6	1034106	1034111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141428
18607	NC_004631	GAA	2	6	1034141	1034146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141428
18608	NC_004631	GAA	2	6	1034856	1034861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141429
18609	NC_004631	GGT	2	6	1034942	1034947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141429
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18611	NC_004631	TGC	2	6	1035022	1035027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141429
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18616	NC_004631	AATT	2	8	1035109	1035116	50 %	50 %	0 %	0 %	29141429
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18618	NC_004631	CGT	2	6	1035174	1035179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141429
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18971	NC_004631	GCA	2	6	1052755	1052760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141446
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