MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_004631	GAC	2	6	998734	998739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141388
18002	NC_004631	GGT	2	6	998755	998760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141388
18003	NC_004631	TGA	2	6	998871	998876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141388
18004	NC_004631	CGC	2	6	998934	998939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141388
18005	NC_004631	TAA	2	6	998958	998963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141388
18006	NC_004631	ACC	2	6	998984	998989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141388
18007	NC_004631	TCAGGT	2	12	999021	999032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29141388
18008	NC_004631	GCG	2	6	999109	999114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141388
18009	NC_004631	CAG	2	6	999115	999120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141388
18010	NC_004631	AAT	2	6	999125	999130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141388
18011	NC_004631	TAA	2	6	999162	999167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141388
18012	NC_004631	CACG	2	8	999189	999196	25 %	0 %	25 %	50 %	29141388
18013	NC_004631	ATCGCT	2	12	999232	999243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29141388
18014	NC_004631	GAC	2	6	999374	999379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141389
18015	NC_004631	GCG	2	6	999403	999408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141389
18016	NC_004631	GGC	2	6	999428	999433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141389
18017	NC_004631	TTTG	2	8	999442	999449	0 %	75 %	25 %	0 %	29141389
18018	NC_004631	CGG	2	6	999469	999474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141389
18019	NC_004631	AAC	2	6	999492	999497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141389
18020	NC_004631	GC	3	6	999540	999545	0 %	0 %	50 %	50 %	29141389
18021	NC_004631	ACA	2	6	999583	999588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141389
18022	NC_004631	A	6	6	999632	999637	100 %	0 %	0 %	0 %	29141389
18023	NC_004631	GCGG	2	8	999645	999652	0 %	0 %	75 %	25 %	29141389
18024	NC_004631	TGC	3	9	999687	999695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141389
18025	NC_004631	GGC	2	6	999728	999733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141389
18026	NC_004631	AGTC	2	8	999796	999803	25 %	25 %	25 %	25 %	29141389
18027	NC_004631	CG	4	8	999939	999946	0 %	0 %	50 %	50 %	29141390
18028	NC_004631	ATC	2	6	999982	999987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141390
18029	NC_004631	TG	3	6	1000006	1000011	0 %	50 %	50 %	0 %	29141390
18030	NC_004631	TGT	2	6	1000028	1000033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141390
18031	NC_004631	CTG	3	9	1000045	1000053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141390
18032	NC_004631	TAC	2	6	1000077	1000082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141390
18033	NC_004631	GGC	2	6	1000135	1000140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141390
18034	NC_004631	GCGCG	2	10	1000146	1000155	0 %	0 %	60 %	40 %	29141390
18035	NC_004631	GCG	2	6	1000167	1000172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141390
18036	NC_004631	GC	3	6	1000257	1000262	0 %	0 %	50 %	50 %	29141390
18037	NC_004631	CTG	2	6	1000294	1000299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141390
18038	NC_004631	TTG	2	6	1000309	1000314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141390
18039	NC_004631	GC	3	6	1000335	1000340	0 %	0 %	50 %	50 %	29141390
18040	NC_004631	GCGGTT	2	12	1000368	1000379	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	29141390
18041	NC_004631	GCT	2	6	1000390	1000395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141390
18042	NC_004631	TCCACC	2	12	1000442	1000453	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	29141390
18043	NC_004631	CGG	2	6	1000473	1000478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141390
18044	NC_004631	ACC	2	6	1000484	1000489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141390
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18046	NC_004631	TCG	2	6	1000520	1000525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141390
18047	NC_004631	GC	4	8	1000529	1000536	0 %	0 %	50 %	50 %	29141390
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18050	NC_004631	CGC	2	6	1000617	1000622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141390
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18052	NC_004631	TCA	2	6	1000760	1000765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141390
18053	NC_004631	TGC	2	6	1000766	1000771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141390
18054	NC_004631	TGC	2	6	1000835	1000840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141390
18055	NC_004631	CAG	2	6	1000891	1000896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141390
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18057	NC_004631	GCC	2	6	1000967	1000972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141390
18058	NC_004631	CGCC	2	8	1001031	1001038	0 %	0 %	25 %	75 %	29141390
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18061	NC_004631	TGC	2	6	1001154	1001159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141391
18062	NC_004631	CATC	2	8	1001174	1001181	25 %	25 %	0 %	50 %	29141391
18063	NC_004631	GCT	2	6	1001261	1001266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141391
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18085	NC_004631	GT	3	6	1002374	1002379	0 %	50 %	50 %	0 %	29141392
18086	NC_004631	GC	3	6	1002381	1002386	0 %	0 %	50 %	50 %	29141392
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18092	NC_004631	GGGCC	2	10	1002626	1002635	0 %	0 %	60 %	40 %	29141392
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18119	NC_004631	CTG	2	6	1004037	1004042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141394
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18353	NC_004631	AAT	2	6	1018011	1018016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141407
18354	NC_004631	CAG	2	6	1018059	1018064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141407
18355	NC_004631	CAGA	2	8	1018073	1018080	50 %	0 %	25 %	25 %	29141407
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18357	NC_004631	A	6	6	1018114	1018119	100 %	0 %	0 %	0 %	29141407
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18365	NC_004631	A	6	6	1018661	1018666	100 %	0 %	0 %	0 %	29141408
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18384	NC_004631	GGT	3	9	1019779	1019787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141409
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18459	NC_004631	TTCG	2	8	1023693	1023700	0 %	50 %	25 %	25 %	29141415
18460	NC_004631	TCAG	2	8	1023753	1023760	25 %	25 %	25 %	25 %	29141415
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18463	NC_004631	AGTG	2	8	1024002	1024009	25 %	25 %	50 %	0 %	29141415
18464	NC_004631	GTAT	2	8	1024067	1024074	25 %	50 %	25 %	0 %	29141416
18465	NC_004631	CGG	2	6	1024080	1024085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141416
18466	NC_004631	GCA	2	6	1024145	1024150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18467	NC_004631	GCT	3	9	1024233	1024241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18468	NC_004631	GTT	2	6	1024284	1024289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141416
18469	NC_004631	TGA	2	6	1024293	1024298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141416
18470	NC_004631	ATCCT	2	10	1024302	1024311	20 %	40 %	0 %	40 %	29141416
18471	NC_004631	GCG	2	6	1024325	1024330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141416
18472	NC_004631	GCT	2	6	1024520	1024525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18473	NC_004631	GAG	3	9	1024555	1024563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141416
18474	NC_004631	GTT	2	6	1024590	1024595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141416
18475	NC_004631	GAC	2	6	1024609	1024614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18476	NC_004631	GCCA	2	8	1024651	1024658	25 %	0 %	25 %	50 %	29141416
18477	NC_004631	GGC	2	6	1024677	1024682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141416
18478	NC_004631	CGA	2	6	1024749	1024754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18479	NC_004631	TG	3	6	1024795	1024800	0 %	50 %	50 %	0 %	29141416
18480	NC_004631	TGT	2	6	1024805	1024810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141416
18481	NC_004631	GTG	2	6	1024885	1024890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141416
18482	NC_004631	TAC	2	6	1024952	1024957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141416
18483	NC_004631	GCT	2	6	1024983	1024988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18484	NC_004631	CG	3	6	1025042	1025047	0 %	0 %	50 %	50 %	29141416
18485	NC_004631	GCA	2	6	1025115	1025120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18486	NC_004631	CCA	2	6	1025123	1025128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141416
18487	NC_004631	TG	3	6	1025236	1025241	0 %	50 %	50 %	0 %	29141416
18488	NC_004631	TCG	2	6	1025277	1025282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18489	NC_004631	TGA	2	6	1025310	1025315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141416
18490	NC_004631	AGA	2	6	1025364	1025369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141416
18491	NC_004631	CGG	2	6	1025400	1025405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141416
18492	NC_004631	TGC	2	6	1025477	1025482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18493	NC_004631	T	6	6	1025530	1025535	0 %	100 %	0 %	0 %	29141416
18494	NC_004631	GCC	2	6	1025562	1025567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141416
18495	NC_004631	CGG	2	6	1025628	1025633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141416
18496	NC_004631	A	6	6	1025641	1025646	100 %	0 %	0 %	0 %	29141416
18497	NC_004631	CG	3	6	1025647	1025652	0 %	0 %	50 %	50 %	29141416
18498	NC_004631	TGC	2	6	1025714	1025719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141416
18499	NC_004631	AT	3	6	1025724	1025729	50 %	50 %	0 %	0 %	29141416
18500	NC_004631	AGA	2	6	1025763	1025768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141416

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