MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004631	ATA	2	6	880862	880867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141287
16002	NC_004631	TTGG	2	8	880887	880894	0 %	50 %	50 %	0 %	29141287
16003	NC_004631	AAAT	2	8	880903	880910	75 %	25 %	0 %	0 %	29141287
16004	NC_004631	ATTA	2	8	880920	880927	50 %	50 %	0 %	0 %	29141288
16005	NC_004631	AGC	2	6	880979	880984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141288
16006	NC_004631	TA	3	6	880989	880994	50 %	50 %	0 %	0 %	29141288
16007	NC_004631	AT	3	6	881066	881071	50 %	50 %	0 %	0 %	29141288
16008	NC_004631	GGA	2	6	881107	881112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141288
16009	NC_004631	TAT	2	6	881215	881220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141288
16010	NC_004631	AGC	2	6	881238	881243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141288
16011	NC_004631	TGC	2	6	881391	881396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141288
16012	NC_004631	CCGTT	2	10	881403	881412	0 %	40 %	20 %	40 %	29141288
16013	NC_004631	GGC	2	6	881469	881474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141288
16014	NC_004631	GAT	2	6	881478	881483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141288
16015	NC_004631	GGT	2	6	881520	881525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141288
16016	NC_004631	AGA	2	6	881553	881558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141288
16017	NC_004631	GGA	2	6	881632	881637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141288
16018	NC_004631	TTA	2	6	881710	881715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141288
16019	NC_004631	AAT	2	6	881815	881820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141288
16020	NC_004631	TTC	2	6	881829	881834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141288
16021	NC_004631	ATAAA	2	10	881845	881854	80 %	20 %	0 %	0 %	29141288
16022	NC_004631	TTC	2	6	881861	881866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141289
16023	NC_004631	TGGC	2	8	881876	881883	0 %	25 %	50 %	25 %	29141289
16024	NC_004631	ATC	2	6	881921	881926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141289
16025	NC_004631	TGC	2	6	881963	881968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141289
16026	NC_004631	AGA	2	6	882003	882008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141289
16027	NC_004631	GACA	2	8	882028	882035	50 %	0 %	25 %	25 %	29141289
16028	NC_004631	AAC	2	6	882053	882058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141289
16029	NC_004631	ATA	2	6	882083	882088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141289
16030	NC_004631	TTG	2	6	882181	882186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141289
16031	NC_004631	TGC	2	6	882192	882197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141289
16032	NC_004631	GAA	2	6	882250	882255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141289
16033	NC_004631	CGC	2	6	882258	882263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141289
16034	NC_004631	AT	3	6	882321	882326	50 %	50 %	0 %	0 %	29141289
16035	NC_004631	TCG	2	6	882327	882332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141289
16036	NC_004631	AGA	2	6	882570	882575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141289
16037	NC_004631	CA	4	8	882622	882629	50 %	0 %	0 %	50 %	29141289
16038	NC_004631	GTG	2	6	882637	882642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141289
16039	NC_004631	GCTG	2	8	882655	882662	0 %	25 %	50 %	25 %	29141289
16040	NC_004631	AT	3	6	882695	882700	50 %	50 %	0 %	0 %	29141289
16041	NC_004631	ATC	2	6	882710	882715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141289
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16043	NC_004631	TGG	2	6	882845	882850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141289
16044	NC_004631	TAA	2	6	882852	882857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141289
16045	NC_004631	A	7	7	882877	882883	100 %	0 %	0 %	0 %	29141289
16046	NC_004631	ATT	2	6	882890	882895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141289
16047	NC_004631	ACA	2	6	882924	882929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141289
16048	NC_004631	AAG	2	6	882932	882937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141289
16049	NC_004631	TGAT	2	8	882965	882972	25 %	50 %	25 %	0 %	29141289
16050	NC_004631	CAC	2	6	883042	883047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141289
16051	NC_004631	TAT	2	6	883067	883072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141289
16052	NC_004631	TCC	2	6	883140	883145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141289
16053	NC_004631	GAT	2	6	883228	883233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141289
16054	NC_004631	ATT	2	6	883234	883239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141289
16055	NC_004631	AAC	2	6	883247	883252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141289
16056	NC_004631	TAA	2	6	883291	883296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141289
16057	NC_004631	ATTC	2	8	883310	883317	25 %	50 %	0 %	25 %	29141290
16058	NC_004631	TGC	2	6	883384	883389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141290
16059	NC_004631	TTG	2	6	883404	883409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141290
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16061	NC_004631	TGC	3	9	883495	883503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141290
16062	NC_004631	T	6	6	883530	883535	0 %	100 %	0 %	0 %	29141290
16063	NC_004631	ATG	2	6	883674	883679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141290
16064	NC_004631	GCT	2	6	883751	883756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141290
16065	NC_004631	TA	3	6	883763	883768	50 %	50 %	0 %	0 %	29141290
16066	NC_004631	TTTA	2	8	883864	883871	25 %	75 %	0 %	0 %	29141290
16067	NC_004631	TGA	2	6	884041	884046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141290
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16069	NC_004631	TAT	2	6	884082	884087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141290
16070	NC_004631	TCT	2	6	884147	884152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141290
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16072	NC_004631	T	6	6	884269	884274	0 %	100 %	0 %	0 %	29141290
16073	NC_004631	AAT	2	6	884347	884352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141290
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16075	NC_004631	GC	3	6	884596	884601	0 %	0 %	50 %	50 %	29141290
16076	NC_004631	GCT	2	6	884625	884630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141290
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16082	NC_004631	GATTT	2	10	884845	884854	20 %	60 %	20 %	0 %	29141291
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16088	NC_004631	ATTTG	2	10	885081	885090	20 %	60 %	20 %	0 %	29141291
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16093	NC_004631	ATC	2	6	885232	885237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141291
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16098	NC_004631	AAAT	2	8	885344	885351	75 %	25 %	0 %	0 %	29141291
16099	NC_004631	CAT	2	6	885481	885486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141291
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16101	NC_004631	GTTAT	2	10	885568	885577	20 %	60 %	20 %	0 %	29141291
16102	NC_004631	GTC	2	6	885606	885611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141291
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16107	NC_004631	TGA	2	6	885927	885932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141291
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16110	NC_004631	AGTG	2	8	886074	886081	25 %	25 %	50 %	0 %	29141291
16111	NC_004631	ATG	2	6	886088	886093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141291
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16245	NC_004631	CAG	2	6	892837	892842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141298
16246	NC_004631	TTAA	2	8	892886	892893	50 %	50 %	0 %	0 %	29141298
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16249	NC_004631	CGG	2	6	893028	893033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141298
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