MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004631	TGAT	2	8	828022	828029	25 %	50 %	25 %	0 %	29141247
15002	NC_004631	GCT	2	6	828047	828052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15003	NC_004631	GCC	2	6	828084	828089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15004	NC_004631	GCC	2	6	828121	828126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15005	NC_004631	TAT	2	6	828146	828151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141247
15006	NC_004631	ACG	2	6	828160	828165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15007	NC_004631	GCT	2	6	828321	828326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15008	NC_004631	AG	3	6	828333	828338	50 %	0 %	50 %	0 %	29141247
15009	NC_004631	CGT	2	6	828399	828404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15010	NC_004631	TGCG	2	8	828427	828434	0 %	25 %	50 %	25 %	29141247
15011	NC_004631	TCG	2	6	828497	828502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15012	NC_004631	CGG	2	6	828506	828511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141247
15013	NC_004631	CTG	2	6	828531	828536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15014	NC_004631	TCA	2	6	828544	828549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141247
15015	NC_004631	GC	4	8	828582	828589	0 %	0 %	50 %	50 %	29141247
15016	NC_004631	CAA	2	6	828620	828625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141247
15017	NC_004631	GTC	2	6	828628	828633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15018	NC_004631	CCG	2	6	828644	828649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15019	NC_004631	TCCGC	2	10	828662	828671	0 %	20 %	20 %	60 %	29141247
15020	NC_004631	GAT	3	9	828706	828714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141247
15021	NC_004631	ATGG	2	8	828839	828846	25 %	25 %	50 %	0 %	29141247
15022	NC_004631	CG	3	6	828958	828963	0 %	0 %	50 %	50 %	29141247
15023	NC_004631	CAT	2	6	828966	828971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141247
15024	NC_004631	GAC	2	6	828990	828995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15025	NC_004631	CAA	2	6	829052	829057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141247
15026	NC_004631	AAT	2	6	829113	829118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141247
15027	NC_004631	GCC	3	9	829150	829158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15028	NC_004631	CAC	2	6	829203	829208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141247
15029	NC_004631	CCA	2	6	829220	829225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141247
15030	NC_004631	TTA	2	6	829264	829269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141247
15031	NC_004631	AAT	2	6	829338	829343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141247
15032	NC_004631	AGAT	2	8	829369	829376	50 %	25 %	25 %	0 %	29141247
15033	NC_004631	GAC	2	6	829383	829388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15034	NC_004631	TGG	2	6	829445	829450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141247
15035	NC_004631	GCA	2	6	829508	829513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15036	NC_004631	TCA	2	6	829571	829576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141247
15037	NC_004631	GC	3	6	829664	829669	0 %	0 %	50 %	50 %	29141247
15038	NC_004631	GAT	2	6	829683	829688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141247
15039	NC_004631	TCG	2	6	829702	829707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15040	NC_004631	GCG	2	6	829834	829839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141247
15041	NC_004631	CCG	2	6	829882	829887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15042	NC_004631	TCT	2	6	829925	829930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141247
15043	NC_004631	CGG	2	6	830007	830012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141247
15044	NC_004631	CCG	2	6	830015	830020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15045	NC_004631	CGG	2	6	830040	830045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141247
15046	NC_004631	TGG	2	6	830072	830077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141247
15047	NC_004631	CGC	2	6	830088	830093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15048	NC_004631	CAC	2	6	830148	830153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141247
15049	NC_004631	GCC	2	6	830160	830165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15050	NC_004631	CGA	2	6	830175	830180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15051	NC_004631	GCG	2	6	830222	830227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141247
15052	NC_004631	GGA	2	6	830235	830240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141247
15053	NC_004631	ACC	2	6	830278	830283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141247
15054	NC_004631	GCG	2	6	830314	830319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141247
15055	NC_004631	CGC	2	6	830361	830366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15056	NC_004631	CAG	2	6	830370	830375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15057	NC_004631	GTG	2	6	830377	830382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141247
15058	NC_004631	GCC	2	6	830415	830420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141247
15059	NC_004631	TGC	2	6	830423	830428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141247
15060	NC_004631	GC	4	8	830451	830458	0 %	0 %	50 %	50 %	29141248
15061	NC_004631	TGG	2	6	830503	830508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141248
15062	NC_004631	ACG	2	6	830568	830573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15063	NC_004631	CAC	2	6	830603	830608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141248
15064	NC_004631	CTT	2	6	830642	830647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141248
15065	NC_004631	TCG	2	6	830661	830666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15066	NC_004631	CA	3	6	830676	830681	50 %	0 %	0 %	50 %	29141248
15067	NC_004631	CCG	2	6	830707	830712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141248
15068	NC_004631	GGCA	2	8	830714	830721	25 %	0 %	50 %	25 %	29141248
15069	NC_004631	ATTG	2	8	830770	830777	25 %	50 %	25 %	0 %	29141248
15070	NC_004631	GC	3	6	830807	830812	0 %	0 %	50 %	50 %	29141248
15071	NC_004631	CGT	2	6	830831	830836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15072	NC_004631	AGTT	2	8	830890	830897	25 %	50 %	25 %	0 %	29141248
15073	NC_004631	GAC	2	6	831011	831016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15074	NC_004631	GCT	2	6	831032	831037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15075	NC_004631	GC	3	6	831124	831129	0 %	0 %	50 %	50 %	29141248
15076	NC_004631	GC	3	6	831242	831247	0 %	0 %	50 %	50 %	29141248
15077	NC_004631	ACG	2	6	831254	831259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15078	NC_004631	CTGG	2	8	831326	831333	0 %	25 %	50 %	25 %	29141248
15079	NC_004631	CAG	2	6	831347	831352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15080	NC_004631	CTG	2	6	831368	831373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15081	NC_004631	TG	3	6	831483	831488	0 %	50 %	50 %	0 %	29141248
15082	NC_004631	GTCGCG	2	12	831489	831500	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29141248
15083	NC_004631	GCG	3	9	831546	831554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141248
15084	NC_004631	TGC	2	6	831558	831563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141248
15085	NC_004631	GCG	2	6	831570	831575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141248
15086	NC_004631	CGGCG	2	10	831581	831590	0 %	0 %	60 %	40 %	29141248
15087	NC_004631	CCAGAA	2	12	831614	831625	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	29141248
15088	NC_004631	GCG	3	9	831627	831635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141248
15089	NC_004631	GC	3	6	832153	832158	0 %	0 %	50 %	50 %	29141249
15090	NC_004631	ATC	2	6	832183	832188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141249
15091	NC_004631	GCC	2	6	832189	832194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141249
15092	NC_004631	T	6	6	832231	832236	0 %	100 %	0 %	0 %	29141249
15093	NC_004631	GCC	2	6	832258	832263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141249
15094	NC_004631	AGAT	2	8	832268	832275	50 %	25 %	25 %	0 %	29141249
15095	NC_004631	GC	3	6	832293	832298	0 %	0 %	50 %	50 %	29141249
15096	NC_004631	GCTG	2	8	832368	832375	0 %	25 %	50 %	25 %	29141249
15097	NC_004631	GTC	2	6	832390	832395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141249
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15099	NC_004631	AGC	2	6	832505	832510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141249
15100	NC_004631	CG	3	6	832532	832537	0 %	0 %	50 %	50 %	29141249
15101	NC_004631	GAC	2	6	832560	832565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141249
15102	NC_004631	CGT	2	6	832602	832607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141249
15103	NC_004631	CCA	2	6	832624	832629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141249
15104	NC_004631	GCA	2	6	832632	832637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141249
15105	NC_004631	CGC	2	6	832665	832670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141249
15106	NC_004631	GC	3	6	832775	832780	0 %	0 %	50 %	50 %	29141249
15107	NC_004631	CAG	2	6	832801	832806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141249
15108	NC_004631	GGT	2	6	832819	832824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141249
15109	NC_004631	CCG	2	6	832826	832831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141249
15110	NC_004631	ACC	2	6	832916	832921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141249
15111	NC_004631	TGC	2	6	832942	832947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141249
15112	NC_004631	CGC	2	6	832986	832991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141249
15113	NC_004631	GAA	2	6	833067	833072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141249
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15116	NC_004631	GC	3	6	833232	833237	0 %	0 %	50 %	50 %	29141249
15117	NC_004631	GCG	2	6	833275	833280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141249
15118	NC_004631	AGC	2	6	833282	833287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141249
15119	NC_004631	TTC	2	6	833296	833301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141249
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15121	NC_004631	CG	3	6	833352	833357	0 %	0 %	50 %	50 %	29141249
15122	NC_004631	CA	3	6	833364	833369	50 %	0 %	0 %	50 %	29141249
15123	NC_004631	CCGTA	2	10	833454	833463	20 %	20 %	20 %	40 %	29141249
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15126	NC_004631	GC	3	6	833720	833725	0 %	0 %	50 %	50 %	29141250
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15151	NC_004631	TGAG	2	8	835099	835106	25 %	25 %	50 %	0 %	29141251
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15231	NC_004631	TCGCG	2	10	840095	840104	0 %	20 %	40 %	40 %	29141254
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15236	NC_004631	GGAAA	2	10	840467	840476	60 %	0 %	40 %	0 %	29141254
15237	NC_004631	GAAT	2	8	840512	840519	50 %	25 %	25 %	0 %	29141254
15238	NC_004631	GCA	2	6	840534	840539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
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15241	NC_004631	CGA	2	6	840654	840659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
15242	NC_004631	TCT	2	6	840673	840678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141254
15243	NC_004631	GGC	2	6	840757	840762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141254
15244	NC_004631	GAA	2	6	840957	840962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141254
15245	NC_004631	GCT	2	6	840963	840968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141254
15246	NC_004631	AAT	2	6	841156	841161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141255
15247	NC_004631	AAT	2	6	841215	841220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141255
15248	NC_004631	TCC	2	6	841281	841286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141255
15249	NC_004631	TTC	2	6	841326	841331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141255
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15251	NC_004631	GCAG	2	8	841488	841495	25 %	0 %	50 %	25 %	29141255
15252	NC_004631	CGC	2	6	841558	841563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141255
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15258	NC_004631	GTC	2	6	841811	841816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141255
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15262	NC_004631	CGG	3	9	841938	841946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141255
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15264	NC_004631	ATC	2	6	841977	841982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141255
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15275	NC_004631	CGTT	2	8	842325	842332	0 %	50 %	25 %	25 %	29141255
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15282	NC_004631	CGG	2	6	842528	842533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141255
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15292	NC_004631	CGT	2	6	843956	843961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141256
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15317	NC_004631	GCCA	2	8	845438	845445	25 %	0 %	25 %	50 %	29141258
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15334	NC_004631	CTG	2	6	846394	846399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141258
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15360	NC_004631	CAG	2	6	847302	847307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141259
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15362	NC_004631	GAG	2	6	847323	847328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141259
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15364	NC_004631	TGA	3	9	847436	847444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141259
15365	NC_004631	TG	3	6	847532	847537	0 %	50 %	50 %	0 %	29141259
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15482	NC_004631	CGC	2	6	854188	854193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141265
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15484	NC_004631	CGC	2	6	854361	854366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409994466
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15487	NC_004631	GCGT	2	8	854549	854556	0 %	25 %	50 %	25 %	409994466
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