MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004631	AGGA	2	8	801423	801430	50 %	0 %	50 %	0 %	29141219
14502	NC_004631	AGA	3	9	801433	801441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141219
14503	NC_004631	GCA	2	6	801463	801468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141219
14504	NC_004631	GGC	2	6	801525	801530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141219
14505	NC_004631	CAGA	2	8	801539	801546	50 %	0 %	25 %	25 %	29141219
14506	NC_004631	GCG	2	6	801576	801581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141219
14507	NC_004631	TGG	2	6	801601	801606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141219
14508	NC_004631	AGC	2	6	801789	801794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141219
14509	NC_004631	GGT	2	6	801812	801817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141219
14510	NC_004631	A	6	6	801888	801893	100 %	0 %	0 %	0 %	29141219
14511	NC_004631	CGGT	2	8	801894	801901	0 %	25 %	50 %	25 %	29141219
14512	NC_004631	CGC	2	6	801932	801937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141219
14513	NC_004631	CGG	2	6	801973	801978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141219
14514	NC_004631	TAGCCA	2	12	801995	802006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29141219
14515	NC_004631	CAT	2	6	802049	802054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141219
14516	NC_004631	TTCC	2	8	802402	802409	0 %	50 %	0 %	50 %	29141220
14517	NC_004631	TGA	2	6	802450	802455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141220
14518	NC_004631	AAT	2	6	802461	802466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141220
14519	NC_004631	CCA	2	6	802470	802475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141220
14520	NC_004631	ATA	2	6	802504	802509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141220
14521	NC_004631	CCG	2	6	802573	802578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141220
14522	NC_004631	CTT	2	6	802582	802587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141220
14523	NC_004631	A	6	6	802616	802621	100 %	0 %	0 %	0 %	29141220
14524	NC_004631	TTG	2	6	802624	802629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141220
14525	NC_004631	CTAC	2	8	802666	802673	25 %	25 %	0 %	50 %	29141220
14526	NC_004631	CGA	2	6	802831	802836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141220
14527	NC_004631	TTCGG	2	10	802842	802851	0 %	40 %	40 %	20 %	29141220
14528	NC_004631	CCG	2	6	802882	802887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141220
14529	NC_004631	TTC	2	6	802946	802951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141220
14530	NC_004631	A	6	6	802956	802961	100 %	0 %	0 %	0 %	29141220
14531	NC_004631	CTGAC	2	10	802987	802996	20 %	20 %	20 %	40 %	29141220
14532	NC_004631	AAT	2	6	803061	803066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141220
14533	NC_004631	CGA	2	6	803099	803104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141220
14534	NC_004631	GATT	2	8	803138	803145	25 %	50 %	25 %	0 %	29141220
14535	NC_004631	CGG	2	6	803201	803206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141220
14536	NC_004631	CGG	2	6	803213	803218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141220
14537	NC_004631	CAA	2	6	803258	803263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141220
14538	NC_004631	CTG	2	6	804462	804467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141221
14539	NC_004631	AG	3	6	804511	804516	50 %	0 %	50 %	0 %	29141221
14540	NC_004631	C	6	6	804945	804950	0 %	0 %	0 %	100 %	29141222
14541	NC_004631	TGA	2	6	804963	804968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141222
14542	NC_004631	AGT	2	6	805102	805107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141222
14543	NC_004631	TGC	2	6	805110	805115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141222
14544	NC_004631	TAC	2	6	805119	805124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141222
14545	NC_004631	G	6	6	805158	805163	0 %	0 %	100 %	0 %	29141222
14546	NC_004631	ATG	2	6	805171	805176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141222
14547	NC_004631	TTA	2	6	805382	805387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141223
14548	NC_004631	TAT	2	6	805453	805458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141223
14549	NC_004631	TA	3	6	805502	805507	50 %	50 %	0 %	0 %	29141223
14550	NC_004631	ATA	3	9	805539	805547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141223
14551	NC_004631	AAT	2	6	805592	805597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141223
14552	NC_004631	ATA	2	6	805617	805622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141223
14553	NC_004631	ATT	2	6	805633	805638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141223
14554	NC_004631	GGT	2	6	805699	805704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141223
14555	NC_004631	ACT	2	6	806417	806422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141224
14556	NC_004631	TCA	2	6	806603	806608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141224
14557	NC_004631	TTC	2	6	806638	806643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141224
14558	NC_004631	GCC	2	6	806653	806658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141224
14559	NC_004631	TCG	2	6	806743	806748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141224
14560	NC_004631	CAG	2	6	806811	806816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141224
14561	NC_004631	CGG	2	6	806840	806845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141224
14562	NC_004631	CGT	2	6	806846	806851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141224
14563	NC_004631	TAA	2	6	806890	806895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141224
14564	NC_004631	GC	3	6	806968	806973	0 %	0 %	50 %	50 %	29141224
14565	NC_004631	GC	3	6	807077	807082	0 %	0 %	50 %	50 %	29141224
14566	NC_004631	TCT	2	6	807154	807159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141224
14567	NC_004631	TCCT	2	8	807162	807169	0 %	50 %	0 %	50 %	29141224
14568	NC_004631	GGCA	2	8	807188	807195	25 %	0 %	50 %	25 %	29141224
14569	NC_004631	GCAG	2	8	807245	807252	25 %	0 %	50 %	25 %	29141224
14570	NC_004631	GC	3	6	807275	807280	0 %	0 %	50 %	50 %	29141224
14571	NC_004631	CTG	2	6	807315	807320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141224
14572	NC_004631	GA	3	6	807358	807363	50 %	0 %	50 %	0 %	29141224
14573	NC_004631	CTG	2	6	807384	807389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141224
14574	NC_004631	CGA	2	6	807521	807526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141224
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14577	NC_004631	CAT	2	6	807777	807782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141224
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14579	NC_004631	CGT	2	6	808016	808021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141225
14580	NC_004631	CAG	2	6	808057	808062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141225
14581	NC_004631	TGAT	2	8	808088	808095	25 %	50 %	25 %	0 %	29141225
14582	NC_004631	A	6	6	808096	808101	100 %	0 %	0 %	0 %	29141225
14583	NC_004631	ATGT	2	8	808108	808115	25 %	50 %	25 %	0 %	29141225
14584	NC_004631	A	6	6	808156	808161	100 %	0 %	0 %	0 %	29141225
14585	NC_004631	TAA	2	6	808170	808175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141225
14586	NC_004631	AGGT	2	8	808208	808215	25 %	25 %	50 %	0 %	29141225
14587	NC_004631	CAC	2	6	808255	808260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141225
14588	NC_004631	GGGAT	2	10	808287	808296	20 %	20 %	60 %	0 %	29141225
14589	NC_004631	T	7	7	808305	808311	0 %	100 %	0 %	0 %	29141225
14590	NC_004631	GCT	2	6	808338	808343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141225
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14593	NC_004631	GAGC	2	8	808485	808492	25 %	0 %	50 %	25 %	29141225
14594	NC_004631	GCT	2	6	808524	808529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141225
14595	NC_004631	GCT	2	6	808588	808593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141226
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14601	NC_004631	TATT	2	8	809239	809246	25 %	75 %	0 %	0 %	29141228
14602	NC_004631	ACTCAA	2	12	809283	809294	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29141228
14603	NC_004631	T	7	7	809353	809359	0 %	100 %	0 %	0 %	29141228
14604	NC_004631	AGAT	2	8	809374	809381	50 %	25 %	25 %	0 %	29141228
14605	NC_004631	AAT	2	6	809388	809393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141228
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14607	NC_004631	ACT	2	6	809446	809451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141228
14608	NC_004631	TAT	2	6	809479	809484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141228
14609	NC_004631	CGA	2	6	809495	809500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141228
14610	NC_004631	TAT	2	6	809559	809564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141228
14611	NC_004631	AAT	2	6	809632	809637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141228
14612	NC_004631	AATGA	2	10	810437	810446	60 %	20 %	20 %	0 %	29141229
14613	NC_004631	AT	3	6	810448	810453	50 %	50 %	0 %	0 %	29141229
14614	NC_004631	ATTT	2	8	810463	810470	25 %	75 %	0 %	0 %	29141229
14615	NC_004631	T	7	7	810507	810513	0 %	100 %	0 %	0 %	29141229
14616	NC_004631	ACAA	2	8	810523	810530	75 %	0 %	0 %	25 %	29141229
14617	NC_004631	AG	3	6	810560	810565	50 %	0 %	50 %	0 %	29141229
14618	NC_004631	GAT	3	9	810602	810610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141229
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