MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004631	TCGG	2	8	610353	610360	0 %	25 %	50 %	25 %	29141051
11002	NC_004631	CCGC	2	8	610363	610370	0 %	0 %	25 %	75 %	29141051
11003	NC_004631	TTC	2	6	610407	610412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141051
11004	NC_004631	ATTTTT	2	12	610500	610511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	29141051
11005	NC_004631	CTGG	2	8	610518	610525	0 %	25 %	50 %	25 %	29141051
11006	NC_004631	TGGAC	2	10	610555	610564	20 %	20 %	40 %	20 %	29141051
11007	NC_004631	CG	3	6	610568	610573	0 %	0 %	50 %	50 %	29141051
11008	NC_004631	CGC	2	6	610578	610583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141051
11009	NC_004631	TGC	2	6	610833	610838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141052
11010	NC_004631	TGC	2	6	610900	610905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141052
11011	NC_004631	CTGAT	2	10	610924	610933	20 %	40 %	20 %	20 %	29141052
11012	NC_004631	GGT	2	6	610934	610939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141052
11013	NC_004631	CGG	2	6	611042	611047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141052
11014	NC_004631	CCG	2	6	611121	611126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141052
11015	NC_004631	TGC	3	9	611155	611163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141052
11016	NC_004631	GTG	2	6	611202	611207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141052
11017	NC_004631	ATC	2	6	611451	611456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141053
11018	NC_004631	TGA	2	6	611458	611463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141053
11019	NC_004631	GTT	2	6	611540	611545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141053
11020	NC_004631	AAC	2	6	611559	611564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141053
11021	NC_004631	CGC	2	6	611671	611676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141053
11022	NC_004631	ACC	2	6	611694	611699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141053
11023	NC_004631	CAT	2	6	611866	611871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141053
11024	NC_004631	GC	4	8	611918	611925	0 %	0 %	50 %	50 %	29141053
11025	NC_004631	ACC	2	6	612063	612068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141053
11026	NC_004631	TAT	2	6	612091	612096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141053
11027	NC_004631	GAA	2	6	612113	612118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141053
11028	NC_004631	TCG	2	6	612120	612125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141053
11029	NC_004631	CAC	2	6	612149	612154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141053
11030	NC_004631	A	6	6	612165	612170	100 %	0 %	0 %	0 %	29141053
11031	NC_004631	ACCG	2	8	612209	612216	25 %	0 %	25 %	50 %	29141053
11032	NC_004631	GGT	2	6	612230	612235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141053
11033	NC_004631	CTG	2	6	612353	612358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141053
11034	NC_004631	TCT	2	6	612402	612407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141053
11035	NC_004631	ACCG	2	8	612416	612423	25 %	0 %	25 %	50 %	29141053
11036	NC_004631	TGG	2	6	612441	612446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141053
11037	NC_004631	CGG	2	6	612490	612495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141053
11038	NC_004631	CG	3	6	612513	612518	0 %	0 %	50 %	50 %	29141053
11039	NC_004631	CTG	2	6	612530	612535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141053
11040	NC_004631	CAC	2	6	612664	612669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141053
11041	NC_004631	GC	3	6	612682	612687	0 %	0 %	50 %	50 %	29141053
11042	NC_004631	ACTTTG	2	12	612741	612752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29141053
11043	NC_004631	GCG	3	9	612765	612773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141053
11044	NC_004631	TTC	2	6	612834	612839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141053
11045	NC_004631	CGC	3	9	612897	612905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141053
11046	NC_004631	TGG	2	6	613002	613007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141053
11047	NC_004631	CGA	2	6	613011	613016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141053
11048	NC_004631	TAC	2	6	613031	613036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141053
11049	NC_004631	GCA	2	6	613050	613055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141053
11050	NC_004631	GCA	2	6	613102	613107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141053
11051	NC_004631	GTA	2	6	613161	613166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141053
11052	NC_004631	CAA	2	6	613213	613218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141054
11053	NC_004631	CAC	2	6	613279	613284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141054
11054	NC_004631	GCG	2	6	613300	613305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141054
11055	NC_004631	AGC	2	6	613334	613339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141054
11056	NC_004631	GCGA	2	8	613396	613403	25 %	0 %	50 %	25 %	29141054
11057	NC_004631	CGGT	2	8	613448	613455	0 %	25 %	50 %	25 %	29141054
11058	NC_004631	GTG	2	6	613483	613488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141054
11059	NC_004631	A	7	7	613529	613535	100 %	0 %	0 %	0 %	29141054
11060	NC_004631	GAC	2	6	613557	613562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141054
11061	NC_004631	GCT	2	6	613581	613586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141054
11062	NC_004631	CTG	2	6	613593	613598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141054
11063	NC_004631	ATG	2	6	613627	613632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141054
11064	NC_004631	TGA	2	6	613635	613640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141054
11065	NC_004631	ACT	2	6	613680	613685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141054
11066	NC_004631	CTGG	2	8	613769	613776	0 %	25 %	50 %	25 %	29141055
11067	NC_004631	GC	3	6	613807	613812	0 %	0 %	50 %	50 %	29141055
11068	NC_004631	GCG	3	9	613882	613890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141055
11069	NC_004631	CTG	2	6	613956	613961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141055
11070	NC_004631	CTG	2	6	614004	614009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141055
11071	NC_004631	AAC	2	6	614014	614019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141055
11072	NC_004631	CTG	2	6	614028	614033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141055
11073	NC_004631	GCG	2	6	614095	614100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141055
11074	NC_004631	AT	3	6	614102	614107	50 %	50 %	0 %	0 %	29141055
11075	NC_004631	GCT	2	6	614159	614164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141055
11076	NC_004631	GAA	2	6	614241	614246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141055
11077	NC_004631	GCC	2	6	614272	614277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141055
11078	NC_004631	GCC	2	6	614297	614302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141055
11079	NC_004631	TG	3	6	614340	614345	0 %	50 %	50 %	0 %	29141055
11080	NC_004631	GAA	2	6	614465	614470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141055
11081	NC_004631	CG	4	8	614504	614511	0 %	0 %	50 %	50 %	29141055
11082	NC_004631	CGG	2	6	614531	614536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141055
11083	NC_004631	GCG	2	6	614575	614580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141055
11084	NC_004631	GC	4	8	614801	614808	0 %	0 %	50 %	50 %	29141055
11085	NC_004631	GC	3	6	614890	614895	0 %	0 %	50 %	50 %	29141055
11086	NC_004631	GAA	2	6	614946	614951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141055
11087	NC_004631	AGC	2	6	614968	614973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141055
11088	NC_004631	TGTC	2	8	615132	615139	0 %	50 %	25 %	25 %	409994458
11089	NC_004631	GCC	2	6	615199	615204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409994458
11090	NC_004631	GCCA	2	8	615272	615279	25 %	0 %	25 %	50 %	409994458
11091	NC_004631	GAC	2	6	615303	615308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994458
11092	NC_004631	GAA	2	6	615309	615314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409994458
11093	NC_004631	GTG	2	6	615336	615341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409994458
11094	NC_004631	TGA	2	6	615349	615354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409994458
11095	NC_004631	ACC	2	6	615358	615363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409994458
11096	NC_004631	TGA	2	6	615421	615426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409994458
11097	NC_004631	CCG	2	6	615440	615445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409994458
11098	NC_004631	TAC	2	6	615543	615548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409994458
11099	NC_004631	GC	3	6	615586	615591	0 %	0 %	50 %	50 %	409994458
11100	NC_004631	CAG	2	6	615750	615755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994458
11101	NC_004631	GGCTAT	2	12	615870	615881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409994458
11102	NC_004631	CCGC	2	8	615896	615903	0 %	0 %	25 %	75 %	409994458
11103	NC_004631	CGT	2	6	615918	615923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409994458
11104	NC_004631	TTA	2	6	615934	615939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409994458
11105	NC_004631	GCG	2	6	615969	615974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994458
11106	NC_004631	GAA	2	6	615992	615997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409994458
11107	NC_004631	ATCGGT	2	12	616002	616013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409994458
11108	NC_004631	TGGT	2	8	616057	616064	0 %	50 %	50 %	0 %	409994458
11109	NC_004631	CG	4	8	616088	616095	0 %	0 %	50 %	50 %	409994458
11110	NC_004631	TGC	2	6	616129	616134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409994458
11111	NC_004631	GC	4	8	616222	616229	0 %	0 %	50 %	50 %	409994458
11112	NC_004631	GGC	3	9	616277	616285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994458
11113	NC_004631	GAC	2	6	616368	616373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994458
11114	NC_004631	GAT	2	6	616383	616388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409994458
11115	NC_004631	CGC	2	6	616391	616396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409994458
11116	NC_004631	CG	3	6	616407	616412	0 %	0 %	50 %	50 %	409994458
11117	NC_004631	GC	3	6	616428	616433	0 %	0 %	50 %	50 %	409994458
11118	NC_004631	CAAAA	2	10	616503	616512	80 %	0 %	0 %	20 %	409994458
11119	NC_004631	A	6	6	616545	616550	100 %	0 %	0 %	0 %	409994458
11120	NC_004631	GGC	2	6	616598	616603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994458
11121	NC_004631	ATG	2	6	616692	616697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409994458
11122	NC_004631	GGC	2	6	616698	616703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994458
11123	NC_004631	GGT	3	9	616754	616762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409994458
11124	NC_004631	CG	3	6	616798	616803	0 %	0 %	50 %	50 %	409994458
11125	NC_004631	CGC	2	6	616808	616813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409994458
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11129	NC_004631	CTT	2	6	616952	616957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409994458
11130	NC_004631	CTA	2	6	616976	616981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409994458
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11148	NC_004631	CTGG	2	8	617748	617755	0 %	25 %	50 %	25 %	409994458
11149	NC_004631	CG	3	6	617756	617761	0 %	0 %	50 %	50 %	409994458
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11153	NC_004631	CTG	2	6	617852	617857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141057
11154	NC_004631	GTC	2	6	617861	617866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141057
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11230	NC_004631	GCG	2	6	621171	621176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141061
11231	NC_004631	TGA	2	6	621187	621192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141061
11232	NC_004631	CTT	2	6	621200	621205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141061
11233	NC_004631	GCT	2	6	621212	621217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141061
11234	NC_004631	GAACA	2	10	621258	621267	60 %	0 %	20 %	20 %	29141061
11235	NC_004631	TGG	2	6	621322	621327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141061
11236	NC_004631	G	6	6	621326	621331	0 %	0 %	100 %	0 %	29141061
11237	NC_004631	CTT	2	6	621368	621373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141061
11238	NC_004631	CTGG	2	8	621390	621397	0 %	25 %	50 %	25 %	29141061
11239	NC_004631	TGG	2	6	621427	621432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141061
11240	NC_004631	GAT	2	6	621476	621481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141061
11241	NC_004631	TCATGC	2	12	621512	621523	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29141061
11242	NC_004631	CCA	2	6	621539	621544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141061
11243	NC_004631	TGA	2	6	621562	621567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141061
11244	NC_004631	GC	3	6	621586	621591	0 %	0 %	50 %	50 %	29141061
11245	NC_004631	GCC	2	6	621599	621604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141061
11246	NC_004631	TGC	2	6	621616	621621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141061
11247	NC_004631	AACTG	2	10	621629	621638	40 %	20 %	20 %	20 %	29141061
11248	NC_004631	GT	3	6	621649	621654	0 %	50 %	50 %	0 %	29141061
11249	NC_004631	TGGCTG	2	12	621711	621722	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	29141061
11250	NC_004631	GC	3	6	621757	621762	0 %	0 %	50 %	50 %	29141061
11251	NC_004631	CTG	2	6	621771	621776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141061
11252	NC_004631	TGG	2	6	621783	621788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141061
11253	NC_004631	GCT	2	6	621857	621862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141061
11254	NC_004631	TGA	2	6	621886	621891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141061
11255	NC_004631	GCT	2	6	622004	622009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141061
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11257	NC_004631	CGG	2	6	622374	622379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141062
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11260	NC_004631	GCT	2	6	622599	622604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141062
11261	NC_004631	TGG	2	6	622607	622612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141062
11262	NC_004631	CTT	2	6	622680	622685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141062
11263	NC_004631	GGC	2	6	622711	622716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141062
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11265	NC_004631	ATG	2	6	622771	622776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141062
11266	NC_004631	CGG	2	6	622844	622849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141062
11267	NC_004631	TTC	2	6	622858	622863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141062
11268	NC_004631	GCT	2	6	622965	622970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141062
11269	NC_004631	CTG	2	6	623002	623007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141062
11270	NC_004631	CTT	2	6	623016	623021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141062
11271	NC_004631	GGT	2	6	623046	623051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141062
11272	NC_004631	TGGC	2	8	623061	623068	0 %	25 %	50 %	25 %	29141062
11273	NC_004631	CCG	2	6	623096	623101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141062
11274	NC_004631	CCG	2	6	623135	623140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141062
11275	NC_004631	CTG	2	6	623149	623154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141062
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11279	NC_004631	ATG	2	6	623455	623460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141062
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11282	NC_004631	GAT	2	6	623595	623600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141062
11283	NC_004631	TGC	2	6	623654	623659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141062
11284	NC_004631	GCCA	2	8	623695	623702	25 %	0 %	25 %	50 %	29141062
11285	NC_004631	TGG	2	6	623750	623755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141062
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11303	NC_004631	TGC	2	6	624479	624484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486812
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11331	NC_004631	CGG	2	6	626096	626101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141064
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11333	NC_004631	ATCA	2	8	626238	626245	50 %	25 %	0 %	25 %	29141064
11334	NC_004631	GCG	2	6	626285	626290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141064
11335	NC_004631	TGCC	2	8	626297	626304	0 %	25 %	25 %	50 %	29141064
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11341	NC_004631	CGGGC	2	10	626942	626951	0 %	0 %	60 %	40 %	29141065
11342	NC_004631	GC	3	6	626986	626991	0 %	0 %	50 %	50 %	29141065
11343	NC_004631	CAA	2	6	627007	627012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141065
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11345	NC_004631	TTC	2	6	627101	627106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141065
11346	NC_004631	CACG	2	8	627166	627173	25 %	0 %	25 %	50 %	29141065
11347	NC_004631	GAT	2	6	627253	627258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141065
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11349	NC_004631	TAA	2	6	627389	627394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141065
11350	NC_004631	A	7	7	627444	627450	100 %	0 %	0 %	0 %	29141065
11351	NC_004631	CAT	2	6	627517	627522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141066
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11353	NC_004631	TGCGC	2	10	627588	627597	0 %	20 %	40 %	40 %	29141066
11354	NC_004631	TGGATG	2	12	627630	627641	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29141066
11355	NC_004631	GAT	2	6	627644	627649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141066
11356	NC_004631	TGG	2	6	627696	627701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141066
11357	NC_004631	GGC	2	6	627831	627836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141066
11358	NC_004631	GGCGCA	2	12	627865	627876	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29141066
11359	NC_004631	GGTTT	2	10	627897	627906	0 %	60 %	40 %	0 %	29141066
11360	NC_004631	TCA	2	6	627970	627975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141066
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11484	NC_004631	GAT	2	6	633709	633714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141072
11485	NC_004631	GCC	2	6	633871	633876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141072
11486	NC_004631	CGG	2	6	633893	633898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141072
11487	NC_004631	TCA	2	6	633899	633904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141072
11488	NC_004631	TCGA	2	8	633910	633917	25 %	25 %	25 %	25 %	29141072
11489	NC_004631	GCC	2	6	633952	633957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141072
11490	NC_004631	CCTGG	2	10	634025	634034	0 %	20 %	40 %	40 %	29141072
11491	NC_004631	TGA	2	6	634059	634064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141072
11492	NC_004631	GC	3	6	634169	634174	0 %	0 %	50 %	50 %	29141073
11493	NC_004631	GGCG	2	8	634199	634206	0 %	0 %	75 %	25 %	29141073
11494	NC_004631	CTG	2	6	634245	634250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141073
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