MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004631	GCG	2	6	558175	558180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486815
10002	NC_004631	CGT	2	6	558190	558195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486815
10003	NC_004631	GTG	2	6	558231	558236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486815
10004	NC_004631	TGAC	2	8	558243	558250	25 %	25 %	25 %	25 %	161486815
10005	NC_004631	C	6	6	558254	558259	0 %	0 %	0 %	100 %	161486815
10006	NC_004631	GAC	2	6	558323	558328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486815
10007	NC_004631	TGGC	2	8	558336	558343	0 %	25 %	50 %	25 %	161486815
10008	NC_004631	CAGC	2	8	558479	558486	25 %	0 %	25 %	50 %	161486815
10009	NC_004631	TCC	2	6	558506	558511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161486815
10010	NC_004631	GTC	2	6	558519	558524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486815
10011	NC_004631	CGG	2	6	558574	558579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486815
10012	NC_004631	CTG	2	6	558611	558616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486815
10013	NC_004631	CATCC	2	10	558625	558634	20 %	20 %	0 %	60 %	161486815
10014	NC_004631	CGC	2	6	558646	558651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486815
10015	NC_004631	GGGCA	2	10	558674	558683	20 %	0 %	60 %	20 %	161486815
10016	NC_004631	GGC	2	6	558734	558739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486815
10017	NC_004631	GC	3	6	558766	558771	0 %	0 %	50 %	50 %	161486815
10018	NC_004631	GGGC	2	8	558796	558803	0 %	0 %	75 %	25 %	161486815
10019	NC_004631	ATC	2	6	558806	558811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486815
10020	NC_004631	GC	3	6	558865	558870	0 %	0 %	50 %	50 %	161486815
10021	NC_004631	GCC	3	9	558878	558886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486815
10022	NC_004631	GTT	2	6	558958	558963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486815
10023	NC_004631	GACG	2	8	559045	559052	25 %	0 %	50 %	25 %	161486815
10024	NC_004631	CCG	2	6	559057	559062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486815
10025	NC_004631	GGTC	2	8	559210	559217	0 %	25 %	50 %	25 %	161486815
10026	NC_004631	AGCGGC	2	12	559293	559304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161486815
10027	NC_004631	GCT	2	6	559318	559323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486815
10028	NC_004631	GCGCCA	2	12	559357	559368	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161486815
10029	NC_004631	TCG	2	6	559371	559376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486815
10030	NC_004631	CG	3	6	559375	559380	0 %	0 %	50 %	50 %	161486815
10031	NC_004631	TGA	2	6	559402	559407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486815
10032	NC_004631	AAT	2	6	559518	559523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161486815
10033	NC_004631	GCC	2	6	559562	559567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486815
10034	NC_004631	CAT	2	6	559618	559623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486815
10035	NC_004631	TGAA	2	8	559853	559860	50 %	25 %	25 %	0 %	29141001
10036	NC_004631	TAA	2	6	559903	559908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141001
10037	NC_004631	CAG	2	6	559910	559915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141001
10038	NC_004631	TC	3	6	559959	559964	0 %	50 %	0 %	50 %	29141001
10039	NC_004631	GCAG	2	8	560095	560102	25 %	0 %	50 %	25 %	29141001
10040	NC_004631	CGG	3	9	560170	560178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141001
10041	NC_004631	GCCT	2	8	560285	560292	0 %	25 %	25 %	50 %	29141001
10042	NC_004631	ACT	2	6	560322	560327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141001
10043	NC_004631	GGC	3	9	560417	560425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141001
10044	NC_004631	CGATG	2	10	560458	560467	20 %	20 %	40 %	20 %	29141001
10045	NC_004631	CCA	2	6	560478	560483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141001
10046	NC_004631	ATG	2	6	560520	560525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141001
10047	NC_004631	GTT	2	6	560567	560572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141001
10048	NC_004631	GC	3	6	560597	560602	0 %	0 %	50 %	50 %	29141001
10049	NC_004631	GC	3	6	560604	560609	0 %	0 %	50 %	50 %	29141001
10050	NC_004631	TCG	2	6	560625	560630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141001
10051	NC_004631	TGCA	2	8	560693	560700	25 %	25 %	25 %	25 %	29141001
10052	NC_004631	CT	3	6	560890	560895	0 %	50 %	0 %	50 %	29141001
10053	NC_004631	GGC	2	6	561032	561037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141001
10054	NC_004631	TG	3	6	561210	561215	0 %	50 %	50 %	0 %	29141002
10055	NC_004631	TTTTTG	2	12	561241	561252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	29141002
10056	NC_004631	TA	4	8	561308	561315	50 %	50 %	0 %	0 %	29141002
10057	NC_004631	GCC	2	6	561339	561344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141002
10058	NC_004631	TATT	2	8	561350	561357	25 %	75 %	0 %	0 %	29141002
10059	NC_004631	TAT	2	6	561363	561368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141002
10060	NC_004631	T	6	6	561498	561503	0 %	100 %	0 %	0 %	29141002
10061	NC_004631	GGA	2	6	561554	561559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141002
10062	NC_004631	CAG	2	6	561587	561592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141002
10063	NC_004631	TAT	3	9	561626	561634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141002
10064	NC_004631	TGTT	2	8	561697	561704	0 %	75 %	25 %	0 %	29141002
10065	NC_004631	T	6	6	561703	561708	0 %	100 %	0 %	0 %	29141002
10066	NC_004631	GTT	2	6	561723	561728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141002
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10069	NC_004631	CCG	2	6	562093	562098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141003
10070	NC_004631	CATA	2	8	562160	562167	50 %	25 %	0 %	25 %	29141003
10071	NC_004631	AAT	2	6	562169	562174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141003
10072	NC_004631	AACGT	2	10	562242	562251	40 %	20 %	20 %	20 %	29141003
10073	NC_004631	GGT	2	6	562263	562268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141003
10074	NC_004631	GTC	2	6	562269	562274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141003
10075	NC_004631	CGT	2	6	562299	562304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141003
10076	NC_004631	TGA	2	6	562348	562353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141003
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10078	NC_004631	GGCC	2	8	562459	562466	0 %	0 %	50 %	50 %	29141004
10079	NC_004631	GTT	2	6	562477	562482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141004
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10081	NC_004631	CG	3	6	562576	562581	0 %	0 %	50 %	50 %	29141004
10082	NC_004631	CTT	2	6	562617	562622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141004
10083	NC_004631	CCGC	2	8	562671	562678	0 %	0 %	25 %	75 %	29141004
10084	NC_004631	TGAGAA	2	12	562716	562727	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29141004
10085	NC_004631	TAT	2	6	562944	562949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141005
10086	NC_004631	CAT	2	6	562963	562968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141005
10087	NC_004631	T	6	6	562968	562973	0 %	100 %	0 %	0 %	29141005
10088	NC_004631	GCG	2	6	563011	563016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141005
10089	NC_004631	AAT	2	6	563036	563041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141005
10090	NC_004631	T	6	6	563137	563142	0 %	100 %	0 %	0 %	29141005
10091	NC_004631	TA	3	6	563448	563453	50 %	50 %	0 %	0 %	29141006
10092	NC_004631	GAG	2	6	563507	563512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141006
10093	NC_004631	AT	3	6	563517	563522	50 %	50 %	0 %	0 %	29141006
10094	NC_004631	CT	3	6	563532	563537	0 %	50 %	0 %	50 %	29141006
10095	NC_004631	GAC	2	6	563555	563560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141006
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10098	NC_004631	TGA	2	6	563719	563724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141006
10099	NC_004631	CGC	3	9	563727	563735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141006
10100	NC_004631	CAG	2	6	563924	563929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141007
10101	NC_004631	A	6	6	563936	563941	100 %	0 %	0 %	0 %	29141007
10102	NC_004631	T	6	6	564100	564105	0 %	100 %	0 %	0 %	29141007
10103	NC_004631	CG	3	6	564119	564124	0 %	0 %	50 %	50 %	29141007
10104	NC_004631	GGCG	2	8	564198	564205	0 %	0 %	75 %	25 %	29141007
10105	NC_004631	GCT	2	6	564258	564263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141007
10106	NC_004631	TTG	2	6	564266	564271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141007
10107	NC_004631	GCT	2	6	564303	564308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141007
10108	NC_004631	GC	3	6	564395	564400	0 %	0 %	50 %	50 %	29141007
10109	NC_004631	GGC	2	6	564402	564407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141007
10110	NC_004631	GAC	2	6	564465	564470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141007
10111	NC_004631	GCT	2	6	564483	564488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141007
10112	NC_004631	GGGCCT	2	12	564582	564593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29141007
10113	NC_004631	GGC	2	6	564748	564753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141007
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10116	NC_004631	GGCGC	2	10	564841	564850	0 %	0 %	60 %	40 %	29141007
10117	NC_004631	CGG	2	6	564939	564944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141007
10118	NC_004631	CGC	2	6	564948	564953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141007
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10120	NC_004631	CCAG	2	8	565103	565110	25 %	0 %	25 %	50 %	29141008
10121	NC_004631	ATT	2	6	565126	565131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141008
10122	NC_004631	ACA	2	6	565142	565147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141008
10123	NC_004631	CAGA	2	8	565160	565167	50 %	0 %	25 %	25 %	29141008
10124	NC_004631	ATC	2	6	565183	565188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141008
10125	NC_004631	AG	3	6	565218	565223	50 %	0 %	50 %	0 %	29141008
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10127	NC_004631	GT	3	6	565330	565335	0 %	50 %	50 %	0 %	29141008
10128	NC_004631	GTT	2	6	565379	565384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141008
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10131	NC_004631	GTTT	2	8	565538	565545	0 %	75 %	25 %	0 %	29141008
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10139	NC_004631	AGC	2	6	565783	565788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141008
10140	NC_004631	TGC	2	6	565828	565833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141008
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10144	NC_004631	TGC	2	6	565951	565956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141008
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10152	NC_004631	GCT	2	6	566355	566360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141009
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10154	NC_004631	GTG	2	6	566482	566487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141009
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10161	NC_004631	GC	3	6	566989	566994	0 %	0 %	50 %	50 %	29141009
10162	NC_004631	CAC	2	6	566997	567002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141009
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10227	NC_004631	GCAAG	2	10	570130	570139	40 %	0 %	40 %	20 %	29141013
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10231	NC_004631	AGAC	2	8	570362	570369	50 %	0 %	25 %	25 %	29141013
10232	NC_004631	AGAA	2	8	570382	570389	75 %	0 %	25 %	0 %	29141013
10233	NC_004631	TGG	2	6	570409	570414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141013
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10237	NC_004631	GT	3	6	570555	570560	0 %	50 %	50 %	0 %	29141013
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10243	NC_004631	CG	3	6	570775	570780	0 %	0 %	50 %	50 %	29141013
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10489	NC_004631	CGC	2	6	583952	583957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141024
10490	NC_004631	AGC	2	6	583975	583980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141024
10491	NC_004631	A	6	6	584025	584030	100 %	0 %	0 %	0 %	29141024
10492	NC_004631	GACGG	2	10	584040	584049	20 %	0 %	60 %	20 %	29141024
10493	NC_004631	A	6	6	584421	584426	100 %	0 %	0 %	0 %	29141025
10494	NC_004631	GCA	2	6	584472	584477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141025
10495	NC_004631	AC	3	6	584608	584613	50 %	0 %	0 %	50 %	29141025
10496	NC_004631	GAA	2	6	584666	584671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141025
10497	NC_004631	CAT	2	6	584681	584686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141025
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10499	NC_004631	CGC	2	6	584747	584752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141025
10500	NC_004631	TGG	3	9	584764	584772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141025

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