MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_004631	CATC	2	8	448440	448447	25 %	25 %	0 %	50 %	29140905
8002	NC_004631	CCG	2	6	448494	448499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140905
8003	NC_004631	GCC	2	6	448576	448581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140905
8004	NC_004631	CTT	2	6	448657	448662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140905
8005	NC_004631	GTC	2	6	448798	448803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140905
8006	NC_004631	CGG	2	6	448929	448934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140905
8007	NC_004631	CGG	2	6	448957	448962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140905
8008	NC_004631	GCT	2	6	448963	448968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140905
8009	NC_004631	CTT	2	6	448983	448988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140905
8010	NC_004631	AAT	2	6	449020	449025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140905
8011	NC_004631	GAG	2	6	449033	449038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140905
8012	NC_004631	GGT	2	6	449041	449046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140905
8013	NC_004631	CG	4	8	449052	449059	0 %	0 %	50 %	50 %	29140905
8014	NC_004631	AACA	2	8	449077	449084	75 %	0 %	0 %	25 %	29140905
8015	NC_004631	CG	3	6	449087	449092	0 %	0 %	50 %	50 %	29140905
8016	NC_004631	ACCG	2	8	449122	449129	25 %	0 %	25 %	50 %	29140905
8017	NC_004631	TGT	2	6	449148	449153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140905
8018	NC_004631	CTG	2	6	449206	449211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140905
8019	NC_004631	TCT	2	6	449261	449266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140905
8020	NC_004631	AGG	2	6	449277	449282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140905
8021	NC_004631	GCC	2	6	449311	449316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140905
8022	NC_004631	TAA	2	6	449470	449475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140905
8023	NC_004631	GGT	2	6	449572	449577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140905
8024	NC_004631	CTT	2	6	449691	449696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140905
8025	NC_004631	CCA	3	9	449721	449729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140905
8026	NC_004631	TCG	2	6	449738	449743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140905
8027	NC_004631	TAC	2	6	449836	449841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140905
8028	NC_004631	TCG	2	6	449853	449858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140905
8029	NC_004631	AGG	2	6	449967	449972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140905
8030	NC_004631	TTCG	2	8	450064	450071	0 %	50 %	25 %	25 %	29140905
8031	NC_004631	TTG	2	6	450226	450231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140905
8032	NC_004631	GCA	2	6	450240	450245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140905
8033	NC_004631	TGG	2	6	450261	450266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140905
8034	NC_004631	CTG	2	6	450643	450648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140905
8035	NC_004631	TCA	2	6	450656	450661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140905
8036	NC_004631	GCT	2	6	450712	450717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140905
8037	NC_004631	TGA	2	6	450721	450726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140905
8038	NC_004631	TACG	2	8	450828	450835	25 %	25 %	25 %	25 %	29140905
8039	NC_004631	GCG	2	6	450840	450845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140905
8040	NC_004631	A	6	6	450876	450881	100 %	0 %	0 %	0 %	29140905
8041	NC_004631	ACA	2	6	450903	450908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140905
8042	NC_004631	CGAT	2	8	450938	450945	25 %	25 %	25 %	25 %	29140905
8043	NC_004631	A	7	7	450946	450952	100 %	0 %	0 %	0 %	29140905
8044	NC_004631	CT	3	6	451158	451163	0 %	50 %	0 %	50 %	29140906
8045	NC_004631	TTG	2	6	451167	451172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140906
8046	NC_004631	GAG	2	6	451173	451178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140906
8047	NC_004631	GCC	3	9	451202	451210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140906
8048	NC_004631	GCC	2	6	451235	451240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140906
8049	NC_004631	CG	3	6	451250	451255	0 %	0 %	50 %	50 %	29140906
8050	NC_004631	TCGC	2	8	451380	451387	0 %	25 %	25 %	50 %	29140906
8051	NC_004631	CCAGCG	2	12	451459	451470	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29140906
8052	NC_004631	CTG	2	6	451559	451564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140906
8053	NC_004631	GTG	2	6	451581	451586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140906
8054	NC_004631	CGT	2	6	451612	451617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140906
8055	NC_004631	ATG	2	6	451641	451646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140906
8056	NC_004631	GC	3	6	451651	451656	0 %	0 %	50 %	50 %	29140906
8057	NC_004631	TCT	2	6	451665	451670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140906
8058	NC_004631	GC	3	6	451677	451682	0 %	0 %	50 %	50 %	29140906
8059	NC_004631	TCG	2	6	451753	451758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140906
8060	NC_004631	CG	3	6	451757	451762	0 %	0 %	50 %	50 %	29140906
8061	NC_004631	GCA	2	6	451924	451929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140906
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8065	NC_004631	GCTC	2	8	452182	452189	0 %	25 %	25 %	50 %	29140906
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8070	NC_004631	CCGC	2	8	452373	452380	0 %	0 %	25 %	75 %	29140906
8071	NC_004631	CGA	2	6	452392	452397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140906
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8074	NC_004631	CCAG	2	8	452524	452531	25 %	0 %	25 %	50 %	29140906
8075	NC_004631	GC	3	6	452543	452548	0 %	0 %	50 %	50 %	29140906
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8102	NC_004631	CGTA	2	8	454377	454384	25 %	25 %	25 %	25 %	29140907
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8105	NC_004631	CG	3	6	454473	454478	0 %	0 %	50 %	50 %	29140907
8106	NC_004631	AGTTG	2	10	454515	454524	20 %	40 %	40 %	0 %	29140907
8107	NC_004631	GC	3	6	454542	454547	0 %	0 %	50 %	50 %	29140907
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8112	NC_004631	TGG	2	6	454823	454828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140907
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8122	NC_004631	CGC	2	6	455758	455763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140908
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8124	NC_004631	GCG	3	9	455881	455889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140908
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8495	NC_004631	CGG	2	6	473584	473589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140925
8496	NC_004631	GAT	2	6	473632	473637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140925
8497	NC_004631	CCG	2	6	473695	473700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140925
8498	NC_004631	G	7	7	473758	473764	0 %	0 %	100 %	0 %	29140925
8499	NC_004631	TGA	2	6	473832	473837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140925
8500	NC_004631	TCG	2	6	473856	473861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140925

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