MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

< Previous12...156157158159160161162163164165166167168Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83501	NC_004631	GGC	2	6	4787451	4787456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144861
83502	NC_004631	CTG	2	6	4787471	4787476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144861
83503	NC_004631	CAT	2	6	4787507	4787512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144861
83504	NC_004631	GTTGG	2	10	4787611	4787620	0 %	40 %	60 %	0 %	29144861
83505	NC_004631	ATC	2	6	4787622	4787627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144861
83506	NC_004631	TGG	2	6	4787774	4787779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144861
83507	NC_004631	GAT	2	6	4787895	4787900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144861
83508	NC_004631	TTA	2	6	4787908	4787913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144861
83509	NC_004631	TTG	2	6	4787924	4787929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29144861
83510	NC_004631	TA	3	6	4788311	4788316	50 %	50 %	0 %	0 %	29144862
83511	NC_004631	CTG	2	6	4788377	4788382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144862
83512	NC_004631	ATA	2	6	4788596	4788601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29144862
83513	NC_004631	GGT	2	6	4788608	4788613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144862
83514	NC_004631	A	6	6	4788623	4788628	100 %	0 %	0 %	0 %	29144862
83515	NC_004631	TCT	2	6	4788642	4788647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29144862
83516	NC_004631	CAC	2	6	4788700	4788705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29144862
83517	NC_004631	GATT	2	8	4788774	4788781	25 %	50 %	25 %	0 %	29144862
83518	NC_004631	T	7	7	4788876	4788882	0 %	100 %	0 %	0 %	29144862
83519	NC_004631	CCG	2	6	4788909	4788914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144862
83520	NC_004631	ATT	2	6	4788938	4788943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144862
83521	NC_004631	AGCGA	2	10	4789186	4789195	40 %	0 %	40 %	20 %	29144863
83522	NC_004631	GGA	2	6	4789210	4789215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144863
83523	NC_004631	GA	3	6	4789223	4789228	50 %	0 %	50 %	0 %	29144863
83524	NC_004631	GCGG	2	8	4789245	4789252	0 %	0 %	75 %	25 %	29144863
83525	NC_004631	CGC	2	6	4789271	4789276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144863
83526	NC_004631	CTC	2	6	4789286	4789291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29144863
83527	NC_004631	GAT	2	6	4789347	4789352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144863
83528	NC_004631	TCA	2	6	4789389	4789394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144863
83529	NC_004631	AGC	2	6	4789550	4789555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144863
83530	NC_004631	TGA	2	6	4789565	4789570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144863
83531	NC_004631	AGC	2	6	4789597	4789602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144863
83532	NC_004631	T	6	6	4789613	4789618	0 %	100 %	0 %	0 %	29144863
83533	NC_004631	CGC	2	6	4789902	4789907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144864
83534	NC_004631	TGG	2	6	4789932	4789937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144864
83535	NC_004631	GAT	2	6	4789939	4789944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144864
83536	NC_004631	ACG	2	6	4789984	4789989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144864
83537	NC_004631	T	7	7	4790040	4790046	0 %	100 %	0 %	0 %	29144864
83538	NC_004631	CAG	2	6	4790047	4790052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144864
83539	NC_004631	GCA	2	6	4790094	4790099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144864
83540	NC_004631	CG	3	6	4790101	4790106	0 %	0 %	50 %	50 %	29144864
83541	NC_004631	ACG	2	6	4790209	4790214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144864
83542	NC_004631	CAG	2	6	4790251	4790256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144864
83543	NC_004631	ATC	2	6	4790308	4790313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144864
83544	NC_004631	AG	3	6	4790473	4790478	50 %	0 %	50 %	0 %	29144864
83545	NC_004631	CAT	2	6	4790517	4790522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144864
83546	NC_004631	CAA	2	6	4790747	4790752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29144865
83547	NC_004631	CAT	2	6	4790753	4790758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144865
83548	NC_004631	GCC	2	6	4791294	4791299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144866
83549	NC_004631	ATT	2	6	4791399	4791404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144866
83550	NC_004631	ATA	2	6	4791406	4791411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29144866
83551	NC_004631	CGA	2	6	4791466	4791471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144866
83552	NC_004631	TAC	2	6	4791498	4791503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144866
83553	NC_004631	TTA	2	6	4791528	4791533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144866
83554	NC_004631	ACG	2	6	4791601	4791606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144866
83555	NC_004631	GCTGGC	2	12	4791608	4791619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29144866
83556	NC_004631	GGC	2	6	4791644	4791649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144866
83557	NC_004631	TGA	2	6	4791746	4791751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144866
83558	NC_004631	CG	4	8	4791771	4791778	0 %	0 %	50 %	50 %	29144866
83559	NC_004631	GGC	2	6	4791806	4791811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144866
83560	NC_004631	ACA	2	6	4791839	4791844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29144866
83561	NC_004631	CTG	2	6	4791855	4791860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144866
83562	NC_004631	A	8	8	4791907	4791914	100 %	0 %	0 %	0 %	29144866

< Previous12...156157158159160161162163164165166167168Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.