MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004631	GGC	2	6	358761	358766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140846
6502	NC_004631	TCG	2	6	358813	358818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140846
6503	NC_004631	AGA	2	6	358847	358852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140846
6504	NC_004631	GAA	2	6	358920	358925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140846
6505	NC_004631	GC	3	6	358954	358959	0 %	0 %	50 %	50 %	29140846
6506	NC_004631	TGC	2	6	359080	359085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140846
6507	NC_004631	GC	3	6	359084	359089	0 %	0 %	50 %	50 %	29140846
6508	NC_004631	ATGA	2	8	359097	359104	50 %	25 %	25 %	0 %	29140846
6509	NC_004631	GAA	2	6	359154	359159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140846
6510	NC_004631	CAT	2	6	359274	359279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140846
6511	NC_004631	ACA	2	6	359371	359376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140847
6512	NC_004631	ACG	2	6	359377	359382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140847
6513	NC_004631	GC	3	6	359407	359412	0 %	0 %	50 %	50 %	29140847
6514	NC_004631	GCG	2	6	359419	359424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140847
6515	NC_004631	CG	3	6	359474	359479	0 %	0 %	50 %	50 %	29140847
6516	NC_004631	GCC	2	6	359606	359611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140847
6517	NC_004631	AAATA	2	10	359691	359700	80 %	20 %	0 %	0 %	29140847
6518	NC_004631	GCA	2	6	359749	359754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140848
6519	NC_004631	GCT	2	6	359825	359830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140848
6520	NC_004631	TTG	2	6	359855	359860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140848
6521	NC_004631	CGG	2	6	359870	359875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140848
6522	NC_004631	AAG	2	6	359966	359971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140848
6523	NC_004631	GCG	2	6	360026	360031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140848
6524	NC_004631	GCA	2	6	360370	360375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140849
6525	NC_004631	GCC	2	6	360380	360385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140849
6526	NC_004631	CG	4	8	360441	360448	0 %	0 %	50 %	50 %	29140849
6527	NC_004631	AGC	2	6	360489	360494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140849
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6529	NC_004631	GAC	2	6	360572	360577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140849
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6531	NC_004631	TGG	2	6	360639	360644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140849
6532	NC_004631	CGC	2	6	360658	360663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140849
6533	NC_004631	CGG	3	9	360672	360680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140849
6534	NC_004631	AGC	2	6	360719	360724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140849
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6537	NC_004631	GCT	2	6	360745	360750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140849
6538	NC_004631	TTA	2	6	360779	360784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140850
6539	NC_004631	GCGCC	2	10	360807	360816	0 %	0 %	40 %	60 %	29140850
6540	NC_004631	CGT	2	6	360824	360829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140850
6541	NC_004631	GGC	2	6	360832	360837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140850
6542	NC_004631	CT	3	6	360862	360867	0 %	50 %	0 %	50 %	29140850
6543	NC_004631	CAG	3	9	360950	360958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140850
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6545	NC_004631	ATG	2	6	361034	361039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140850
6546	NC_004631	CGCT	2	8	361043	361050	0 %	25 %	25 %	50 %	29140850
6547	NC_004631	GC	3	6	361064	361069	0 %	0 %	50 %	50 %	29140850
6548	NC_004631	GAT	2	6	361117	361122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140850
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6550	NC_004631	CTG	2	6	361161	361166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140850
6551	NC_004631	CG	3	6	361186	361191	0 %	0 %	50 %	50 %	29140850
6552	NC_004631	GTG	2	6	361226	361231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140850
6553	NC_004631	GAT	2	6	361253	361258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140850
6554	NC_004631	CGC	2	6	361282	361287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140850
6555	NC_004631	CGG	3	9	361332	361340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140850
6556	NC_004631	AAG	2	6	361368	361373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140850
6557	NC_004631	CGG	3	9	361396	361404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140850
6558	NC_004631	CGG	2	6	361480	361485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140850
6559	NC_004631	CGA	2	6	361486	361491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140850
6560	NC_004631	CTG	2	6	361502	361507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140850
6561	NC_004631	CTG	2	6	361571	361576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140850
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6565	NC_004631	TGC	3	9	361929	361937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140850
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6571	NC_004631	CGCT	2	8	362117	362124	0 %	25 %	25 %	50 %	29140850
6572	NC_004631	GC	3	6	362126	362131	0 %	0 %	50 %	50 %	29140850
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6579	NC_004631	CGC	2	6	362422	362427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140850
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6582	NC_004631	GAT	2	6	362498	362503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140850
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6594	NC_004631	GAC	3	9	363098	363106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140852
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6596	NC_004631	GC	3	6	363271	363276	0 %	0 %	50 %	50 %	29140853
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6600	NC_004631	CCGTA	2	10	363477	363486	20 %	20 %	20 %	40 %	29140853
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6607	NC_004631	TGCC	2	8	363792	363799	0 %	25 %	25 %	50 %	29140853
6608	NC_004631	CGG	2	6	363828	363833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140853
6609	NC_004631	CAAA	2	8	363843	363850	75 %	0 %	0 %	25 %	29140853
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6615	NC_004631	CGGCG	2	10	364143	364152	0 %	0 %	60 %	40 %	29140853
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6622	NC_004631	CTG	2	6	364495	364500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140853
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6624	NC_004631	AGGCG	2	10	364744	364753	20 %	0 %	60 %	20 %	409994452
6625	NC_004631	GCA	2	6	364780	364785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994452
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6628	NC_004631	GCA	2	6	364843	364848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994452
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6996	NC_004631	A	6	6	385082	385087	100 %	0 %	0 %	0 %	29140866
6997	NC_004631	GCT	2	6	385103	385108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140866
6998	NC_004631	ACG	2	6	385111	385116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140866
6999	NC_004631	CGG	2	6	385189	385194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140866
7000	NC_004631	TAC	2	6	385239	385244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140866

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