MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004631	GATC	2	8	331103	331110	25 %	25 %	25 %	25 %	29140825
6002	NC_004631	CGTG	2	8	331187	331194	0 %	25 %	50 %	25 %	29140825
6003	NC_004631	TGC	2	6	331241	331246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140825
6004	NC_004631	TGGCA	2	10	331258	331267	20 %	20 %	40 %	20 %	29140825
6005	NC_004631	CGG	2	6	331280	331285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140825
6006	NC_004631	CTG	2	6	331287	331292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140825
6007	NC_004631	GCG	2	6	331327	331332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140825
6008	NC_004631	CGC	2	6	331346	331351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140825
6009	NC_004631	GAG	2	6	331386	331391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140825
6010	NC_004631	GCG	2	6	331396	331401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140825
6011	NC_004631	CTGG	2	8	331494	331501	0 %	25 %	50 %	25 %	29140825
6012	NC_004631	TAC	2	6	331553	331558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140825
6013	NC_004631	TGG	2	6	331569	331574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140825
6014	NC_004631	ACC	2	6	331581	331586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140825
6015	NC_004631	ATG	2	6	331651	331656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140825
6016	NC_004631	CGC	2	6	331706	331711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140825
6017	NC_004631	GGC	3	9	331787	331795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140825
6018	NC_004631	CTG	2	6	331842	331847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140825
6019	NC_004631	TGG	2	6	331882	331887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140825
6020	NC_004631	GCG	2	6	331891	331896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140825
6021	NC_004631	GGGC	2	8	331921	331928	0 %	0 %	75 %	25 %	29140825
6022	NC_004631	CGA	2	6	331970	331975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140825
6023	NC_004631	CTT	2	6	331985	331990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140825
6024	NC_004631	CGCTGG	2	12	332005	332016	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29140825
6025	NC_004631	GAT	2	6	332036	332041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140825
6026	NC_004631	TGG	2	6	332131	332136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140825
6027	NC_004631	GCT	3	9	332156	332164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140825
6028	NC_004631	CGG	2	6	332353	332358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140825
6029	NC_004631	GAC	2	6	332360	332365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140825
6030	NC_004631	ATG	2	6	332388	332393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140825
6031	NC_004631	AGC	2	6	332494	332499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140825
6032	NC_004631	CTG	2	6	333223	333228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140826
6033	NC_004631	CTGGC	2	10	333241	333250	0 %	20 %	40 %	40 %	29140826
6034	NC_004631	GCA	2	6	333302	333307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140826
6035	NC_004631	GAT	2	6	333475	333480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140826
6036	NC_004631	AGCGGC	2	12	333552	333563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29140826
6037	NC_004631	CG	3	6	333564	333569	0 %	0 %	50 %	50 %	29140826
6038	NC_004631	CG	3	6	333632	333637	0 %	0 %	50 %	50 %	29140826
6039	NC_004631	GCA	2	6	333639	333644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140826
6040	NC_004631	ACA	2	6	333648	333653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140826
6041	NC_004631	GAT	2	6	333774	333779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140826
6042	NC_004631	TGAG	2	8	333872	333879	25 %	25 %	50 %	0 %	29140826
6043	NC_004631	GCT	2	6	333975	333980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140826
6044	NC_004631	GGT	2	6	333990	333995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140826
6045	NC_004631	GGT	2	6	334023	334028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140826
6046	NC_004631	CAG	2	6	334044	334049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140826
6047	NC_004631	ATTG	2	8	334065	334072	25 %	50 %	25 %	0 %	29140826
6048	NC_004631	CGC	2	6	334139	334144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140826
6049	NC_004631	TGG	2	6	334154	334159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140826
6050	NC_004631	TGCC	2	8	334175	334182	0 %	25 %	25 %	50 %	29140826
6051	NC_004631	ATG	2	6	334192	334197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140826
6052	NC_004631	TGA	2	6	334250	334255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140826
6053	NC_004631	GCG	2	6	334367	334372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140826
6054	NC_004631	T	6	6	334413	334418	0 %	100 %	0 %	0 %	29140826
6055	NC_004631	CCA	2	6	334428	334433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140826
6056	NC_004631	TCG	2	6	334491	334496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140826
6057	NC_004631	GA	3	6	334505	334510	50 %	0 %	50 %	0 %	29140826
6058	NC_004631	TGG	2	6	334517	334522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140826
6059	NC_004631	GTTT	2	8	334540	334547	0 %	75 %	25 %	0 %	29140826
6060	NC_004631	AGCGC	2	10	334730	334739	20 %	0 %	40 %	40 %	29140827
6061	NC_004631	CG	3	6	334887	334892	0 %	0 %	50 %	50 %	29140827
6062	NC_004631	GC	4	8	334898	334905	0 %	0 %	50 %	50 %	29140827
6063	NC_004631	GAT	2	6	334913	334918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140827
6064	NC_004631	CGC	2	6	334971	334976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140827
6065	NC_004631	GCG	2	6	334981	334986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140827
6066	NC_004631	GC	3	6	335016	335021	0 %	0 %	50 %	50 %	29140827
6067	NC_004631	CAG	2	6	335156	335161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140827
6068	NC_004631	TAC	2	6	335191	335196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140827
6069	NC_004631	CGC	2	6	335274	335279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140827
6070	NC_004631	GGCGC	2	10	335312	335321	0 %	0 %	60 %	40 %	29140827
6071	NC_004631	CTG	3	9	335374	335382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140828
6072	NC_004631	CGT	2	6	335445	335450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140828
6073	NC_004631	AG	3	6	335457	335462	50 %	0 %	50 %	0 %	29140828
6074	NC_004631	AGGA	2	8	335468	335475	50 %	0 %	50 %	0 %	29140828
6075	NC_004631	TAA	2	6	335510	335515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140828
6076	NC_004631	ATGG	2	8	335536	335543	25 %	25 %	50 %	0 %	29140828
6077	NC_004631	TTA	2	6	335591	335596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140828
6078	NC_004631	TA	3	6	335690	335695	50 %	50 %	0 %	0 %	29140828
6079	NC_004631	GACG	2	8	335733	335740	25 %	0 %	50 %	25 %	29140828
6080	NC_004631	TGC	2	6	335780	335785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140828
6081	NC_004631	GC	3	6	335800	335805	0 %	0 %	50 %	50 %	29140828
6082	NC_004631	GCG	2	6	335930	335935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140828
6083	NC_004631	ATT	2	6	335964	335969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140828
6084	NC_004631	GC	3	6	335977	335982	0 %	0 %	50 %	50 %	29140828
6085	NC_004631	GTT	2	6	336018	336023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140828
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6087	NC_004631	GGC	2	6	336037	336042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140828
6088	NC_004631	GCT	2	6	336093	336098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140828
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6090	NC_004631	ATT	2	6	336166	336171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140828
6091	NC_004631	TAC	2	6	336232	336237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140828
6092	NC_004631	GCT	2	6	336297	336302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140828
6093	NC_004631	ATC	2	6	336308	336313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140828
6094	NC_004631	TGA	2	6	336383	336388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140828
6095	NC_004631	TG	3	6	336439	336444	0 %	50 %	50 %	0 %	29140828
6096	NC_004631	TGAAC	2	10	336546	336555	40 %	20 %	20 %	20 %	29140828
6097	NC_004631	ACGC	2	8	336595	336602	25 %	0 %	25 %	50 %	29140828
6098	NC_004631	AGT	2	6	336683	336688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140828
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6101	NC_004631	CGCGG	2	10	336902	336911	0 %	0 %	60 %	40 %	29140829
6102	NC_004631	AT	3	6	336913	336918	50 %	50 %	0 %	0 %	29140829
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6108	NC_004631	CGA	2	6	337213	337218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140830
6109	NC_004631	GGC	2	6	337274	337279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140830
6110	NC_004631	CCG	2	6	337282	337287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140830
6111	NC_004631	CGA	2	6	337321	337326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140830
6112	NC_004631	GCCA	3	12	337328	337339	25 %	0 %	25 %	50 %	29140830
6113	NC_004631	ATC	2	6	337479	337484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140830
6114	NC_004631	TGCC	2	8	337496	337503	0 %	25 %	25 %	50 %	29140830
6115	NC_004631	CAG	2	6	337535	337540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140830
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6117	NC_004631	GCA	2	6	337594	337599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140830
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6119	NC_004631	GCT	2	6	337622	337627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140830
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6121	NC_004631	CGC	2	6	337649	337654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140830
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6492	NC_004631	AGC	2	6	358481	358486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140846
6493	NC_004631	GAC	2	6	358494	358499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140846
6494	NC_004631	CAT	2	6	358514	358519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140846
6495	NC_004631	AAC	2	6	358527	358532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140846
6496	NC_004631	GTG	2	6	358542	358547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140846
6497	NC_004631	CG	5	10	358578	358587	0 %	0 %	50 %	50 %	29140846
6498	NC_004631	ATC	2	6	358590	358595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140846
6499	NC_004631	GC	3	6	358708	358713	0 %	0 %	50 %	50 %	29140846
6500	NC_004631	CGT	2	6	358722	358727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140846

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