MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_004631	CAC	2	6	269398	269403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140771
5003	NC_004631	CAG	2	6	269534	269539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140771
5004	NC_004631	TGA	2	6	269587	269592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140771
5005	NC_004631	G	6	6	269600	269605	0 %	0 %	100 %	0 %	29140771
5006	NC_004631	CCGC	2	8	269616	269623	0 %	0 %	25 %	75 %	29140771
5007	NC_004631	TGA	2	6	269698	269703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140771
5008	NC_004631	CTA	2	6	269770	269775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140771
5009	NC_004631	TGCGCG	2	12	269788	269799	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29140771
5010	NC_004631	TC	3	6	269826	269831	0 %	50 %	0 %	50 %	29140771
5011	NC_004631	GCC	2	6	269991	269996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140772
5012	NC_004631	GAA	2	6	270026	270031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140772
5013	NC_004631	A	6	6	270048	270053	100 %	0 %	0 %	0 %	29140772
5014	NC_004631	GC	3	6	270113	270118	0 %	0 %	50 %	50 %	29140772
5015	NC_004631	TGA	2	6	270163	270168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140772
5016	NC_004631	TGA	2	6	270172	270177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140772
5017	NC_004631	GGCG	2	8	270181	270188	0 %	0 %	75 %	25 %	29140772
5018	NC_004631	TGA	2	6	270202	270207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140772
5019	NC_004631	TCG	2	6	270216	270221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140772
5020	NC_004631	CG	3	6	270229	270234	0 %	0 %	50 %	50 %	29140772
5021	NC_004631	TGA	2	6	270252	270257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140772
5022	NC_004631	TCA	2	6	270265	270270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140772
5023	NC_004631	A	6	6	270291	270296	100 %	0 %	0 %	0 %	29140772
5024	NC_004631	TCG	2	6	270298	270303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140772
5025	NC_004631	GGC	2	6	270521	270526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140772
5026	NC_004631	CGG	2	6	270529	270534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140772
5027	NC_004631	TGC	2	6	270570	270575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140772
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5031	NC_004631	CAT	2	6	270712	270717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140772
5032	NC_004631	GCG	2	6	270732	270737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140772
5033	NC_004631	GGC	2	6	270760	270765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140772
5034	NC_004631	GCT	2	6	270781	270786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140772
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5039	NC_004631	GA	3	6	271157	271162	50 %	0 %	50 %	0 %	29140773
5040	NC_004631	GCA	2	6	271178	271183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140773
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5042	NC_004631	TGT	2	6	271234	271239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140773
5043	NC_004631	CCG	2	6	271270	271275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140773
5044	NC_004631	GT	3	6	271283	271288	0 %	50 %	50 %	0 %	29140773
5045	NC_004631	AGT	2	6	271318	271323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140773
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5047	NC_004631	CAT	2	6	273608	273613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140774
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5050	NC_004631	GCG	2	6	273760	273765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140774
5051	NC_004631	CT	3	6	273835	273840	0 %	50 %	0 %	50 %	29140774
5052	NC_004631	T	6	6	273906	273911	0 %	100 %	0 %	0 %	29140774
5053	NC_004631	GCTG	2	8	273926	273933	0 %	25 %	50 %	25 %	29140774
5054	NC_004631	TCA	2	6	273953	273958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140774
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5057	NC_004631	AAG	2	6	274024	274029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140774
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5059	NC_004631	T	6	6	274110	274115	0 %	100 %	0 %	0 %	29140774
5060	NC_004631	GGC	2	6	274116	274121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140774
5061	NC_004631	GCT	2	6	274169	274174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140774
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5065	NC_004631	CGG	2	6	274418	274423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140774
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5099	NC_004631	GC	4	8	276830	276837	0 %	0 %	50 %	50 %	29140776
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5238	NC_004631	GATTT	2	10	284259	284268	20 %	60 %	20 %	0 %	29140786
5239	NC_004631	T	7	7	284266	284272	0 %	100 %	0 %	0 %	29140786
5240	NC_004631	TTTC	2	8	284461	284468	0 %	75 %	0 %	25 %	29140786
5241	NC_004631	TGC	2	6	284496	284501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140786
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5244	NC_004631	TCA	2	6	284751	284756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409994451
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5494	NC_004631	GC	3	6	303043	303048	0 %	0 %	50 %	50 %	29140799
5495	NC_004631	AACGTT	2	12	303178	303189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29140799
5496	NC_004631	CGT	2	6	303193	303198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140799
5497	NC_004631	CAG	2	6	303298	303303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140799
5498	NC_004631	A	6	6	303409	303414	100 %	0 %	0 %	0 %	29140800
5499	NC_004631	CAG	2	6	303434	303439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140800
5500	NC_004631	CA	3	6	303516	303521	50 %	0 %	0 %	50 %	29140800

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