MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome

Total Repeats: 49697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004461	TTAT	2	8	356	363	25 %	75 %	0 %	0 %	27466919
2	NC_004461	AGAA	2	8	369	376	75 %	0 %	25 %	0 %	27466919
3	NC_004461	TAT	2	6	550	555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466919
4	NC_004461	ATG	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466919
5	NC_004461	AGA	2	6	598	603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
6	NC_004461	ACA	2	6	618	623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466919
7	NC_004461	AAG	2	6	636	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
8	NC_004461	ACA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466919
9	NC_004461	TTC	2	6	664	669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466919
10	NC_004461	GAT	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466919
11	NC_004461	TGC	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466919
12	NC_004461	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466919
13	NC_004461	TA	3	6	814	819	50 %	50 %	0 %	0 %	27466919
14	NC_004461	ATGC	2	8	851	858	25 %	25 %	25 %	25 %	27466919
15	NC_004461	CAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466919
16	NC_004461	TTA	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466919
17	NC_004461	TGA	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466919
18	NC_004461	ATTCA	2	10	1016	1025	40 %	40 %	0 %	20 %	27466919
19	NC_004461	AAG	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
20	NC_004461	TTC	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466919
21	NC_004461	ATA	2	6	1086	1091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466919
22	NC_004461	CCA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27466919
23	NC_004461	GAA	3	9	1238	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
24	NC_004461	CCAA	2	8	1284	1291	50 %	0 %	0 %	50 %	27466919
25	NC_004461	TCAA	2	8	1294	1301	50 %	25 %	0 %	25 %	27466919
26	NC_004461	A	6	6	1499	1504	100 %	0 %	0 %	0 %	27466919
27	NC_004461	TATC	2	8	1544	1551	25 %	50 %	0 %	25 %	27466919
28	NC_004461	GAA	2	6	1589	1594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
29	NC_004461	ACA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466919
30	NC_004461	AAG	2	6	1677	1682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466919
31	NC_004461	ATG	2	6	2026	2031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
32	NC_004461	ATT	2	6	2051	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
33	NC_004461	TTA	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
34	NC_004461	AAC	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466920
35	NC_004461	GAA	2	6	2218	2223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466920
36	NC_004461	TTG	2	6	2225	2230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466920
37	NC_004461	TTC	2	6	2269	2274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466920
38	NC_004461	ATT	2	6	2281	2286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
39	NC_004461	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	27466920
40	NC_004461	AAG	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466920
41	NC_004461	ATT	2	6	2400	2405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
42	NC_004461	A	6	6	2454	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	27466920
43	NC_004461	TACT	2	8	2510	2517	25 %	50 %	0 %	25 %	27466920
44	NC_004461	AGA	2	6	2601	2606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466920
45	NC_004461	TCA	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466920
46	NC_004461	CGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466920
47	NC_004461	GATATT	2	12	2686	2697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27466920
48	NC_004461	TTA	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
49	NC_004461	TTA	2	6	2891	2896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466920
50	NC_004461	AGA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466920
51	NC_004461	ATG	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
52	NC_004461	TTTC	2	8	3005	3012	0 %	75 %	0 %	25 %	27466920
53	NC_004461	ATG	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
54	NC_004461	ATG	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
55	NC_004461	AAGTAG	2	12	3059	3070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	27466920
56	NC_004461	GAT	3	9	3112	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466920
57	NC_004461	AATT	2	8	3131	3138	50 %	50 %	0 %	0 %	27466920
58	NC_004461	TAA	2	6	3157	3162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466920
59	NC_004461	A	6	6	4086	4091	100 %	0 %	0 %	0 %	27466921
60	NC_004461	ATC	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466921
61	NC_004461	AT	3	6	4139	4144	50 %	50 %	0 %	0 %	27466921
62	NC_004461	GTC	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466921
63	NC_004461	CAC	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27466921
64	NC_004461	CGA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466921
65	NC_004461	CTG	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466921
66	NC_004461	AGA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466921
67	NC_004461	ACA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466921
68	NC_004461	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466921
69	NC_004461	TTG	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466921
70	NC_004461	GTTAC	2	10	4395	4404	20 %	40 %	20 %	20 %	27466921
71	NC_004461	GACACT	2	12	4478	4489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27466921
72	NC_004461	CAAT	2	8	4529	4536	50 %	25 %	0 %	25 %	27466921
73	NC_004461	GAA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466921
74	NC_004461	TGA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466921
75	NC_004461	GAT	2	6	4770	4775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466921
76	NC_004461	TGAG	2	8	4780	4787	25 %	25 %	50 %	0 %	27466921
77	NC_004461	TGA	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466921
78	NC_004461	AAT	2	6	4883	4888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466921
79	NC_004461	ACA	2	6	4973	4978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466922
80	NC_004461	GTAT	2	8	5045	5052	25 %	50 %	25 %	0 %	27466922
81	NC_004461	TTG	2	6	5099	5104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466922
82	NC_004461	ATA	2	6	5105	5110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466922
83	NC_004461	CTG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466922
84	NC_004461	GTT	2	6	5335	5340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466922
85	NC_004461	ATC	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466922
86	NC_004461	ACA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466922
87	NC_004461	GCTT	2	8	5550	5557	0 %	50 %	25 %	25 %	27466922
88	NC_004461	TAAA	2	8	5561	5568	75 %	25 %	0 %	0 %	27466922
89	NC_004461	AGA	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466922
90	NC_004461	AGA	2	6	5613	5618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466922
91	NC_004461	TTA	2	6	5659	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
92	NC_004461	TA	4	8	5697	5704	50 %	50 %	0 %	0 %	27466922
93	NC_004461	GAT	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466922
94	NC_004461	CAAC	2	8	5765	5772	50 %	0 %	0 %	50 %	27466922
95	NC_004461	TTA	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
96	NC_004461	AAT	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27466922
97	NC_004461	CATA	2	8	5797	5804	50 %	25 %	0 %	25 %	27466922
98	NC_004461	GGT	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27466922
99	NC_004461	ATT	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
100	NC_004461	CAG	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466922
101	NC_004461	GTT	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466922
102	NC_004461	ATT	2	6	6030	6035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
103	NC_004461	ATT	2	6	6085	6090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
104	NC_004461	TAT	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
105	NC_004461	A	6	6	6133	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	27466922
106	NC_004461	CGT	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466922
107	NC_004461	GAA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466922
108	NC_004461	G	6	6	6262	6267	0 %	0 %	100 %	0 %	27466922
109	NC_004461	CTA	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466922
110	NC_004461	GGA	2	6	6412	6417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27466922
111	NC_004461	AT	3	6	6425	6430	50 %	50 %	0 %	0 %	27466922
112	NC_004461	TACG	2	8	6491	6498	25 %	25 %	25 %	25 %	27466922
113	NC_004461	TTA	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466922
114	NC_004461	TTC	2	6	6511	6516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466922
115	NC_004461	GCC	2	6	6567	6572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27466922
116	NC_004461	TA	3	6	6575	6580	50 %	50 %	0 %	0 %	27466922
117	NC_004461	GTA	2	6	6817	6822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466922
118	NC_004461	TCAA	2	8	6930	6937	50 %	25 %	0 %	25 %	27466923
119	NC_004461	CTATG	2	10	6987	6996	20 %	40 %	20 %	20 %	27466923
120	NC_004461	TCG	2	6	7053	7058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466923
121	NC_004461	TTC	2	6	7164	7169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466923
122	NC_004461	GTTATC	2	12	7208	7219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27466923
123	NC_004461	ATGG	2	8	7252	7259	25 %	25 %	50 %	0 %	27466923
124	NC_004461	CAA	2	6	7332	7337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466923
125	NC_004461	ATG	2	6	7364	7369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466923
126	NC_004461	AG	3	6	7378	7383	50 %	0 %	50 %	0 %	27466923
127	NC_004461	TCC	2	6	7464	7469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27466923
128	NC_004461	TAAG	2	8	7508	7515	50 %	25 %	25 %	0 %	27466923
129	NC_004461	TCG	2	6	7605	7610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466923
130	NC_004461	AGA	2	6	7662	7667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466923
131	NC_004461	GTG	3	9	7670	7678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27466923
132	NC_004461	A	6	6	7739	7744	100 %	0 %	0 %	0 %	27466923
133	NC_004461	AGTT	2	8	7751	7758	25 %	50 %	25 %	0 %	27466923
134	NC_004461	TGA	2	6	7794	7799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466923
135	NC_004461	AGT	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466923
136	NC_004461	TA	3	6	7877	7882	50 %	50 %	0 %	0 %	27466923
137	NC_004461	CAT	2	6	7901	7906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27466923
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267	NC_004461	TACA	2	8	15531	15538	50 %	25 %	0 %	25 %	27466928
268	NC_004461	TTA	2	6	15546	15551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466928
269	NC_004461	CTTT	2	8	15641	15648	0 %	75 %	0 %	25 %	27466928
270	NC_004461	TTTA	2	8	15661	15668	25 %	75 %	0 %	0 %	27466928
271	NC_004461	TTA	2	6	15675	15680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466928
272	NC_004461	CAA	2	6	15695	15700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466928
273	NC_004461	TAT	2	6	15739	15744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466928
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275	NC_004461	TAT	2	6	16132	16137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466929
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277	NC_004461	TACGG	2	10	16292	16301	20 %	20 %	40 %	20 %	27466929
278	NC_004461	CTGG	2	8	16311	16318	0 %	25 %	50 %	25 %	27466929
279	NC_004461	TGG	2	6	16336	16341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27466929
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281	NC_004461	GA	3	6	16450	16455	50 %	0 %	50 %	0 %	27466929
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294	NC_004461	TGA	2	6	16879	16884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466929
295	NC_004461	TGA	2	6	16930	16935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466929
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302	NC_004461	ATT	2	6	17415	17420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466930
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374	NC_004461	A	7	7	20577	20583	100 %	0 %	0 %	0 %	27466932
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382	NC_004461	TGT	2	6	21086	21091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27466933
383	NC_004461	CGA	2	6	21166	21171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27466933
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393	NC_004461	TCT	2	6	21601	21606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27466933
394	NC_004461	GAA	2	6	21699	21704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27466933
395	NC_004461	GGTA	2	8	21728	21735	25 %	25 %	50 %	0 %	27466933
396	NC_004461	GTC	2	6	21805	21810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466933
397	NC_004461	TGATTG	2	12	21838	21849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27466933
398	NC_004461	CAA	2	6	21900	21905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27466933
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400	NC_004461	ATG	2	6	22020	22025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466933
401	NC_004461	TCG	2	6	22069	22074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466933
402	NC_004461	TGA	2	6	22088	22093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466933
403	NC_004461	TTA	2	6	22094	22099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27466933
404	NC_004461	GTG	2	6	22105	22110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27466933
405	NC_004461	TGA	2	6	22115	22120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466933
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427	NC_004461	TGA	2	6	23412	23417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27466934
428	NC_004461	CCA	2	6	23424	23429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27466934
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433	NC_004461	CGT	2	6	23518	23523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27466934
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