MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae NEM316

Total Repeats: 42638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004368	AAC	2	6	189	194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010076
2	NC_004368	CAG	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010076
3	NC_004368	T	6	6	254	259	0 %	100 %	0 %	0 %	25010076
4	NC_004368	CTC	2	6	275	280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	25010076
5	NC_004368	TTA	2	6	303	308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010076
6	NC_004368	TGAAA	2	10	322	331	60 %	20 %	20 %	0 %	25010076
7	NC_004368	ATTTAC	2	12	426	437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	25010076
8	NC_004368	G	7	7	633	639	0 %	0 %	100 %	0 %	25010076
9	NC_004368	CTA	2	6	662	667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010076
10	NC_004368	CTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010076
11	NC_004368	TTA	2	6	738	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010076
12	NC_004368	GTCA	2	8	752	759	25 %	25 %	25 %	25 %	25010076
13	NC_004368	GAA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010076
14	NC_004368	AAAAG	2	10	787	796	80 %	0 %	20 %	0 %	25010076
15	NC_004368	TGAT	2	8	819	826	25 %	50 %	25 %	0 %	25010076
16	NC_004368	G	6	6	857	862	0 %	0 %	100 %	0 %	25010076
17	NC_004368	TTC	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010076
18	NC_004368	TACA	2	8	897	904	50 %	25 %	0 %	25 %	25010076
19	NC_004368	AGA	2	6	961	966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010076
20	NC_004368	CAC	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	25010076
21	NC_004368	ACGT	2	8	1122	1129	25 %	25 %	25 %	25 %	25010076
22	NC_004368	ATG	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010076
23	NC_004368	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010076
24	NC_004368	TAA	2	6	1459	1464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010076
25	NC_004368	A	6	6	1468	1473	100 %	0 %	0 %	0 %	25010076
26	NC_004368	AAAAT	2	10	1521	1530	80 %	20 %	0 %	0 %	25010076
27	NC_004368	AATA	2	8	1706	1713	75 %	25 %	0 %	0 %	25010077
28	NC_004368	TCT	2	6	1720	1725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010077
29	NC_004368	ATT	2	6	1944	1949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010077
30	NC_004368	AAC	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010077
31	NC_004368	ACA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010077
32	NC_004368	AAACT	2	10	2104	2113	60 %	20 %	0 %	20 %	25010077
33	NC_004368	ATT	2	6	2124	2129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010077
34	NC_004368	TGC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010077
35	NC_004368	CAA	2	6	2154	2159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010077
36	NC_004368	AAAT	2	8	2204	2211	75 %	25 %	0 %	0 %	25010077
37	NC_004368	TAA	2	6	2279	2284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010077
38	NC_004368	GTT	2	6	2295	2300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010077
39	NC_004368	GAT	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010077
40	NC_004368	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010077
41	NC_004368	CCT	2	6	2453	2458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	25010077
42	NC_004368	CGATT	2	10	2731	2740	20 %	40 %	20 %	20 %	25010077
43	NC_004368	TAA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010077
44	NC_004368	ACTA	2	8	2820	2827	50 %	25 %	0 %	25 %	25010077
45	NC_004368	TA	4	8	2905	2912	50 %	50 %	0 %	0 %	25010078
46	NC_004368	TAA	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010078
47	NC_004368	TTG	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010078
48	NC_004368	ACAGA	2	10	3006	3015	60 %	0 %	20 %	20 %	25010078
49	NC_004368	GAT	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010078
50	NC_004368	A	8	8	3025	3032	100 %	0 %	0 %	0 %	25010078
51	NC_004368	AAAG	2	8	3060	3067	75 %	0 %	25 %	0 %	25010078
52	NC_004368	ATC	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010078
53	NC_004368	AGG	2	6	3086	3091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	25010078
54	NC_004368	TTA	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010078
55	NC_004368	CAGA	2	8	3225	3232	50 %	0 %	25 %	25 %	25010078
56	NC_004368	TTTA	2	8	3255	3262	25 %	75 %	0 %	0 %	25010078
57	NC_004368	TAAAA	2	10	3335	3344	80 %	20 %	0 %	0 %	25010078
58	NC_004368	A	6	6	3341	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	25010078
59	NC_004368	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010078
60	NC_004368	TTC	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010078
61	NC_004368	GA	3	6	3442	3447	50 %	0 %	50 %	0 %	25010078
62	NC_004368	CAG	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010078
63	NC_004368	T	6	6	3479	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	25010078
64	NC_004368	TAT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010078
65	NC_004368	TAC	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010078
66	NC_004368	TTGA	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	25010078
67	NC_004368	A	6	6	3757	3762	100 %	0 %	0 %	0 %	25010078
68	NC_004368	TA	3	6	3769	3774	50 %	50 %	0 %	0 %	25010078
69	NC_004368	TTG	2	6	3808	3813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010079
70	NC_004368	A	6	6	3819	3824	100 %	0 %	0 %	0 %	25010079
71	NC_004368	ATG	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010079
72	NC_004368	A	7	7	3965	3971	100 %	0 %	0 %	0 %	25010079
73	NC_004368	ATT	2	6	4344	4349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010080
74	NC_004368	CTA	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010080
75	NC_004368	ATT	2	6	4362	4367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010080
76	NC_004368	CAG	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010081
77	NC_004368	TTTA	2	8	4601	4608	25 %	75 %	0 %	0 %	25010081
78	NC_004368	GCT	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010081
79	NC_004368	TGGTA	2	10	4673	4682	20 %	40 %	40 %	0 %	25010081
80	NC_004368	A	7	7	4731	4737	100 %	0 %	0 %	0 %	25010081
81	NC_004368	TAA	2	6	4811	4816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010081
82	NC_004368	TGA	3	9	4871	4879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
83	NC_004368	TCAA	2	8	4977	4984	50 %	25 %	0 %	25 %	25010081
84	NC_004368	A	6	6	5005	5010	100 %	0 %	0 %	0 %	25010081
85	NC_004368	AGA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010081
86	NC_004368	GTT	2	6	5133	5138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010081
87	NC_004368	T	7	7	5146	5152	0 %	100 %	0 %	0 %	25010081
88	NC_004368	AAC	2	6	5156	5161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010081
89	NC_004368	TGA	2	6	5189	5194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
90	NC_004368	TGA	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
91	NC_004368	AGT	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
92	NC_004368	GAA	3	9	5295	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010081
93	NC_004368	TGA	3	9	5315	5323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
94	NC_004368	GCT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010081
95	NC_004368	ATC	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010081
96	NC_004368	ACTT	2	8	5415	5422	25 %	50 %	0 %	25 %	25010081
97	NC_004368	CTG	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010081
98	NC_004368	GCT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010081
99	NC_004368	TAT	2	6	5492	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010081
100	NC_004368	ATG	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010081
101	NC_004368	AAG	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010081
102	NC_004368	GAA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010081
103	NC_004368	TTG	2	6	5763	5768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010082
104	NC_004368	ATA	2	6	5808	5813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25010082
105	NC_004368	AGA	2	6	5866	5871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010082
106	NC_004368	A	6	6	5916	5921	100 %	0 %	0 %	0 %	25010082
107	NC_004368	TTTAT	2	10	5922	5931	20 %	80 %	0 %	0 %	25010082
108	NC_004368	ACT	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010082
109	NC_004368	CTTA	2	8	5981	5988	25 %	50 %	0 %	25 %	25010082
110	NC_004368	ACA	2	6	5991	5996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010082
111	NC_004368	AT	3	6	6020	6025	50 %	50 %	0 %	0 %	25010082
112	NC_004368	GAT	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010082
113	NC_004368	CTG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010082
114	NC_004368	TAT	2	6	6103	6108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010082
115	NC_004368	TTA	2	6	6180	6185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010082
116	NC_004368	ATG	2	6	6213	6218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010082
117	NC_004368	ATT	3	9	6264	6272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010082
118	NC_004368	A	6	6	6291	6296	100 %	0 %	0 %	0 %	25010082
119	NC_004368	ATT	2	6	6336	6341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
120	NC_004368	GTG	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25010083
121	NC_004368	A	7	7	6466	6472	100 %	0 %	0 %	0 %	25010083
122	NC_004368	AT	3	6	6521	6526	50 %	50 %	0 %	0 %	25010083
123	NC_004368	T	6	6	6559	6564	0 %	100 %	0 %	0 %	25010083
124	NC_004368	TGA	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010083
125	NC_004368	GCA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010083
126	NC_004368	A	7	7	6656	6662	100 %	0 %	0 %	0 %	25010083
127	NC_004368	TTC	2	6	6904	6909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010083
128	NC_004368	CAG	2	6	6992	6997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25010083
129	NC_004368	ATT	2	6	7003	7008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010083
130	NC_004368	A	6	6	7039	7044	100 %	0 %	0 %	0 %	25010083
131	NC_004368	TCG	2	6	7140	7145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25010083
132	NC_004368	TGA	2	6	7218	7223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25010083
133	NC_004368	A	6	6	7229	7234	100 %	0 %	0 %	0 %	25010083
134	NC_004368	TAGC	2	8	7268	7275	25 %	25 %	25 %	25 %	25010083
135	NC_004368	ACA	2	6	7293	7298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25010083
136	NC_004368	ACCA	2	8	7358	7365	50 %	0 %	0 %	50 %	25010083
137	NC_004368	CTT	2	6	7371	7376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25010083
138	NC_004368	TCA	2	6	7422	7427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25010083
139	NC_004368	T	6	6	7453	7458	0 %	100 %	0 %	0 %	25010083
140	NC_004368	TTG	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
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142	NC_004368	TTG	2	6	7637	7642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25010083
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264	NC_004368	ATT	2	6	13200	13205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25010088
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268	NC_004368	A	7	7	13254	13260	100 %	0 %	0 %	0 %	25010088
269	NC_004368	TATT	2	8	13270	13277	25 %	75 %	0 %	0 %	25010088
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271	NC_004368	AAG	2	6	13306	13311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25010088
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