MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae NEM316

Total Repeats: 42638

< Previous12...74757677787980818283848586Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_004368	TC	3	6	2204753	2204758	0 %	50 %	0 %	50 %	25012165
42502	NC_004368	A	6	6	2204776	2204781	100 %	0 %	0 %	0 %	25012165
42503	NC_004368	ATA	2	6	2204788	2204793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012165
42504	NC_004368	TTC	2	6	2204803	2204808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012165
42505	NC_004368	ACT	2	6	2204853	2204858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012165
42506	NC_004368	AAC	2	6	2204918	2204923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012165
42507	NC_004368	AGA	3	9	2205011	2205019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25012165
42508	NC_004368	ATA	2	6	2205022	2205027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012165
42509	NC_004368	CTT	2	6	2205029	2205034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012165
42510	NC_004368	TGTTCT	2	12	2205155	2205166	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	25012165
42511	NC_004368	TGA	2	6	2205167	2205172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012165
42512	NC_004368	CAA	2	6	2205175	2205180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012165
42513	NC_004368	TAT	2	6	2205242	2205247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012165
42514	NC_004368	ATT	2	6	2205294	2205299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012165
42515	NC_004368	TTCT	2	8	2205301	2205308	0 %	75 %	0 %	25 %	25012165
42516	NC_004368	ATCG	2	8	2205321	2205328	25 %	25 %	25 %	25 %	25012165
42517	NC_004368	AAT	2	6	2205397	2205402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012165
42518	NC_004368	AT	4	8	2205518	2205525	50 %	50 %	0 %	0 %	25012166
42519	NC_004368	CAA	2	6	2205636	2205641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012166
42520	NC_004368	TCA	2	6	2205664	2205669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012166
42521	NC_004368	TTC	2	6	2205702	2205707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012166
42522	NC_004368	GGTTTA	2	12	2205743	2205754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	25012166
42523	NC_004368	AGT	2	6	2205770	2205775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012166
42524	NC_004368	T	6	6	2205790	2205795	0 %	100 %	0 %	0 %	25012166
42525	NC_004368	A	6	6	2205823	2205828	100 %	0 %	0 %	0 %	25012166
42526	NC_004368	TATT	2	8	2206011	2206018	25 %	75 %	0 %	0 %	25012166
42527	NC_004368	TTG	2	6	2206029	2206034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25012166
42528	NC_004368	CTA	2	6	2206052	2206057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012166
42529	NC_004368	GAAA	2	8	2206061	2206068	75 %	0 %	25 %	0 %	25012166
42530	NC_004368	CT	4	8	2206085	2206092	0 %	50 %	0 %	50 %	25012166
42531	NC_004368	TAT	2	6	2206115	2206120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012166
42532	NC_004368	TTC	2	6	2206209	2206214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012166
42533	NC_004368	TAG	2	6	2206249	2206254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012166
42534	NC_004368	ACT	2	6	2206286	2206291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012166
42535	NC_004368	TTTG	2	8	2206351	2206358	0 %	75 %	25 %	0 %	25012166
42536	NC_004368	ACA	2	6	2206385	2206390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012166
42537	NC_004368	CTTT	2	8	2206439	2206446	0 %	75 %	0 %	25 %	25012166
42538	NC_004368	ACTTT	2	10	2206447	2206456	20 %	60 %	0 %	20 %	25012166
42539	NC_004368	TAA	2	6	2206503	2206508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012166
42540	NC_004368	TA	3	6	2206529	2206534	50 %	50 %	0 %	0 %	25012166
42541	NC_004368	ATTT	2	8	2206545	2206552	25 %	75 %	0 %	0 %	25012166
42542	NC_004368	ATGC	2	8	2206562	2206569	25 %	25 %	25 %	25 %	25012166
42543	NC_004368	TCTG	2	8	2206617	2206624	0 %	50 %	25 %	25 %	25012166
42544	NC_004368	GCT	2	6	2206628	2206633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25012166
42545	NC_004368	ACA	2	6	2206653	2206658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012166
42546	NC_004368	AATTT	2	10	2206685	2206694	40 %	60 %	0 %	0 %	25012166
42547	NC_004368	TTTA	2	8	2206720	2206727	25 %	75 %	0 %	0 %	25012166
42548	NC_004368	CTT	2	6	2206760	2206765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012166
42549	NC_004368	TAT	2	6	2206792	2206797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012166
42550	NC_004368	T	6	6	2206839	2206844	0 %	100 %	0 %	0 %	25012166
42551	NC_004368	TGT	2	6	2206864	2206869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25012166
42552	NC_004368	GA	3	6	2206991	2206996	50 %	0 %	50 %	0 %	25012166
42553	NC_004368	TTC	2	6	2207009	2207014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012166
42554	NC_004368	TTC	2	6	2207104	2207109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012166
42555	NC_004368	AAATTT	2	12	2207152	2207163	50 %	50 %	0 %	0 %	25012166
42556	NC_004368	ATA	2	6	2207175	2207180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012166
42557	NC_004368	A	6	6	2207255	2207260	100 %	0 %	0 %	0 %	25012166
42558	NC_004368	AAAC	2	8	2207270	2207277	75 %	0 %	0 %	25 %	25012166
42559	NC_004368	TAA	2	6	2207461	2207466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012166
42560	NC_004368	CAGT	2	8	2207536	2207543	25 %	25 %	25 %	25 %	25012166
42561	NC_004368	TAA	2	6	2207572	2207577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012166
42562	NC_004368	AAAAT	2	10	2207583	2207592	80 %	20 %	0 %	0 %	25012166
42563	NC_004368	TAA	2	6	2207608	2207613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012166
42564	NC_004368	T	6	6	2207654	2207659	0 %	100 %	0 %	0 %	25012166
42565	NC_004368	CA	3	6	2207712	2207717	50 %	0 %	0 %	50 %	25012166
42566	NC_004368	TTTC	2	8	2207727	2207734	0 %	75 %	0 %	25 %	25012166
42567	NC_004368	TTA	2	6	2207790	2207795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012166
42568	NC_004368	AAAAGT	2	12	2207803	2207814	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	25012166
42569	NC_004368	TTC	2	6	2207873	2207878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012166
42570	NC_004368	ATA	2	6	2207916	2207921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012166
42571	NC_004368	AAAT	2	8	2207961	2207968	75 %	25 %	0 %	0 %	25012166
42572	NC_004368	CTAT	2	8	2208035	2208042	25 %	50 %	0 %	25 %	25012166
42573	NC_004368	TAT	2	6	2208054	2208059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012166
42574	NC_004368	TAT	2	6	2208068	2208073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012166
42575	NC_004368	A	6	6	2208085	2208090	100 %	0 %	0 %	0 %	25012166
42576	NC_004368	ATT	2	6	2208681	2208686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012167
42577	NC_004368	TGA	2	6	2208758	2208763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012167
42578	NC_004368	AAT	2	6	2208792	2208797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012167
42579	NC_004368	T	6	6	2208805	2208810	0 %	100 %	0 %	0 %	25012167
42580	NC_004368	ACC	2	6	2208835	2208840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	25012167
42581	NC_004368	TAG	2	6	2208855	2208860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012167
42582	NC_004368	T	6	6	2208876	2208881	0 %	100 %	0 %	0 %	25012167
42583	NC_004368	TCA	2	6	2209040	2209045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012167
42584	NC_004368	CTT	2	6	2209107	2209112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012167
42585	NC_004368	ATT	2	6	2209145	2209150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012167
42586	NC_004368	A	9	9	2209365	2209373	100 %	0 %	0 %	0 %	25012168
42587	NC_004368	TCA	2	6	2209380	2209385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012168
42588	NC_004368	ATT	2	6	2209407	2209412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012168
42589	NC_004368	TGG	2	6	2209424	2209429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25012168
42590	NC_004368	TGG	2	6	2209475	2209480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25012168
42591	NC_004368	AGTAA	2	10	2209494	2209503	60 %	20 %	20 %	0 %	25012168
42592	NC_004368	TAA	2	6	2209508	2209513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012168
42593	NC_004368	ACA	2	6	2209524	2209529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012168
42594	NC_004368	GTT	2	6	2209557	2209562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25012168
42595	NC_004368	ACA	2	6	2209580	2209585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012168
42596	NC_004368	AG	3	6	2209586	2209591	50 %	0 %	50 %	0 %	25012168
42597	NC_004368	T	7	7	2209622	2209628	0 %	100 %	0 %	0 %	25012168
42598	NC_004368	G	6	6	2209637	2209642	0 %	0 %	100 %	0 %	25012168
42599	NC_004368	A	6	6	2209695	2209700	100 %	0 %	0 %	0 %	25012168
42600	NC_004368	TGT	2	6	2209718	2209723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25012168
42601	NC_004368	TAA	2	6	2209727	2209732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012168
42602	NC_004368	TTG	2	6	2209801	2209806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	25012168
42603	NC_004368	CGT	2	6	2209832	2209837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25012168
42604	NC_004368	TCA	2	6	2209884	2209889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012168
42605	NC_004368	GAA	2	6	2210007	2210012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25012168
42606	NC_004368	TGC	2	6	2210048	2210053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	25012168
42607	NC_004368	AATT	2	8	2210111	2210118	50 %	50 %	0 %	0 %	25012168
42608	NC_004368	TCT	2	6	2210130	2210135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25012168
42609	NC_004368	ATCAA	2	10	2210138	2210147	60 %	20 %	0 %	20 %	25012168
42610	NC_004368	ATG	2	6	2210206	2210211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012168
42611	NC_004368	ATCA	2	8	2210223	2210230	50 %	25 %	0 %	25 %	25012168
42612	NC_004368	AG	3	6	2210252	2210257	50 %	0 %	50 %	0 %	25012168
42613	NC_004368	TTA	2	6	2210308	2210313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012168
42614	NC_004368	GTA	2	6	2210352	2210357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012168
42615	NC_004368	AGT	2	6	2210435	2210440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012168
42616	NC_004368	CCA	2	6	2210474	2210479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	25012168
42617	NC_004368	GTG	2	6	2210512	2210517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	25012168
42618	NC_004368	AAAC	2	8	2210523	2210530	75 %	0 %	0 %	25 %	25012168
42619	NC_004368	AAC	2	6	2210572	2210577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25012168
42620	NC_004368	ATCA	2	8	2210713	2210720	50 %	25 %	0 %	25 %	25012169
42621	NC_004368	AGA	2	6	2210772	2210777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25012169
42622	NC_004368	ATT	2	6	2210818	2210823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012169
42623	NC_004368	CAG	2	6	2210834	2210839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25012169
42624	NC_004368	ACG	2	6	2210868	2210873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25012169
42625	NC_004368	TAA	2	6	2210931	2210936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012169
42626	NC_004368	TGA	2	6	2210937	2210942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	25012169
42627	NC_004368	AAAAG	2	10	2211029	2211038	80 %	0 %	20 %	0 %	25012169
42628	NC_004368	AT	3	6	2211063	2211068	50 %	50 %	0 %	0 %	25012169
42629	NC_004368	TA	3	6	2211085	2211090	50 %	50 %	0 %	0 %	25012169
42630	NC_004368	ATACG	2	10	2211095	2211104	40 %	20 %	20 %	20 %	25012169
42631	NC_004368	ACT	2	6	2211105	2211110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012169
42632	NC_004368	GAA	2	6	2211142	2211147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25012169
42633	NC_004368	ACT	2	6	2211177	2211182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	25012169
42634	NC_004368	GAC	2	6	2211251	2211256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	25012169
42635	NC_004368	TTA	2	6	2211265	2211270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	25012169
42636	NC_004368	AAGAA	2	10	2211275	2211284	80 %	0 %	20 %	0 %	25012169
42637	NC_004368	TAA	2	6	2211381	2211386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	25012169
42638	NC_004368	AAG	2	6	2211425	2211430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25012169

< Previous12...74757677787980818283848586Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.