MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus mutans UA159 chromosome

Total Repeats: 37727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004350	T	6	6	213	218	0 %	100 %	0 %	0 %	24378533
2	NC_004350	AAGC	2	8	254	261	50 %	0 %	25 %	25 %	24378533
3	NC_004350	T	6	6	271	276	0 %	100 %	0 %	0 %	24378533
4	NC_004350	ATT	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378533
5	NC_004350	CTT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378533
6	NC_004350	GAT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378533
7	NC_004350	A	6	6	341	346	100 %	0 %	0 %	0 %	24378533
8	NC_004350	A	7	7	357	363	100 %	0 %	0 %	0 %	24378533
9	NC_004350	TGT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378533
10	NC_004350	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378533
11	NC_004350	TGA	2	6	565	570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378533
12	NC_004350	AAC	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378533
13	NC_004350	CT	3	6	633	638	0 %	50 %	0 %	50 %	24378533
14	NC_004350	TTAT	2	8	639	646	25 %	75 %	0 %	0 %	24378533
15	NC_004350	GGA	2	6	647	652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24378533
16	NC_004350	AGCA	2	8	703	710	50 %	0 %	25 %	25 %	24378533
17	NC_004350	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	24378533
18	NC_004350	TTA	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378533
19	NC_004350	TGT	2	6	763	768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378533
20	NC_004350	AGA	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378533
21	NC_004350	TGA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378533
22	NC_004350	A	7	7	857	863	100 %	0 %	0 %	0 %	24378533
23	NC_004350	AAG	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378533
24	NC_004350	ATA	3	9	915	923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378533
25	NC_004350	CCT	2	6	1025	1030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24378533
26	NC_004350	TC	3	6	1090	1095	0 %	50 %	0 %	50 %	24378533
27	NC_004350	A	6	6	1187	1192	100 %	0 %	0 %	0 %	24378533
28	NC_004350	TTA	2	6	1200	1205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378533
29	NC_004350	GCA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378533
30	NC_004350	GAT	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378533
31	NC_004350	AAATC	2	10	1329	1338	60 %	20 %	0 %	20 %	24378533
32	NC_004350	TAA	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378533
33	NC_004350	ATAAA	2	10	1544	1553	80 %	20 %	0 %	0 %	24378533
34	NC_004350	TAA	2	6	1725	1730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378534
35	NC_004350	T	7	7	1733	1739	0 %	100 %	0 %	0 %	24378534
36	NC_004350	CTATTC	2	12	1787	1798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	24378534
37	NC_004350	GAA	3	9	1888	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378534
38	NC_004350	CTT	2	6	1916	1921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378534
39	NC_004350	TTA	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378534
40	NC_004350	GAA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378534
41	NC_004350	AAC	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378534
42	NC_004350	GTT	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378534
43	NC_004350	AAT	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378534
44	NC_004350	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378534
45	NC_004350	TGC	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378534
46	NC_004350	TCA	2	6	2290	2295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378534
47	NC_004350	GAT	2	6	2296	2301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378534
48	NC_004350	GTC	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378534
49	NC_004350	GAT	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378534
50	NC_004350	AT	3	6	2415	2420	50 %	50 %	0 %	0 %	24378534
51	NC_004350	TTG	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378534
52	NC_004350	CAA	2	6	2592	2597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378534
53	NC_004350	GAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378534
54	NC_004350	ACTT	2	8	2701	2708	25 %	50 %	0 %	25 %	24378534
55	NC_004350	TTCA	2	8	2809	2816	25 %	50 %	0 %	25 %	24378534
56	NC_004350	TGAAA	2	10	3129	3138	60 %	20 %	20 %	0 %	24378535
57	NC_004350	GAC	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378535
58	NC_004350	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	24378535
59	NC_004350	TTG	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378535
60	NC_004350	CGTA	2	8	3195	3202	25 %	25 %	25 %	25 %	24378535
61	NC_004350	ATCAAA	2	12	3214	3225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	24378535
62	NC_004350	ATG	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378535
63	NC_004350	GCC	2	6	3257	3262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24378535
64	NC_004350	A	6	6	3282	3287	100 %	0 %	0 %	0 %	24378535
65	NC_004350	CAG	2	6	3471	3476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378536
66	NC_004350	CAA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378536
67	NC_004350	AAAT	2	8	3721	3728	75 %	25 %	0 %	0 %	24378536
68	NC_004350	TGT	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378536
69	NC_004350	ATG	2	6	3783	3788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378536
70	NC_004350	TTG	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378536
71	NC_004350	AATT	2	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	24378536
72	NC_004350	TAA	2	6	3892	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378536
73	NC_004350	A	6	6	3915	3920	100 %	0 %	0 %	0 %	24378536
74	NC_004350	TTC	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378536
75	NC_004350	AGA	2	6	4027	4032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378536
76	NC_004350	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378536
77	NC_004350	CAA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378536
78	NC_004350	GCA	2	6	4160	4165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378536
79	NC_004350	GTT	3	9	4181	4189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378536
80	NC_004350	GAA	3	9	4205	4213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378536
81	NC_004350	TGA	3	9	4225	4233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378536
82	NC_004350	TTG	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378536
83	NC_004350	ACTT	2	8	4325	4332	25 %	50 %	0 %	25 %	24378536
84	NC_004350	GTGC	2	8	4352	4359	0 %	25 %	50 %	25 %	24378536
85	NC_004350	CAC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24378536
86	NC_004350	ATG	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378536
87	NC_004350	AAG	2	6	4494	4499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378536
88	NC_004350	GAA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378536
89	NC_004350	TTG	2	6	4676	4681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378537
90	NC_004350	GAAAC	2	10	4711	4720	60 %	0 %	20 %	20 %	24378537
91	NC_004350	TTA	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378537
92	NC_004350	A	6	6	4829	4834	100 %	0 %	0 %	0 %	24378537
93	NC_004350	TTTAT	2	10	4835	4844	20 %	80 %	0 %	0 %	24378537
94	NC_004350	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378537
95	NC_004350	TTAT	2	8	4931	4938	25 %	75 %	0 %	0 %	24378537
96	NC_004350	GAT	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378537
97	NC_004350	CTG	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378537
98	NC_004350	A	6	6	5122	5127	100 %	0 %	0 %	0 %	24378537
99	NC_004350	AC	3	6	5147	5152	50 %	0 %	0 %	50 %	24378537
100	NC_004350	AACA	2	8	5204	5211	75 %	0 %	0 %	25 %	24378537
101	NC_004350	ATTT	2	8	5247	5254	25 %	75 %	0 %	0 %	24378538
102	NC_004350	A	6	6	5265	5270	100 %	0 %	0 %	0 %	24378538
103	NC_004350	TC	3	6	5290	5295	0 %	50 %	0 %	50 %	24378538
104	NC_004350	CTA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378538
105	NC_004350	AGC	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
106	NC_004350	AGC	2	6	5367	5372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
107	NC_004350	GAA	2	6	5456	5461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
108	NC_004350	TGA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
109	NC_004350	GCA	3	9	5489	5497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
110	NC_004350	TTG	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378538
111	NC_004350	AGC	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
112	NC_004350	TTAAA	2	10	5649	5658	60 %	40 %	0 %	0 %	24378538
113	NC_004350	GAA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
114	NC_004350	ATCA	2	8	5786	5793	50 %	25 %	0 %	25 %	24378538
115	NC_004350	T	6	6	5816	5821	0 %	100 %	0 %	0 %	24378538
116	NC_004350	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
117	NC_004350	TGA	2	6	5908	5913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
118	NC_004350	ATC	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378538
119	NC_004350	TTA	2	6	5970	5975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
120	NC_004350	TCA	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378538
121	NC_004350	AACA	2	8	6111	6118	75 %	0 %	0 %	25 %	24378538
122	NC_004350	T	6	6	6125	6130	0 %	100 %	0 %	0 %	24378538
123	NC_004350	GAT	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
124	NC_004350	ATT	2	6	6146	6151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
125	NC_004350	AGA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
126	NC_004350	TAA	2	6	6244	6249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378538
127	NC_004350	T	7	7	6284	6290	0 %	100 %	0 %	0 %	24378538
128	NC_004350	T	6	6	6365	6370	0 %	100 %	0 %	0 %	24378538
129	NC_004350	TGA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
130	NC_004350	CAG	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378538
131	NC_004350	A	6	6	6529	6534	100 %	0 %	0 %	0 %	24378538
132	NC_004350	TGA	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
133	NC_004350	A	6	6	6626	6631	100 %	0 %	0 %	0 %	24378538
134	NC_004350	CGT	3	9	6644	6652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378538
135	NC_004350	AT	3	6	6655	6660	50 %	50 %	0 %	0 %	24378538
136	NC_004350	TGT	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378538
137	NC_004350	T	6	6	6742	6747	0 %	100 %	0 %	0 %	24378538
138	NC_004350	ATT	2	6	6786	6791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378538
139	NC_004350	ATG	2	6	6903	6908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
140	NC_004350	TGA	2	6	6961	6966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
141	NC_004350	TGA	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378538
142	NC_004350	GAA	2	6	7037	7042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378538
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259	NC_004350	AGT	2	6	12343	12348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378544
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270	NC_004350	T	7	7	12768	12774	0 %	100 %	0 %	0 %	24378545
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272	NC_004350	TTAC	2	8	12854	12861	25 %	50 %	0 %	25 %	24378545
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500	NC_004350	TC	3	6	28947	28952	0 %	50 %	0 %	50 %	24378553

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