MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47502	NC_004347	CCT	2	6	3264358	3264363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24374652
47503	NC_004347	CAC	2	6	3264368	3264373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374652
47504	NC_004347	AGA	2	6	3264536	3264541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24374652
47505	NC_004347	AAAG	2	8	3264675	3264682	75 %	0 %	25 %	0 %	24374652
47506	NC_004347	GCA	2	6	3264725	3264730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374652
47507	NC_004347	ACT	2	6	3264732	3264737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374652
47508	NC_004347	ATTTT	2	10	3264857	3264866	20 %	80 %	0 %	0 %	24374653
47509	NC_004347	GCT	2	6	3264931	3264936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374653
47510	NC_004347	CTT	2	6	3264946	3264951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24374653
47511	NC_004347	CGG	2	6	3264979	3264984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24374653
47512	NC_004347	ATC	2	6	3264998	3265003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374653
47513	NC_004347	GTG	2	6	3265035	3265040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24374653
47514	NC_004347	GCC	2	6	3265079	3265084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24374653
47515	NC_004347	TTC	2	6	3265093	3265098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24374653
47516	NC_004347	C	7	7	3265216	3265222	0 %	0 %	0 %	100 %	24374653
47517	NC_004347	CTG	2	6	3265304	3265309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374653
47518	NC_004347	A	6	6	3265385	3265390	100 %	0 %	0 %	0 %	24374653
47519	NC_004347	GTGGC	2	10	3265461	3265470	0 %	20 %	60 %	20 %	24374653
47520	NC_004347	TG	3	6	3265499	3265504	0 %	50 %	50 %	0 %	24374653
47521	NC_004347	TGC	2	6	3265698	3265703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374653
47522	NC_004347	TAT	2	6	3265708	3265713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24374653
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47525	NC_004347	ATT	2	6	3265766	3265771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24374653
47526	NC_004347	CTT	2	6	3265810	3265815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24374653
47527	NC_004347	CTG	2	6	3265832	3265837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374653
47528	NC_004347	GCC	2	6	3265841	3265846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24374653
47529	NC_004347	CCTAT	2	10	3265889	3265898	20 %	40 %	0 %	40 %	24374653
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47531	NC_004347	TGG	2	6	3265950	3265955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24374653
47532	NC_004347	CGC	2	6	3265980	3265985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24374653
47533	NC_004347	TTGG	2	8	3266034	3266041	0 %	50 %	50 %	0 %	24374653
47534	NC_004347	CTT	2	6	3266083	3266088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24374653
47535	NC_004347	CAATT	2	10	3268073	3268082	40 %	40 %	0 %	20 %	24374654
47536	NC_004347	TCA	2	6	3268099	3268104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374654
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47538	NC_004347	ACT	2	6	3268202	3268207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374654
47539	NC_004347	CTGGG	2	10	3268217	3268226	0 %	20 %	60 %	20 %	24374654
47540	NC_004347	GTG	2	6	3268227	3268232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24374654
47541	NC_004347	GCA	2	6	3268277	3268282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374654
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47545	NC_004347	AC	3	6	3268570	3268575	50 %	0 %	0 %	50 %	24374654
47546	NC_004347	TCG	2	6	3268669	3268674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374654
47547	NC_004347	TTGA	2	8	3268704	3268711	25 %	50 %	25 %	0 %	24374654
47548	NC_004347	GGC	2	6	3268791	3268796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24374654
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47550	NC_004347	CGC	2	6	3268925	3268930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24374654
47551	NC_004347	TG	3	6	3268954	3268959	0 %	50 %	50 %	0 %	24374654
47552	NC_004347	CGC	2	6	3269034	3269039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24374654
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47560	NC_004347	CGA	2	6	3269432	3269437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374654
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47562	NC_004347	CAT	2	6	3269574	3269579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562126
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47573	NC_004347	CAGC	2	8	3270207	3270214	25 %	0 %	25 %	50 %	414562126
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47602	NC_004347	CTG	2	6	3272235	3272240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562126
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47604	NC_004347	GATA	2	8	3272330	3272337	50 %	25 %	25 %	0 %	414562126
47605	NC_004347	TA	3	6	3272394	3272399	50 %	50 %	0 %	0 %	414562126
47606	NC_004347	TAA	2	6	3272410	3272415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562126
47607	NC_004347	A	6	6	3272453	3272458	100 %	0 %	0 %	0 %	414562126
47608	NC_004347	AATA	2	8	3272463	3272470	75 %	25 %	0 %	0 %	414562126
47609	NC_004347	GC	3	6	3272482	3272487	0 %	0 %	50 %	50 %	414562126
47610	NC_004347	GGACGA	2	12	3272539	3272550	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	414562126
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47612	NC_004347	ACC	2	6	3273141	3273146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374655
47613	NC_004347	TAA	2	6	3273209	3273214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374655
47614	NC_004347	CAA	2	6	3273292	3273297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24374655
47615	NC_004347	GCT	2	6	3273307	3273312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374655
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