MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_004347	TCAAT	2	10	2918061	2918070	40 %	40 %	0 %	20 %	24374331
42502	NC_004347	TTG	2	6	2918171	2918176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24374331
42503	NC_004347	CTG	2	6	2918224	2918229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374331
42504	NC_004347	AGC	2	6	2918261	2918266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374331
42505	NC_004347	CAC	2	6	2918427	2918432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374331
42506	NC_004347	ATGG	2	8	2918474	2918481	25 %	25 %	50 %	0 %	24374331
42507	NC_004347	GCA	2	6	2918556	2918561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374331
42508	NC_004347	ACCTT	2	10	2918751	2918760	20 %	40 %	0 %	40 %	24374331
42509	NC_004347	GAT	2	6	2918866	2918871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24374331
42510	NC_004347	A	6	6	2918918	2918923	100 %	0 %	0 %	0 %	24374331
42511	NC_004347	CAA	2	6	2918953	2918958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24374331
42512	NC_004347	AATCA	2	10	2918959	2918968	60 %	20 %	0 %	20 %	24374331
42513	NC_004347	TTG	2	6	2919050	2919055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24374331
42514	NC_004347	T	6	6	2919199	2919204	0 %	100 %	0 %	0 %	24374331
42515	NC_004347	TCT	2	6	2919274	2919279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24374331
42516	NC_004347	TTA	2	6	2919453	2919458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24374331
42517	NC_004347	CCA	2	6	2919581	2919586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374331
42518	NC_004347	GTAG	2	8	2919688	2919695	25 %	25 %	50 %	0 %	24374331
42519	NC_004347	CAT	3	9	2919696	2919704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374331
42520	NC_004347	AGCA	2	8	2919836	2919843	50 %	0 %	25 %	25 %	24374331
42521	NC_004347	TGC	2	6	2919884	2919889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374331
42522	NC_004347	ATG	2	6	2919949	2919954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24374331
42523	NC_004347	GCTG	2	8	2919963	2919970	0 %	25 %	50 %	25 %	24374331
42524	NC_004347	GAG	2	6	2920147	2920152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24374331
42525	NC_004347	CAC	2	6	2920155	2920160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374331
42526	NC_004347	GA	3	6	2920240	2920245	50 %	0 %	50 %	0 %	24374331
42527	NC_004347	TCC	2	6	2920304	2920309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24374331
42528	NC_004347	TCAA	2	8	2920328	2920335	50 %	25 %	0 %	25 %	24374331
42529	NC_004347	ATA	2	6	2920371	2920376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374331
42530	NC_004347	ATT	2	6	2920578	2920583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24374332
42531	NC_004347	TTG	2	6	2920608	2920613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24374332
42532	NC_004347	AAC	2	6	2920660	2920665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24374332
42533	NC_004347	A	7	7	2920784	2920790	100 %	0 %	0 %	0 %	24374332
42534	NC_004347	TCA	2	6	2920810	2920815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374332
42535	NC_004347	GCAA	2	8	2920825	2920832	50 %	0 %	25 %	25 %	24374332
42536	NC_004347	GAA	2	6	2920854	2920859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24374332
42537	NC_004347	ATC	2	6	2920896	2920901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374332
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42539	NC_004347	AAC	2	6	2920995	2921000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24374333
42540	NC_004347	ACC	2	6	2921016	2921021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374333
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42542	NC_004347	TAA	2	6	2921182	2921187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374333
42543	NC_004347	CAA	2	6	2921194	2921199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24374333
42544	NC_004347	GAG	2	6	2921351	2921356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24374333
42545	NC_004347	CCAA	2	8	2921378	2921385	50 %	0 %	0 %	50 %	24374333
42546	NC_004347	A	6	6	2921412	2921417	100 %	0 %	0 %	0 %	24374333
42547	NC_004347	TAA	2	6	2921483	2921488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374333
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42551	NC_004347	CAT	2	6	2921645	2921650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374333
42552	NC_004347	ATT	2	6	2921837	2921842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24374334
42553	NC_004347	GCT	2	6	2921845	2921850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374334
42554	NC_004347	GCA	2	6	2921866	2921871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374334
42555	NC_004347	CAC	2	6	2921921	2921926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374334
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42557	NC_004347	GGA	2	6	2921978	2921983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24374334
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42561	NC_004347	TTGAG	2	10	2922175	2922184	20 %	40 %	40 %	0 %	24374334
42562	NC_004347	TCGGG	2	10	2922198	2922207	0 %	20 %	60 %	20 %	24374334
42563	NC_004347	AAG	2	6	2922229	2922234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24374334
42564	NC_004347	GAG	2	6	2922243	2922248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24374334
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42567	NC_004347	AC	3	6	2922526	2922531	50 %	0 %	0 %	50 %	24374335
42568	NC_004347	GCAA	2	8	2922535	2922542	50 %	0 %	25 %	25 %	24374335
42569	NC_004347	T	6	6	2922584	2922589	0 %	100 %	0 %	0 %	24374336
42570	NC_004347	ACC	2	6	2922667	2922672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374336
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42583	NC_004347	TGGC	2	8	2923231	2923238	0 %	25 %	50 %	25 %	24374336
42584	NC_004347	GCA	2	6	2923257	2923262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374336
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42586	NC_004347	TACCAC	2	12	2923381	2923392	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	24374336
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42589	NC_004347	TAAC	2	8	2923555	2923562	50 %	25 %	0 %	25 %	24374336
42590	NC_004347	CCA	2	6	2923611	2923616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374337
42591	NC_004347	CTG	2	6	2923757	2923762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374337
42592	NC_004347	TCA	2	6	2923803	2923808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374337
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42597	NC_004347	ATAGGC	2	12	2923997	2924008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24374337
42598	NC_004347	TGT	2	6	2924011	2924016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24374337
42599	NC_004347	ATCGT	2	10	2924022	2924031	20 %	40 %	20 %	20 %	24374337
42600	NC_004347	TGC	2	6	2924046	2924051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374337
42601	NC_004347	CAT	2	6	2924107	2924112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374337
42602	NC_004347	CTAAGG	2	12	2924200	2924211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24374337
42603	NC_004347	T	6	6	2924239	2924244	0 %	100 %	0 %	0 %	24374337
42604	NC_004347	GCG	2	6	2924252	2924257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24374337
42605	NC_004347	TGC	2	6	2924381	2924386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374337
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42608	NC_004347	ATA	2	6	2924556	2924561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374337
42609	NC_004347	TGGC	2	8	2924564	2924571	0 %	25 %	50 %	25 %	24374337
42610	NC_004347	CG	3	6	2924637	2924642	0 %	0 %	50 %	50 %	24374337
42611	NC_004347	CCA	2	6	2924658	2924663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374337
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42616	NC_004347	TAA	2	6	2925128	2925133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374337
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42618	NC_004347	CAA	2	6	2925256	2925261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24374337
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