MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_004347	CCG	2	6	2817532	2817537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24374240
41003	NC_004347	TAA	2	6	2817578	2817583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374240
41004	NC_004347	GCT	2	6	2817707	2817712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374240
41005	NC_004347	CG	3	6	2817713	2817718	0 %	0 %	50 %	50 %	24374240
41006	NC_004347	GTG	2	6	2817733	2817738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24374240
41007	NC_004347	TGC	2	6	2817896	2817901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374240
41008	NC_004347	GGC	2	6	2817939	2817944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24374240
41009	NC_004347	GAA	2	6	2818005	2818010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24374240
41010	NC_004347	ACC	2	6	2818014	2818019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374240
41011	NC_004347	GCT	2	6	2818029	2818034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374240
41012	NC_004347	GCA	2	6	2818060	2818065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374240
41013	NC_004347	GAA	2	6	2818182	2818187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24374240
41014	NC_004347	TA	3	6	2818331	2818336	50 %	50 %	0 %	0 %	24374241
41015	NC_004347	GCT	2	6	2818342	2818347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374241
41016	NC_004347	CGC	2	6	2818361	2818366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24374241
41017	NC_004347	AGTG	2	8	2818393	2818400	25 %	25 %	50 %	0 %	24374241
41018	NC_004347	AGA	2	6	2818408	2818413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24374241
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41020	NC_004347	TTG	2	6	2818527	2818532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24374241
41021	NC_004347	A	6	6	2818583	2818588	100 %	0 %	0 %	0 %	24374241
41022	NC_004347	ATC	2	6	2818670	2818675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374241
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41024	NC_004347	GTTC	2	8	2818755	2818762	0 %	50 %	25 %	25 %	24374241
41025	NC_004347	ATC	2	6	2818766	2818771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24374241
41026	NC_004347	CAG	2	6	2818839	2818844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374241
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41028	NC_004347	TTG	2	6	2819018	2819023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562063
41029	NC_004347	TGGT	2	8	2819179	2819186	0 %	50 %	50 %	0 %	414562063
41030	NC_004347	ACC	2	6	2819203	2819208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562063
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41032	NC_004347	GTG	3	9	2819296	2819304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562063
41033	NC_004347	ATCACC	2	12	2819344	2819355	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414562063
41034	NC_004347	GAT	2	6	2819362	2819367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562063
41035	NC_004347	CGT	2	6	2819472	2819477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374243
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41039	NC_004347	TGA	2	6	2819718	2819723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24374243
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41043	NC_004347	TTG	2	6	2819829	2819834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24374243
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41047	NC_004347	GTTT	2	8	2820082	2820089	0 %	75 %	25 %	0 %	24374243
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41051	NC_004347	TA	3	6	2820213	2820218	50 %	50 %	0 %	0 %	24374243
41052	NC_004347	ACC	2	6	2820431	2820436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374243
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41054	NC_004347	GC	3	6	2820531	2820536	0 %	0 %	50 %	50 %	24374244
41055	NC_004347	CTCG	2	8	2820540	2820547	0 %	25 %	25 %	50 %	24374244
41056	NC_004347	TA	3	6	2820551	2820556	50 %	50 %	0 %	0 %	24374244
41057	NC_004347	GAT	2	6	2820655	2820660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24374244
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41078	NC_004347	TTTC	2	8	2821747	2821754	0 %	75 %	0 %	25 %	24374245
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41083	NC_004347	T	7	7	2821967	2821973	0 %	100 %	0 %	0 %	24374245
41084	NC_004347	CA	3	6	2822086	2822091	50 %	0 %	0 %	50 %	24374245
41085	NC_004347	T	6	6	2822171	2822176	0 %	100 %	0 %	0 %	24374245
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41089	NC_004347	TCT	2	6	2822313	2822318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24374245
41090	NC_004347	ATG	2	6	2822329	2822334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24374245
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41102	NC_004347	T	6	6	2822996	2823001	0 %	100 %	0 %	0 %	24374246
41103	NC_004347	CAC	2	6	2823113	2823118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24374246
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41106	NC_004347	GATACT	2	12	2823160	2823171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24374246
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41116	NC_004347	T	6	6	2823908	2823913	0 %	100 %	0 %	0 %	24374246
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41118	NC_004347	T	6	6	2824030	2824035	0 %	100 %	0 %	0 %	24374246
41119	NC_004347	ATA	2	6	2824092	2824097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374246
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41121	NC_004347	ATA	2	6	2824216	2824221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374246
41122	NC_004347	TTCA	2	8	2824229	2824236	25 %	50 %	0 %	25 %	24374246
41123	NC_004347	TAT	2	6	2824249	2824254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24374246
41124	NC_004347	CTT	2	6	2824255	2824260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24374246
41125	NC_004347	TCT	2	6	2824267	2824272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24374246
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41127	NC_004347	CCTT	2	8	2824518	2824525	0 %	50 %	0 %	50 %	24374246
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41204	NC_004347	GTTC	2	8	2829641	2829648	0 %	50 %	25 %	25 %	24374252
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41209	NC_004347	TTTA	2	8	2829990	2829997	25 %	75 %	0 %	0 %	24374252
41210	NC_004347	T	7	7	2830106	2830112	0 %	100 %	0 %	0 %	24374252
41211	NC_004347	CAAG	2	8	2830287	2830294	50 %	0 %	25 %	25 %	24374253
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41224	NC_004347	TGC	2	6	2830737	2830742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24374253
41225	NC_004347	AAT	2	6	2830800	2830805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374253
41226	NC_004347	GCA	2	6	2830807	2830812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374253
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41228	NC_004347	GAT	2	6	2831119	2831124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24374253
41229	NC_004347	AAC	2	6	2831184	2831189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24374253
41230	NC_004347	TCGG	2	8	2831210	2831217	0 %	25 %	50 %	25 %	24374253
41231	NC_004347	ACCC	2	8	2831287	2831294	25 %	0 %	0 %	75 %	24374253
41232	NC_004347	CCTG	2	8	2831328	2831335	0 %	25 %	25 %	50 %	24374253
41233	NC_004347	CTC	2	6	2831363	2831368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24374253
41234	NC_004347	GCA	2	6	2831380	2831385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374253
41235	NC_004347	GAC	2	6	2831502	2831507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374254
41236	NC_004347	GTGCG	2	10	2831517	2831526	0 %	20 %	60 %	20 %	24374254
41237	NC_004347	ATA	2	6	2831571	2831576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374254
41238	NC_004347	ATG	2	6	2831577	2831582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24374254
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41240	NC_004347	GGT	2	6	2831680	2831685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24374254
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41242	NC_004347	GCA	2	6	2831708	2831713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24374254
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41252	NC_004347	GGC	2	6	2832318	2832323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24374255
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41339	NC_004347	TTAA	2	8	2837587	2837594	50 %	50 %	0 %	0 %	24374260
41340	NC_004347	CCATG	2	10	2837627	2837636	20 %	20 %	20 %	40 %	24374260
41341	NC_004347	AT	3	6	2837737	2837742	50 %	50 %	0 %	0 %	24374260
41342	NC_004347	ATA	2	6	2837767	2837772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24374260
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41353	NC_004347	CGCA	2	8	2839021	2839028	25 %	0 %	25 %	50 %	24374262
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