MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_004347	AAG	2	6	2412401	2412406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562021
35003	NC_004347	CAG	2	6	2412408	2412413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562021
35004	NC_004347	GAA	2	6	2412443	2412448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562021
35005	NC_004347	TGGTG	2	10	2412499	2412508	0 %	40 %	60 %	0 %	414562021
35006	NC_004347	AGA	2	6	2412651	2412656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562021
35007	NC_004347	CAGGTT	2	12	2412665	2412676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414562021
35008	NC_004347	AAATT	2	10	2412681	2412690	60 %	40 %	0 %	0 %	414562021
35009	NC_004347	CCA	2	6	2412805	2412810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562021
35010	NC_004347	GTT	2	6	2412866	2412871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562021
35011	NC_004347	CAT	2	6	2412904	2412909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562021
35012	NC_004347	GCAA	2	8	2413087	2413094	50 %	0 %	25 %	25 %	24373854
35013	NC_004347	TAAGCG	2	12	2413130	2413141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24373854
35014	NC_004347	CG	3	6	2413190	2413195	0 %	0 %	50 %	50 %	24373854
35015	NC_004347	GTG	2	6	2413247	2413252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24373855
35016	NC_004347	GCTCGT	2	12	2413258	2413269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24373855
35017	NC_004347	TTA	2	6	2413299	2413304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24373855
35018	NC_004347	CGT	2	6	2413378	2413383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24373855
35019	NC_004347	A	6	6	2413387	2413392	100 %	0 %	0 %	0 %	24373855
35020	NC_004347	TGC	2	6	2413428	2413433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24373855
35021	NC_004347	GTCT	2	8	2413448	2413455	0 %	50 %	25 %	25 %	24373855
35022	NC_004347	TCA	2	6	2413466	2413471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24373855
35023	NC_004347	ATCG	2	8	2413498	2413505	25 %	25 %	25 %	25 %	24373855
35024	NC_004347	AAG	2	6	2413571	2413576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24373855
35025	NC_004347	ATT	2	6	2413768	2413773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24373856
35026	NC_004347	AC	3	6	2413879	2413884	50 %	0 %	0 %	50 %	24373856
35027	NC_004347	CGA	2	6	2413999	2414004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24373856
35028	NC_004347	AC	3	6	2414005	2414010	50 %	0 %	0 %	50 %	24373856
35029	NC_004347	T	6	6	2414167	2414172	0 %	100 %	0 %	0 %	24373856
35030	NC_004347	GAACG	2	10	2414175	2414184	40 %	0 %	40 %	20 %	24373856
35031	NC_004347	CGG	2	6	2414190	2414195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24373856
35032	NC_004347	CGG	2	6	2414212	2414217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24373856
35033	NC_004347	CTT	2	6	2414239	2414244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24373856
35034	NC_004347	CCA	2	6	2414262	2414267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24373856
35035	NC_004347	AGA	2	6	2414293	2414298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24373856
35036	NC_004347	CGC	2	6	2414326	2414331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24373856
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35038	NC_004347	TCAG	2	8	2414448	2414455	25 %	25 %	25 %	25 %	24373856
35039	NC_004347	TCT	2	6	2414547	2414552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24373856
35040	NC_004347	GTT	2	6	2414586	2414591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24373856
35041	NC_004347	TGC	2	6	2414604	2414609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24373856
35042	NC_004347	GC	4	8	2414640	2414647	0 %	0 %	50 %	50 %	24373856
35043	NC_004347	CTT	2	6	2415027	2415032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562022
35044	NC_004347	TAA	2	6	2415088	2415093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562022
35045	NC_004347	CTT	2	6	2415096	2415101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562022
35046	NC_004347	CA	3	6	2415196	2415201	50 %	0 %	0 %	50 %	414562022
35047	NC_004347	ACG	2	6	2415209	2415214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562022
35048	NC_004347	GTT	2	6	2415245	2415250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562022
35049	NC_004347	GCC	2	6	2415271	2415276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414562022
35050	NC_004347	CAA	2	6	2415294	2415299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562022
35051	NC_004347	AC	3	6	2415372	2415377	50 %	0 %	0 %	50 %	414562022
35052	NC_004347	CTG	2	6	2415447	2415452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562022
35053	NC_004347	TGC	2	6	2415489	2415494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562022
35054	NC_004347	GCG	2	6	2415539	2415544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414562022
35055	NC_004347	CCA	2	6	2415563	2415568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562022
35056	NC_004347	ATG	2	6	2415569	2415574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562022
35057	NC_004347	ACC	2	6	2415604	2415609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562022
35058	NC_004347	TAA	2	6	2415610	2415615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562022
35059	NC_004347	ACC	2	6	2415625	2415630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562022
35060	NC_004347	GCCA	2	8	2415676	2415683	25 %	0 %	25 %	50 %	414562022
35061	NC_004347	CAC	2	6	2415756	2415761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562022
35062	NC_004347	TCT	2	6	2415773	2415778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562022
35063	NC_004347	ATC	2	6	2415878	2415883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562022
35064	NC_004347	CAG	3	9	2415903	2415911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562022
35065	NC_004347	CAA	2	6	2415984	2415989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562022
35066	NC_004347	AAT	2	6	2416081	2416086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562022
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35069	NC_004347	ATCG	2	8	2416312	2416319	25 %	25 %	25 %	25 %	24373857
35070	NC_004347	AT	3	6	2416437	2416442	50 %	50 %	0 %	0 %	24373857
35071	NC_004347	GAT	2	6	2416570	2416575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24373857
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35083	NC_004347	ACT	2	6	2417401	2417406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24373858
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35090	NC_004347	TTA	2	6	2417571	2417576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24373858
35091	NC_004347	GTTG	2	8	2417623	2417630	0 %	50 %	50 %	0 %	24373858
35092	NC_004347	A	6	6	2417641	2417646	100 %	0 %	0 %	0 %	24373858
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35100	NC_004347	CAA	2	6	2417970	2417975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24373858
35101	NC_004347	GAC	2	6	2418072	2418077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24373858
35102	NC_004347	GAT	3	9	2418111	2418119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24373858
35103	NC_004347	TGAT	2	8	2418151	2418158	25 %	50 %	25 %	0 %	24373858
35104	NC_004347	GAT	2	6	2418165	2418170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24373858
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35107	NC_004347	GAA	2	6	2418399	2418404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24373858
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35112	NC_004347	GAAG	2	8	2418962	2418969	50 %	0 %	50 %	0 %	24373858
35113	NC_004347	TGCGC	2	10	2418977	2418986	0 %	20 %	40 %	40 %	24373858
35114	NC_004347	GT	3	6	2418989	2418994	0 %	50 %	50 %	0 %	24373858
35115	NC_004347	ATG	2	6	2419029	2419034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24373858
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35117	NC_004347	GTC	2	6	2419118	2419123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24373858
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35231	NC_004347	A	6	6	2428845	2428850	100 %	0 %	0 %	0 %	24373867
35232	NC_004347	GAA	2	6	2428914	2428919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24373867
35233	NC_004347	C	7	7	2428965	2428971	0 %	0 %	0 %	100 %	24373867
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35348	NC_004347	A	7	7	2436981	2436987	100 %	0 %	0 %	0 %	24373874
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