MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004347	A	6	6	191219	191224	100 %	0 %	0 %	0 %	24371787
3002	NC_004347	TGA	2	6	191235	191240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371787
3003	NC_004347	CT	3	6	191275	191280	0 %	50 %	0 %	50 %	24371787
3004	NC_004347	TA	3	6	191299	191304	50 %	50 %	0 %	0 %	24371787
3005	NC_004347	ACA	2	6	191349	191354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371787
3006	NC_004347	CAA	2	6	191388	191393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371788
3007	NC_004347	TGA	2	6	191432	191437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371788
3008	NC_004347	GTC	2	6	191505	191510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371788
3009	NC_004347	T	6	6	191535	191540	0 %	100 %	0 %	0 %	24371788
3010	NC_004347	CGC	2	6	191611	191616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371788
3011	NC_004347	GAT	2	6	191667	191672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371788
3012	NC_004347	GCT	2	6	191681	191686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371788
3013	NC_004347	TGA	2	6	191687	191692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371788
3014	NC_004347	TTAA	2	8	191742	191749	50 %	50 %	0 %	0 %	24371788
3015	NC_004347	TTG	2	6	191913	191918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371788
3016	NC_004347	AGCC	2	8	191926	191933	25 %	0 %	25 %	50 %	24371788
3017	NC_004347	CGC	2	6	192114	192119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371788
3018	NC_004347	T	7	7	192185	192191	0 %	100 %	0 %	0 %	24371788
3019	NC_004347	CAA	2	6	192261	192266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371788
3020	NC_004347	GAG	2	6	192270	192275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371788
3021	NC_004347	GTT	2	6	192318	192323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371788
3022	NC_004347	GCT	2	6	192398	192403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371788
3023	NC_004347	GAT	2	6	192411	192416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371788
3024	NC_004347	AGG	2	6	192473	192478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371788
3025	NC_004347	AT	3	6	192498	192503	50 %	50 %	0 %	0 %	24371789
3026	NC_004347	GTT	3	9	192523	192531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371789
3027	NC_004347	GCAG	2	8	192547	192554	25 %	0 %	50 %	25 %	24371789
3028	NC_004347	CCAT	2	8	192557	192564	25 %	25 %	0 %	50 %	24371789
3029	NC_004347	ATC	2	6	192571	192576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371789
3030	NC_004347	AGC	2	6	192615	192620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3031	NC_004347	A	6	6	192621	192626	100 %	0 %	0 %	0 %	24371789
3032	NC_004347	GCA	2	6	192631	192636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3033	NC_004347	CCT	2	6	192660	192665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371789
3034	NC_004347	AGA	2	6	192709	192714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371789
3035	NC_004347	T	6	6	192730	192735	0 %	100 %	0 %	0 %	24371789
3036	NC_004347	ATC	2	6	192757	192762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371789
3037	NC_004347	GTT	2	6	192767	192772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371789
3038	NC_004347	CGA	2	6	192777	192782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3039	NC_004347	TAA	2	6	192808	192813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371789
3040	NC_004347	T	6	6	192828	192833	0 %	100 %	0 %	0 %	24371789
3041	NC_004347	AC	3	6	192921	192926	50 %	0 %	0 %	50 %	24371789
3042	NC_004347	CTTT	2	8	192937	192944	0 %	75 %	0 %	25 %	24371789
3043	NC_004347	GCG	2	6	192971	192976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3044	NC_004347	GGC	2	6	192989	192994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3045	NC_004347	GGT	2	6	193058	193063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3046	NC_004347	C	7	7	193149	193155	0 %	0 %	0 %	100 %	24371789
3047	NC_004347	GAT	2	6	193157	193162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3048	NC_004347	TAA	2	6	193189	193194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371789
3049	NC_004347	TTC	2	6	193390	193395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371789
3050	NC_004347	TGC	2	6	193411	193416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3051	NC_004347	CGTGCG	2	12	193441	193452	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24371789
3052	NC_004347	GAA	2	6	193481	193486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371789
3053	NC_004347	GGT	2	6	193501	193506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3054	NC_004347	CCA	2	6	193566	193571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371789
3055	NC_004347	TGA	2	6	193621	193626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3056	NC_004347	GGC	2	6	193651	193656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3057	NC_004347	CTG	2	6	193668	193673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3058	NC_004347	CCA	2	6	193758	193763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371789
3059	NC_004347	GCT	2	6	193796	193801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3060	NC_004347	CTG	2	6	193872	193877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3061	NC_004347	CGG	2	6	193921	193926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3062	NC_004347	AACG	2	8	194059	194066	50 %	0 %	25 %	25 %	24371789
3063	NC_004347	TAC	2	6	194164	194169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371789
3064	NC_004347	CAG	2	6	194187	194192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3065	NC_004347	TCAGCT	2	12	194223	194234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	24371789
3066	NC_004347	GCG	2	6	194265	194270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3067	NC_004347	CCG	2	6	194289	194294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371789
3068	NC_004347	CGT	2	6	194380	194385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3069	NC_004347	GGC	2	6	194465	194470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3070	NC_004347	TGC	2	6	194620	194625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3071	NC_004347	GCC	3	9	194864	194872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371789
3072	NC_004347	TGT	2	6	194902	194907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371789
3073	NC_004347	CAA	2	6	194919	194924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371789
3074	NC_004347	CTG	2	6	194937	194942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3075	NC_004347	TTG	2	6	194967	194972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371789
3076	NC_004347	CCG	2	6	195026	195031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371789
3077	NC_004347	CGG	2	6	195126	195131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3078	NC_004347	GCA	2	6	195173	195178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3079	NC_004347	GT	4	8	195291	195298	0 %	50 %	50 %	0 %	24371789
3080	NC_004347	GGC	2	6	195385	195390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3081	NC_004347	TTCA	2	8	195406	195413	25 %	50 %	0 %	25 %	24371789
3082	NC_004347	CAA	2	6	195441	195446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371789
3083	NC_004347	TGG	2	6	195508	195513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3084	NC_004347	TGG	2	6	195550	195555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3085	NC_004347	CTT	2	6	195612	195617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371789
3086	NC_004347	ATT	2	6	195704	195709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371789
3087	NC_004347	TGG	2	6	195762	195767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3088	NC_004347	GGT	2	6	195895	195900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3089	NC_004347	ATG	2	6	195969	195974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3090	NC_004347	GCG	2	6	196019	196024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371789
3091	NC_004347	GCTG	2	8	196098	196105	0 %	25 %	50 %	25 %	24371789
3092	NC_004347	AGT	2	6	196160	196165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3093	NC_004347	TAC	2	6	196176	196181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371789
3094	NC_004347	GGT	2	6	196196	196201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3095	NC_004347	GCAGA	2	10	196208	196217	40 %	0 %	40 %	20 %	24371789
3096	NC_004347	ATG	2	6	196245	196250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3097	NC_004347	GCCA	2	8	196283	196290	25 %	0 %	25 %	50 %	24371789
3098	NC_004347	GCTG	2	8	196374	196381	0 %	25 %	50 %	25 %	24371789
3099	NC_004347	TAG	2	6	196503	196508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3100	NC_004347	ATG	2	6	196521	196526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3101	NC_004347	GCCA	2	8	196559	196566	25 %	0 %	25 %	50 %	24371789
3102	NC_004347	GCTG	2	8	196650	196657	0 %	25 %	50 %	25 %	24371789
3103	NC_004347	GGT	2	6	196723	196728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3104	NC_004347	ATG	2	6	196797	196802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3105	NC_004347	GAA	2	6	196835	196840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371789
3106	NC_004347	TG	3	6	196948	196953	0 %	50 %	50 %	0 %	24371789
3107	NC_004347	GCC	2	6	197081	197086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371789
3108	NC_004347	CGA	2	6	197112	197117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3109	NC_004347	TAA	2	6	197296	197301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371789
3110	NC_004347	TTA	2	6	197364	197369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371789
3111	NC_004347	TGA	2	6	197377	197382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3112	NC_004347	GGCA	2	8	197523	197530	25 %	0 %	50 %	25 %	24371789
3113	NC_004347	CAA	2	6	197545	197550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371789
3114	NC_004347	TAG	2	6	197710	197715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3115	NC_004347	GTA	2	6	197853	197858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3116	NC_004347	TGA	2	6	197874	197879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3117	NC_004347	CAC	2	6	197898	197903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371789
3118	NC_004347	CAG	3	9	197933	197941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3119	NC_004347	TGG	2	6	197959	197964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371789
3120	NC_004347	CGGA	2	8	198054	198061	25 %	0 %	50 %	25 %	24371789
3121	NC_004347	TTC	2	6	198071	198076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371789
3122	NC_004347	GCA	2	6	198083	198088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371789
3123	NC_004347	GAT	2	6	198128	198133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3124	NC_004347	AAG	2	6	198240	198245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371789
3125	NC_004347	GTGATA	2	12	198252	198263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
3126	NC_004347	ATT	2	6	198279	198284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371789
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3139	NC_004347	AGT	2	6	199052	199057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371789
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3248	NC_004347	GCC	2	6	205781	205786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371795
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3363	NC_004347	CAT	2	6	214891	214896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561742
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3370	NC_004347	CTG	2	6	215114	215119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561742
3371	NC_004347	GAT	2	6	215212	215217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561742
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3497	NC_004347	CTAA	2	8	230928	230935	50 %	25 %	0 %	25 %	24371819
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