MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_004347	GCG	2	6	1420911	1420916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561892
21002	NC_004347	GACAAC	2	12	1421178	1421189	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24372943
21003	NC_004347	TTAT	2	8	1421287	1421294	25 %	75 %	0 %	0 %	24372943
21004	NC_004347	AC	3	6	1421310	1421315	50 %	0 %	0 %	50 %	24372943
21005	NC_004347	CTA	2	6	1421363	1421368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372943
21006	NC_004347	TTGC	2	8	1421400	1421407	0 %	50 %	25 %	25 %	24372943
21007	NC_004347	TAT	2	6	1421445	1421450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372943
21008	NC_004347	GGTT	2	8	1421476	1421483	0 %	50 %	50 %	0 %	24372943
21009	NC_004347	TTGCTG	2	12	1421683	1421694	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	24372944
21010	NC_004347	TGG	2	6	1421709	1421714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372944
21011	NC_004347	TGT	2	6	1421795	1421800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372944
21012	NC_004347	GGT	2	6	1421902	1421907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372944
21013	NC_004347	TAC	2	6	1421914	1421919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372944
21014	NC_004347	AAG	2	6	1422019	1422024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372944
21015	NC_004347	ATG	2	6	1422077	1422082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372944
21016	NC_004347	GGTT	2	8	1422089	1422096	0 %	50 %	50 %	0 %	24372944
21017	NC_004347	TTTG	2	8	1422162	1422169	0 %	75 %	25 %	0 %	24372944
21018	NC_004347	CAT	2	6	1422223	1422228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372944
21019	NC_004347	GAA	2	6	1422247	1422252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372944
21020	NC_004347	CTTA	2	8	1422273	1422280	25 %	50 %	0 %	25 %	24372944
21021	NC_004347	GT	3	6	1422317	1422322	0 %	50 %	50 %	0 %	24372944
21022	NC_004347	ATT	2	6	1422355	1422360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372944
21023	NC_004347	T	6	6	1422382	1422387	0 %	100 %	0 %	0 %	24372944
21024	NC_004347	T	6	6	1422439	1422444	0 %	100 %	0 %	0 %	24372944
21025	NC_004347	TGT	2	6	1422452	1422457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372944
21026	NC_004347	TGG	2	6	1422508	1422513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372944
21027	NC_004347	TGC	2	6	1422518	1422523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372944
21028	NC_004347	G	7	7	1422632	1422638	0 %	0 %	100 %	0 %	24372944
21029	NC_004347	GCGATG	2	12	1422661	1422672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	24372944
21030	NC_004347	ATT	2	6	1422688	1422693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372944
21031	NC_004347	CCG	2	6	1422801	1422806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372944
21032	NC_004347	GTT	2	6	1422817	1422822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372944
21033	NC_004347	CA	3	6	1422843	1422848	50 %	0 %	0 %	50 %	24372944
21034	NC_004347	ATG	2	6	1423001	1423006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372945
21035	NC_004347	GCA	2	6	1423078	1423083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372945
21036	NC_004347	TTG	2	6	1423191	1423196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372945
21037	NC_004347	GTT	2	6	1423228	1423233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372945
21038	NC_004347	GCC	2	6	1423263	1423268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372945
21039	NC_004347	CTC	2	6	1423274	1423279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372945
21040	NC_004347	AAT	2	6	1423308	1423313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372945
21041	NC_004347	AAC	2	6	1423377	1423382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372945
21042	NC_004347	CCG	2	6	1423414	1423419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372945
21043	NC_004347	CA	3	6	1423436	1423441	50 %	0 %	0 %	50 %	24372945
21044	NC_004347	GAT	2	6	1423481	1423486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372945
21045	NC_004347	CTT	2	6	1423489	1423494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372945
21046	NC_004347	CTT	2	6	1423543	1423548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372945
21047	NC_004347	GTT	2	6	1423552	1423557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372945
21048	NC_004347	AAC	2	6	1423846	1423851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372945
21049	NC_004347	TGC	2	6	1423899	1423904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372945
21050	NC_004347	TCGCT	2	10	1423906	1423915	0 %	40 %	20 %	40 %	24372945
21051	NC_004347	TTC	2	6	1423949	1423954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372945
21052	NC_004347	CAAC	2	8	1424032	1424039	50 %	0 %	0 %	50 %	24372945
21053	NC_004347	GGT	2	6	1424072	1424077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372945
21054	NC_004347	GTT	2	6	1424089	1424094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372945
21055	NC_004347	AACGGC	2	12	1424099	1424110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372945
21056	NC_004347	CAA	2	6	1424122	1424127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372945
21057	NC_004347	T	6	6	1424146	1424151	0 %	100 %	0 %	0 %	24372945
21058	NC_004347	GC	3	6	1424191	1424196	0 %	0 %	50 %	50 %	24372945
21059	NC_004347	CGG	2	6	1424218	1424223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372945
21060	NC_004347	TAT	2	6	1424227	1424232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372945
21061	NC_004347	ACTG	2	8	1424323	1424330	25 %	25 %	25 %	25 %	24372945
21062	NC_004347	TGC	2	6	1424374	1424379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372945
21063	NC_004347	GTC	2	6	1424415	1424420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372945
21064	NC_004347	TTGA	2	8	1424469	1424476	25 %	50 %	25 %	0 %	24372945
21065	NC_004347	GAC	2	6	1424587	1424592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372945
21066	NC_004347	TGT	2	6	1424661	1424666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372945
21067	NC_004347	TAG	2	6	1424804	1424809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372945
21068	NC_004347	GC	3	6	1424861	1424866	0 %	0 %	50 %	50 %	24372945
21069	NC_004347	GA	3	6	1424904	1424909	50 %	0 %	50 %	0 %	24372945
21070	NC_004347	ATT	2	6	1425341	1425346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372946
21071	NC_004347	GGC	2	6	1425401	1425406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372946
21072	NC_004347	GAC	2	6	1425524	1425529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372946
21073	NC_004347	CAC	2	6	1425611	1425616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372946
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21075	NC_004347	AGTG	2	8	1425711	1425718	25 %	25 %	50 %	0 %	24372946
21076	NC_004347	CA	3	6	1425773	1425778	50 %	0 %	0 %	50 %	24372946
21077	NC_004347	GGT	2	6	1425834	1425839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372946
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21081	NC_004347	TGGCGC	2	12	1426121	1426132	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24372946
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21083	NC_004347	GGC	2	6	1426267	1426272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372946
21084	NC_004347	GAA	2	6	1426306	1426311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372946
21085	NC_004347	CG	3	6	1426332	1426337	0 %	0 %	50 %	50 %	24372946
21086	NC_004347	GAC	2	6	1426394	1426399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372946
21087	NC_004347	TGG	2	6	1426451	1426456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372946
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21089	NC_004347	TGA	2	6	1426571	1426576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372946
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21091	NC_004347	TAA	2	6	1426668	1426673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372946
21092	NC_004347	CGC	2	6	1426700	1426705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372946
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21098	NC_004347	TTA	2	6	1427425	1427430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372947
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21101	NC_004347	G	6	6	1427687	1427692	0 %	0 %	100 %	0 %	24372947
21102	NC_004347	ATG	2	6	1427737	1427742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372947
21103	NC_004347	TGG	2	6	1427795	1427800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372947
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21105	NC_004347	TGA	2	6	1427831	1427836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372947
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21113	NC_004347	GTGG	2	8	1428307	1428314	0 %	25 %	75 %	0 %	24372948
21114	NC_004347	ATG	2	6	1428350	1428355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372948
21115	NC_004347	TGG	2	6	1428471	1428476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372948
21116	NC_004347	TGATGG	2	12	1428549	1428560	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	24372948
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21118	NC_004347	TA	3	6	1428735	1428740	50 %	50 %	0 %	0 %	24372948
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21236	NC_004347	AAT	2	6	1435305	1435310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372955
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21472	NC_004347	GCA	2	6	1450496	1450501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561897
21473	NC_004347	TATTT	2	10	1450525	1450534	20 %	80 %	0 %	0 %	414561897
21474	NC_004347	AAG	2	6	1450590	1450595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561897
21475	NC_004347	ACC	2	6	1450603	1450608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561897
21476	NC_004347	CGA	2	6	1450655	1450660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561897
21477	NC_004347	GAT	2	6	1450743	1450748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561897
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21479	NC_004347	TCAG	2	8	1451000	1451007	25 %	25 %	25 %	25 %	414561897
21480	NC_004347	TGC	2	6	1451045	1451050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561897
21481	NC_004347	ATTG	2	8	1451126	1451133	25 %	50 %	25 %	0 %	24372972
21482	NC_004347	TGCT	2	8	1451158	1451165	0 %	50 %	25 %	25 %	24372972
21483	NC_004347	AAT	3	9	1451180	1451188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372972
21484	NC_004347	TCT	2	6	1451206	1451211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372972
21485	NC_004347	ATA	2	6	1451239	1451244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372972
21486	NC_004347	ATG	2	6	1451304	1451309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372972
21487	NC_004347	T	6	6	1451389	1451394	0 %	100 %	0 %	0 %	24372972
21488	NC_004347	TGAA	2	8	1451459	1451466	50 %	25 %	25 %	0 %	24372972
21489	NC_004347	AGC	2	6	1451537	1451542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372972
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21491	NC_004347	GAT	2	6	1451594	1451599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372972
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21493	NC_004347	TGAT	2	8	1451908	1451915	25 %	50 %	25 %	0 %	24372972
21494	NC_004347	TCA	2	6	1451987	1451992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372972
21495	NC_004347	CAA	2	6	1452003	1452008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372972
21496	NC_004347	TAA	2	6	1452046	1452051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372972
21497	NC_004347	AGA	2	6	1452185	1452190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561898
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21499	NC_004347	GCG	2	6	1452319	1452324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561898
21500	NC_004347	CAG	2	6	1452354	1452359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561898

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