MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_004347	CGATG	2	10	1287818	1287827	20 %	20 %	40 %	20 %	24372817
19003	NC_004347	TAT	2	6	1287851	1287856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372817
19004	NC_004347	TAT	2	6	1287881	1287886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372817
19005	NC_004347	GCG	2	6	1287925	1287930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372817
19006	NC_004347	GTG	2	6	1287978	1287983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372817
19007	NC_004347	TG	3	6	1288063	1288068	0 %	50 %	50 %	0 %	24372818
19008	NC_004347	CCA	2	6	1288108	1288113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372818
19009	NC_004347	ATGTT	2	10	1288146	1288155	20 %	60 %	20 %	0 %	24372818
19010	NC_004347	TCA	2	6	1288219	1288224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372818
19011	NC_004347	GATG	2	8	1288228	1288235	25 %	25 %	50 %	0 %	24372818
19012	NC_004347	GC	3	6	1288299	1288304	0 %	0 %	50 %	50 %	24372818
19013	NC_004347	ATA	2	6	1288321	1288326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372818
19014	NC_004347	GAC	2	6	1288427	1288432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372818
19015	NC_004347	ATA	2	6	1288443	1288448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372818
19016	NC_004347	GAT	3	9	1288454	1288462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372818
19017	NC_004347	ATA	2	6	1288467	1288472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372818
19018	NC_004347	TCT	2	6	1288602	1288607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372819
19019	NC_004347	TCT	2	6	1288614	1288619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372819
19020	NC_004347	CCG	2	6	1288816	1288821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372819
19021	NC_004347	CTT	2	6	1288910	1288915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372819
19022	NC_004347	TGC	2	6	1288950	1288955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372819
19023	NC_004347	TCG	2	6	1289181	1289186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372819
19024	NC_004347	CGC	2	6	1289248	1289253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372819
19025	NC_004347	GTA	2	6	1289315	1289320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372819
19026	NC_004347	GGC	2	6	1289392	1289397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372819
19027	NC_004347	ATG	2	6	1289409	1289414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372819
19028	NC_004347	TTG	2	6	1289451	1289456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372819
19029	NC_004347	TTG	2	6	1289483	1289488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372819
19030	NC_004347	ATCTTT	2	12	1289555	1289566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	24372819
19031	NC_004347	ATC	2	6	1289736	1289741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372819
19032	NC_004347	T	6	6	1289766	1289771	0 %	100 %	0 %	0 %	24372819
19033	NC_004347	GCA	2	6	1289788	1289793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372819
19034	NC_004347	GCG	2	6	1289794	1289799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372819
19035	NC_004347	GA	3	6	1289872	1289877	50 %	0 %	50 %	0 %	24372819
19036	NC_004347	T	6	6	1289932	1289937	0 %	100 %	0 %	0 %	24372819
19037	NC_004347	TGC	2	6	1289943	1289948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372819
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19039	NC_004347	GCA	2	6	1289980	1289985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372819
19040	NC_004347	CGA	2	6	1290028	1290033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372819
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19042	NC_004347	TTCA	2	8	1290257	1290264	25 %	50 %	0 %	25 %	24372819
19043	NC_004347	GCA	2	6	1290274	1290279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372819
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19050	NC_004347	GGC	2	6	1290535	1290540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372820
19051	NC_004347	GGA	3	9	1290545	1290553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372820
19052	NC_004347	CAT	2	6	1290662	1290667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372820
19053	NC_004347	GTTT	2	8	1290686	1290693	0 %	75 %	25 %	0 %	24372820
19054	NC_004347	TGA	2	6	1290739	1290744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372820
19055	NC_004347	CAT	2	6	1290770	1290775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372820
19056	NC_004347	CAG	2	6	1290921	1290926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372820
19057	NC_004347	GCA	2	6	1291001	1291006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372820
19058	NC_004347	GCC	2	6	1291020	1291025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372820
19059	NC_004347	TGA	2	6	1291033	1291038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372820
19060	NC_004347	CAG	2	6	1291065	1291070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372820
19061	NC_004347	AGAT	2	8	1291117	1291124	50 %	25 %	25 %	0 %	24372820
19062	NC_004347	GAC	2	6	1291196	1291201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372820
19063	NC_004347	GCG	2	6	1291360	1291365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372820
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19066	NC_004347	TGGA	2	8	1291415	1291422	25 %	25 %	50 %	0 %	24372820
19067	NC_004347	AC	3	6	1292049	1292054	50 %	0 %	0 %	50 %	24372822
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19092	NC_004347	TGA	2	6	1293765	1293770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561877
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19104	NC_004347	TGT	2	6	1294797	1294802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372825
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19107	NC_004347	TTCA	2	8	1295103	1295110	25 %	50 %	0 %	25 %	24372825
19108	NC_004347	TG	3	6	1295131	1295136	0 %	50 %	50 %	0 %	24372825
19109	NC_004347	GTA	2	6	1295141	1295146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372825
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19115	NC_004347	AG	3	6	1295507	1295512	50 %	0 %	50 %	0 %	24372825
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19232	NC_004347	CTG	2	6	1303628	1303633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561879
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19275	NC_004347	A	6	6	1305660	1305665	100 %	0 %	0 %	0 %	24372836
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