MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_004347	GCTG	2	8	1255561	1255568	0 %	25 %	50 %	25 %	414561873
18502	NC_004347	GCT	3	9	1255640	1255648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561873
18503	NC_004347	AAG	2	6	1255650	1255655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18504	NC_004347	TTA	2	6	1255703	1255708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561873
18505	NC_004347	AGA	2	6	1255719	1255724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18506	NC_004347	CG	3	6	1255848	1255853	0 %	0 %	50 %	50 %	414561873
18507	NC_004347	AGA	2	6	1255905	1255910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18508	NC_004347	TGC	2	6	1255947	1255952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561873
18509	NC_004347	CCT	2	6	1255964	1255969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414561873
18510	NC_004347	AGA	2	6	1256071	1256076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18511	NC_004347	GATG	2	8	1256167	1256174	25 %	25 %	50 %	0 %	414561873
18512	NC_004347	GAAG	2	8	1256224	1256231	50 %	0 %	50 %	0 %	414561873
18513	NC_004347	GTT	2	6	1256243	1256248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561873
18514	NC_004347	TGA	2	6	1256266	1256271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561873
18515	NC_004347	ACTGC	2	10	1256324	1256333	20 %	20 %	20 %	40 %	414561873
18516	NC_004347	CAA	2	6	1256387	1256392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561873
18517	NC_004347	ACC	2	6	1256483	1256488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561873
18518	NC_004347	GGC	2	6	1256531	1256536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561873
18519	NC_004347	GAA	2	6	1256558	1256563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18520	NC_004347	CTT	2	6	1256610	1256615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561873
18521	NC_004347	AAG	2	6	1256634	1256639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18522	NC_004347	TCG	2	6	1256644	1256649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561873
18523	NC_004347	GAA	2	6	1256654	1256659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18524	NC_004347	ACC	2	6	1256808	1256813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561873
18525	NC_004347	AAG	2	6	1256826	1256831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18526	NC_004347	AAG	2	6	1256886	1256891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561873
18527	NC_004347	CTG	3	9	1256907	1256915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561873
18528	NC_004347	AAT	2	6	1256916	1256921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561873
18529	NC_004347	TGT	2	6	1257136	1257141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486830
18530	NC_004347	TGCTG	2	10	1257142	1257151	0 %	40 %	40 %	20 %	161486830
18531	NC_004347	TGA	2	6	1257246	1257251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486830
18532	NC_004347	CAG	2	6	1257300	1257305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486830
18533	NC_004347	AAC	2	6	1257321	1257326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161486830
18534	NC_004347	GC	3	6	1257329	1257334	0 %	0 %	50 %	50 %	161486830
18535	NC_004347	GTG	2	6	1257348	1257353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486830
18536	NC_004347	TATT	2	8	1257454	1257461	25 %	75 %	0 %	0 %	161486830
18537	NC_004347	AAG	2	6	1257468	1257473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161486830
18538	NC_004347	TTA	2	6	1257565	1257570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161486830
18539	NC_004347	CGC	2	6	1257616	1257621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486830
18540	NC_004347	GAT	2	6	1257623	1257628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486830
18541	NC_004347	GAT	2	6	1257674	1257679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486830
18542	NC_004347	GCT	2	6	1257680	1257685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486830
18543	NC_004347	AGC	2	6	1257708	1257713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486830
18544	NC_004347	TTG	2	6	1257750	1257755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486830
18545	NC_004347	ATT	3	9	1257756	1257764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161486830
18546	NC_004347	ACCC	2	8	1257815	1257822	25 %	0 %	0 %	75 %	161486830
18547	NC_004347	AAG	2	6	1257897	1257902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161486830
18548	NC_004347	CCTTGC	2	12	1257919	1257930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	161486830
18549	NC_004347	TTG	2	6	1257948	1257953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486830
18550	NC_004347	ACC	2	6	1258187	1258192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561874
18551	NC_004347	TGGA	2	8	1258283	1258290	25 %	25 %	50 %	0 %	414561874
18552	NC_004347	TGG	2	6	1258345	1258350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561874
18553	NC_004347	AGA	2	6	1258396	1258401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561874
18554	NC_004347	CGG	2	6	1258419	1258424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561874
18555	NC_004347	GATG	2	8	1258570	1258577	25 %	25 %	50 %	0 %	414561874
18556	NC_004347	GTG	2	6	1258676	1258681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561874
18557	NC_004347	AC	3	6	1258702	1258707	50 %	0 %	0 %	50 %	414561874
18558	NC_004347	TGA	2	6	1258789	1258794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561874
18559	NC_004347	AGTT	2	8	1258800	1258807	25 %	50 %	25 %	0 %	414561874
18560	NC_004347	CTT	2	6	1258840	1258845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561874
18561	NC_004347	TTC	2	6	1258868	1258873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561874
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18563	NC_004347	ACCGTG	2	12	1259037	1259048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414561874
18564	NC_004347	GT	3	6	1259061	1259066	0 %	50 %	50 %	0 %	414561874
18565	NC_004347	CAT	2	6	1259099	1259104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561874
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18569	NC_004347	GGTGC	2	10	1259372	1259381	0 %	20 %	60 %	20 %	414561874
18570	NC_004347	GGTG	2	8	1259425	1259432	0 %	25 %	75 %	0 %	414561874
18571	NC_004347	GC	3	6	1259516	1259521	0 %	0 %	50 %	50 %	414561874
18572	NC_004347	AGA	2	6	1259551	1259556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561874
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18585	NC_004347	TTG	2	6	1260224	1260229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561876
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18590	NC_004347	TGG	2	6	1260480	1260485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561876
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18592	NC_004347	A	8	8	1260656	1260663	100 %	0 %	0 %	0 %	414561876
18593	NC_004347	AATGC	2	10	1260697	1260706	40 %	20 %	20 %	20 %	414561876
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18600	NC_004347	A	6	6	1260969	1260974	100 %	0 %	0 %	0 %	24372795
18601	NC_004347	AATT	2	8	1260977	1260984	50 %	50 %	0 %	0 %	24372795
18602	NC_004347	GTGG	2	8	1260993	1261000	0 %	25 %	75 %	0 %	24372795
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18617	NC_004347	GGT	2	6	1261512	1261517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372795
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