MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_004347	GTT	2	6	1223494	1223499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561867
18003	NC_004347	CGG	2	6	1223579	1223584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561867
18004	NC_004347	ATC	3	9	1223907	1223915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372764
18005	NC_004347	CAC	2	6	1224075	1224080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372764
18006	NC_004347	GTT	2	6	1224084	1224089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372764
18007	NC_004347	T	6	6	1224118	1224123	0 %	100 %	0 %	0 %	24372764
18008	NC_004347	CAT	2	6	1224162	1224167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372764
18009	NC_004347	GGC	2	6	1224170	1224175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372764
18010	NC_004347	GTT	2	6	1224224	1224229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372764
18011	NC_004347	T	6	6	1224228	1224233	0 %	100 %	0 %	0 %	24372764
18012	NC_004347	CGT	2	6	1224248	1224253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372764
18013	NC_004347	TCT	2	6	1224355	1224360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372764
18014	NC_004347	CGG	2	6	1224430	1224435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372764
18015	NC_004347	GAT	2	6	1224558	1224563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372764
18016	NC_004347	TGG	2	6	1224590	1224595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372764
18017	NC_004347	CAC	2	6	1224680	1224685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372764
18018	NC_004347	GAT	2	6	1224759	1224764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372764
18019	NC_004347	CTT	2	6	1224785	1224790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372764
18020	NC_004347	GAAC	2	8	1224816	1224823	50 %	0 %	25 %	25 %	24372764
18021	NC_004347	GC	3	6	1224874	1224879	0 %	0 %	50 %	50 %	24372764
18022	NC_004347	ACG	2	6	1224945	1224950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372764
18023	NC_004347	ATC	2	6	1224961	1224966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372764
18024	NC_004347	ATG	2	6	1225000	1225005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372764
18025	NC_004347	CTT	2	6	1225040	1225045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372764
18026	NC_004347	ACC	2	6	1225059	1225064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372764
18027	NC_004347	AAT	2	6	1225071	1225076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372764
18028	NC_004347	AGC	2	6	1225168	1225173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372764
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18030	NC_004347	CTT	2	6	1225193	1225198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372764
18031	NC_004347	TCAT	2	8	1225258	1225265	25 %	50 %	0 %	25 %	24372764
18032	NC_004347	T	6	6	1225293	1225298	0 %	100 %	0 %	0 %	24372764
18033	NC_004347	TCA	2	6	1225301	1225306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372764
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18035	NC_004347	GGC	2	6	1225537	1225542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372765
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18038	NC_004347	GCA	2	6	1226127	1226132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372766
18039	NC_004347	CGG	3	9	1226181	1226189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372766
18040	NC_004347	TGG	2	6	1226192	1226197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372766
18041	NC_004347	CAA	2	6	1226224	1226229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372766
18042	NC_004347	GT	3	6	1226300	1226305	0 %	50 %	50 %	0 %	24372766
18043	NC_004347	CCT	2	6	1226361	1226366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372766
18044	NC_004347	CAA	2	6	1226515	1226520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372766
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18046	NC_004347	GGGC	2	8	1226669	1226676	0 %	0 %	75 %	25 %	24372766
18047	NC_004347	ACC	2	6	1226731	1226736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372766
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18050	NC_004347	TTA	2	6	1226791	1226796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372766
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18052	NC_004347	CCG	2	6	1226964	1226969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372766
18053	NC_004347	GCG	2	6	1227016	1227021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372766
18054	NC_004347	TCA	2	6	1227092	1227097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372766
18055	NC_004347	GGC	2	6	1227099	1227104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372766
18056	NC_004347	GGA	2	6	1227111	1227116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372766
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18058	NC_004347	TGA	3	9	1227182	1227190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372766
18059	NC_004347	CCA	2	6	1227191	1227196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372766
18060	NC_004347	TGC	2	6	1227245	1227250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372766
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18062	NC_004347	AAATT	2	10	1227506	1227515	60 %	40 %	0 %	0 %	24372767
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18065	NC_004347	TTTC	2	8	1227741	1227748	0 %	75 %	0 %	25 %	24372767
18066	NC_004347	GAA	2	6	1227760	1227765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372767
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18083	NC_004347	GC	3	6	1228663	1228668	0 %	0 %	50 %	50 %	24372768
18084	NC_004347	TGC	2	6	1228770	1228775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372768
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18088	NC_004347	GTGC	2	8	1228904	1228911	0 %	25 %	50 %	25 %	24372768
18089	NC_004347	GAA	2	6	1228988	1228993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372768
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18091	NC_004347	GTGC	2	8	1229108	1229115	0 %	25 %	50 %	25 %	24372768
18092	NC_004347	GGC	2	6	1229149	1229154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372768
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18100	NC_004347	GTT	2	6	1231274	1231279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561868
18101	NC_004347	TGC	2	6	1231303	1231308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561868
18102	NC_004347	AAC	2	6	1231417	1231422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561868
18103	NC_004347	TGGT	2	8	1231435	1231442	0 %	50 %	50 %	0 %	414561868
18104	NC_004347	TGG	2	6	1231562	1231567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561868
18105	NC_004347	CAT	2	6	1231634	1231639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561868
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18107	NC_004347	T	7	7	1231766	1231772	0 %	100 %	0 %	0 %	414561868
18108	NC_004347	ATC	2	6	1232197	1232202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561869
18109	NC_004347	TTA	2	6	1232252	1232257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561869
18110	NC_004347	T	6	6	1232264	1232269	0 %	100 %	0 %	0 %	414561869
18111	NC_004347	ATC	2	6	1232292	1232297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561869
18112	NC_004347	CGG	2	6	1232313	1232318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561869
18113	NC_004347	GGC	2	6	1232398	1232403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561869
18114	NC_004347	GGATAT	2	12	1232428	1232439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561869
18115	NC_004347	ATT	2	6	1232645	1232650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561869
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18117	NC_004347	GTT	2	6	1232710	1232715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561869
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18234	NC_004347	TGA	2	6	1240292	1240297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561871
18235	NC_004347	ATCAA	2	10	1240304	1240313	60 %	20 %	0 %	20 %	414561871
18236	NC_004347	TGA	2	6	1240341	1240346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561871
18237	NC_004347	TTG	2	6	1240370	1240375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561871
18238	NC_004347	CCAA	2	8	1240390	1240397	50 %	0 %	0 %	50 %	414561871
18239	NC_004347	TCC	2	6	1240446	1240451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414561871
18240	NC_004347	CTTT	2	8	1240505	1240512	0 %	75 %	0 %	25 %	414561871
18241	NC_004347	TCG	2	6	1240544	1240549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561871
18242	NC_004347	CGTG	2	8	1240566	1240573	0 %	25 %	50 %	25 %	414561871
18243	NC_004347	A	6	6	1240591	1240596	100 %	0 %	0 %	0 %	414561871
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18247	NC_004347	GGT	3	9	1240663	1240671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561871
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18250	NC_004347	ATC	2	6	1240741	1240746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561871
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18252	NC_004347	GTT	2	6	1240822	1240827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561871
18253	NC_004347	AAGC	2	8	1240904	1240911	50 %	0 %	25 %	25 %	414561871
18254	NC_004347	TGC	2	6	1240983	1240988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561871
18255	NC_004347	GC	3	6	1240987	1240992	0 %	0 %	50 %	50 %	414561871
18256	NC_004347	CGT	2	6	1240999	1241004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561871
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18261	NC_004347	CGT	2	6	1241245	1241250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561871
18262	NC_004347	GGT	2	6	1241281	1241286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561871
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18264	NC_004347	TCT	2	6	1241444	1241449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561871
18265	NC_004347	TGAAG	2	10	1241511	1241520	40 %	20 %	40 %	0 %	414561871
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18320	NC_004347	TAGA	2	8	1246200	1246207	50 %	25 %	25 %	0 %	24372785
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18331	NC_004347	GTT	2	6	1246873	1246878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372786
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18333	NC_004347	ATTG	2	8	1247109	1247116	25 %	50 %	25 %	0 %	24372786
18334	NC_004347	GC	3	6	1247131	1247136	0 %	0 %	50 %	50 %	24372786
18335	NC_004347	CGT	2	6	1247179	1247184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372786
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18338	NC_004347	GAT	2	6	1247281	1247286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372786
18339	NC_004347	ATC	2	6	1247338	1247343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372786
18340	NC_004347	CGTT	2	8	1247424	1247431	0 %	50 %	25 %	25 %	24372786
18341	NC_004347	CTGG	2	8	1247447	1247454	0 %	25 %	50 %	25 %	24372786
18342	NC_004347	TGA	2	6	1247465	1247470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372786
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18344	NC_004347	TGA	2	6	1247574	1247579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372786
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18347	NC_004347	GAA	2	6	1247716	1247721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372786
18348	NC_004347	TTA	2	6	1247752	1247757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372786
18349	NC_004347	AGCA	2	8	1247796	1247803	50 %	0 %	25 %	25 %	24372786
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18351	NC_004347	TGA	2	6	1247844	1247849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372786
18352	NC_004347	GAA	2	6	1247863	1247868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372786
18353	NC_004347	AGA	2	6	1247874	1247879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372786
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18469	NC_004347	ACG	2	6	1253674	1253679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372790
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18471	NC_004347	TCA	2	6	1253959	1253964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372790
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18475	NC_004347	A	6	6	1254179	1254184	100 %	0 %	0 %	0 %	24372790
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18497	NC_004347	GCT	2	6	1255268	1255273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561873
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