MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_004347	TGG	2	6	1157250	1157255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372697
17002	NC_004347	GC	3	6	1157299	1157304	0 %	0 %	50 %	50 %	24372697
17003	NC_004347	CGC	2	6	1157536	1157541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372697
17004	NC_004347	TTA	2	6	1157672	1157677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372697
17005	NC_004347	TTA	2	6	1157789	1157794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372697
17006	NC_004347	TGA	2	6	1157844	1157849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372697
17007	NC_004347	GGT	2	6	1158015	1158020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372697
17008	NC_004347	AAAC	2	8	1158043	1158050	75 %	0 %	0 %	25 %	24372697
17009	NC_004347	ATG	2	6	1158071	1158076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372697
17010	NC_004347	TGA	2	6	1158083	1158088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372697
17011	NC_004347	ATT	2	6	1158099	1158104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372697
17012	NC_004347	GGT	2	6	1158387	1158392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372698
17013	NC_004347	TCA	2	6	1158406	1158411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372698
17014	NC_004347	TAGA	2	8	1158532	1158539	50 %	25 %	25 %	0 %	24372698
17015	NC_004347	CTT	2	6	1158716	1158721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372698
17016	NC_004347	TGAG	2	8	1158749	1158756	25 %	25 %	50 %	0 %	24372698
17017	NC_004347	TCA	2	6	1158851	1158856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372698
17018	NC_004347	ACC	2	6	1159032	1159037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372698
17019	NC_004347	GC	3	6	1159089	1159094	0 %	0 %	50 %	50 %	24372698
17020	NC_004347	TTG	2	6	1159102	1159107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372698
17021	NC_004347	AATG	2	8	1159124	1159131	50 %	25 %	25 %	0 %	24372698
17022	NC_004347	CCATA	2	10	1159206	1159215	40 %	20 %	0 %	40 %	24372698
17023	NC_004347	CGC	2	6	1159238	1159243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372698
17024	NC_004347	CTT	2	6	1159268	1159273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372698
17025	NC_004347	CCTG	2	8	1159315	1159322	0 %	25 %	25 %	50 %	24372698
17026	NC_004347	CTT	2	6	1159349	1159354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372698
17027	NC_004347	GGT	2	6	1159455	1159460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372698
17028	NC_004347	TAA	2	6	1159511	1159516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372698
17029	NC_004347	T	7	7	1159537	1159543	0 %	100 %	0 %	0 %	24372698
17030	NC_004347	TGG	2	6	1160079	1160084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372700
17031	NC_004347	TGA	2	6	1160113	1160118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372700
17032	NC_004347	TTG	2	6	1160126	1160131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372700
17033	NC_004347	GAT	2	6	1160243	1160248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372700
17034	NC_004347	GCT	2	6	1160326	1160331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372700
17035	NC_004347	TGT	2	6	1160335	1160340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372700
17036	NC_004347	GCG	2	6	1160381	1160386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372700
17037	NC_004347	TCA	2	6	1160492	1160497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372700
17038	NC_004347	CTGC	2	8	1160605	1160612	0 %	25 %	25 %	50 %	24372700
17039	NC_004347	AGT	2	6	1160644	1160649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372700
17040	NC_004347	AGA	2	6	1160650	1160655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372700
17041	NC_004347	CTG	2	6	1160684	1160689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372700
17042	NC_004347	GC	3	6	1160699	1160704	0 %	0 %	50 %	50 %	24372700
17043	NC_004347	TCC	2	6	1160705	1160710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372700
17044	NC_004347	TCA	2	6	1160725	1160730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372700
17045	NC_004347	GCG	2	6	1160820	1160825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372700
17046	NC_004347	GCG	2	6	1160841	1160846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372700
17047	NC_004347	GTG	2	6	1161155	1161160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372700
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17049	NC_004347	GCA	2	6	1161232	1161237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372700
17050	NC_004347	GCG	2	6	1161320	1161325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372700
17051	NC_004347	TAA	2	6	1161340	1161345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372700
17052	NC_004347	CTT	2	6	1161351	1161356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372700
17053	NC_004347	TCA	2	6	1161373	1161378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372700
17054	NC_004347	GCG	2	6	1161386	1161391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372700
17055	NC_004347	AC	4	8	1161453	1161460	50 %	0 %	0 %	50 %	24372700
17056	NC_004347	ACCG	2	8	1161508	1161515	25 %	0 %	25 %	50 %	24372700
17057	NC_004347	AAC	2	6	1161558	1161563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372700
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17059	NC_004347	T	8	8	1161949	1161956	0 %	100 %	0 %	0 %	414561858
17060	NC_004347	ACA	2	6	1162622	1162627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372703
17061	NC_004347	CAT	2	6	1162645	1162650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372703
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17063	NC_004347	CTATC	2	10	1162762	1162771	20 %	40 %	0 %	40 %	24372703
17064	NC_004347	T	6	6	1162802	1162807	0 %	100 %	0 %	0 %	24372703
17065	NC_004347	GTT	2	6	1162817	1162822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372703
17066	NC_004347	TGG	2	6	1163013	1163018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372703
17067	NC_004347	CTG	2	6	1163064	1163069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372703
17068	NC_004347	TCT	2	6	1163088	1163093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372703
17069	NC_004347	TGA	2	6	1163359	1163364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372703
17070	NC_004347	CGA	2	6	1163415	1163420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372703
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17072	NC_004347	CGA	2	6	1163445	1163450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372703
17073	NC_004347	TGG	2	6	1163488	1163493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372703
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17084	NC_004347	TGA	2	6	1164143	1164148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372704
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17086	NC_004347	TGC	2	6	1164332	1164337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372704
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17088	NC_004347	CAT	2	6	1164423	1164428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372704
17089	NC_004347	CGACAA	2	12	1164471	1164482	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24372704
17090	NC_004347	GCG	2	6	1164496	1164501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372704
17091	NC_004347	TG	3	6	1164506	1164511	0 %	50 %	50 %	0 %	24372704
17092	NC_004347	CTG	2	6	1164520	1164525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372704
17093	NC_004347	TGA	2	6	1164612	1164617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372704
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17098	NC_004347	A	6	6	1164757	1164762	100 %	0 %	0 %	0 %	24372704
17099	NC_004347	ATT	2	6	1164931	1164936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372704
17100	NC_004347	ATT	2	6	1164997	1165002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372704
17101	NC_004347	CGA	2	6	1165062	1165067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372704
17102	NC_004347	GTC	2	6	1165126	1165131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372704
17103	NC_004347	GGC	3	9	1165323	1165331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372705
17104	NC_004347	GATC	2	8	1165359	1165366	25 %	25 %	25 %	25 %	24372705
17105	NC_004347	CGC	3	9	1165492	1165500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372705
17106	NC_004347	GC	3	6	1165534	1165539	0 %	0 %	50 %	50 %	24372705
17107	NC_004347	GTG	2	6	1165601	1165606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372705
17108	NC_004347	CAA	2	6	1165626	1165631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372705
17109	NC_004347	TTC	2	6	1165704	1165709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372705
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17111	NC_004347	GT	3	6	1165927	1165932	0 %	50 %	50 %	0 %	24372705
17112	NC_004347	TGG	2	6	1165952	1165957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372705
17113	NC_004347	GCGT	2	8	1166015	1166022	0 %	25 %	50 %	25 %	24372705
17114	NC_004347	GTG	2	6	1166137	1166142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372705
17115	NC_004347	GCG	2	6	1166155	1166160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372705
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17118	NC_004347	ATGA	2	8	1166239	1166246	50 %	25 %	25 %	0 %	24372705
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17231	NC_004347	GTC	2	6	1173410	1173415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561859
17232	NC_004347	ACGA	2	8	1173469	1173476	50 %	0 %	25 %	25 %	414561859
17233	NC_004347	CCTT	2	8	1173497	1173504	0 %	50 %	0 %	50 %	414561859
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17350	NC_004347	TC	3	6	1181841	1181846	0 %	50 %	0 %	50 %	24372724
17351	NC_004347	GTT	2	6	1181857	1181862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372724
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17353	NC_004347	AGT	2	6	1182037	1182042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372724
17354	NC_004347	CAA	2	6	1182052	1182057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372724
17355	NC_004347	GTT	2	6	1182088	1182093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372724
17356	NC_004347	TCC	2	6	1182131	1182136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372724
17357	NC_004347	CAT	2	6	1182162	1182167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372724
17358	NC_004347	TAC	2	6	1182255	1182260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372724
17359	NC_004347	TGCC	2	8	1182311	1182318	0 %	25 %	25 %	50 %	24372724
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17361	NC_004347	GTTG	2	8	1182393	1182400	0 %	50 %	50 %	0 %	24372724
17362	NC_004347	TC	3	6	1182480	1182485	0 %	50 %	0 %	50 %	24372724
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17368	NC_004347	TGC	2	6	1182711	1182716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372724
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17373	NC_004347	AGT	2	6	1183161	1183166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372725
17374	NC_004347	CCA	2	6	1183208	1183213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372725
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17378	NC_004347	GAA	2	6	1183402	1183407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372725
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17383	NC_004347	CCAA	2	8	1183543	1183550	50 %	0 %	0 %	50 %	24372725
17384	NC_004347	CGA	2	6	1183563	1183568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372725
17385	NC_004347	TTGG	2	8	1183577	1183584	0 %	50 %	50 %	0 %	24372725
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17388	NC_004347	CTGA	2	8	1183711	1183718	25 %	25 %	25 %	25 %	24372725
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17395	NC_004347	GCTG	2	8	1184385	1184392	0 %	25 %	50 %	25 %	24372725
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17463	NC_004347	AGC	2	6	1188945	1188950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372728
17464	NC_004347	ACC	2	6	1189091	1189096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372728
17465	NC_004347	GAA	2	6	1189114	1189119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372728
17466	NC_004347	A	6	6	1189180	1189185	100 %	0 %	0 %	0 %	24372728
17467	NC_004347	AAGC	2	8	1189232	1189239	50 %	0 %	25 %	25 %	24372728
17468	NC_004347	CATCG	2	10	1189328	1189337	20 %	20 %	20 %	40 %	24372728
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17472	NC_004347	GGC	2	6	1189630	1189635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372728
17473	NC_004347	TTG	2	6	1189751	1189756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372728
17474	NC_004347	GC	3	6	1189785	1189790	0 %	0 %	50 %	50 %	24372728
17475	NC_004347	CTG	2	6	1189795	1189800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372728
17476	NC_004347	CGA	2	6	1189817	1189822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372728
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