MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004347	CCCG	2	8	1081680	1081687	0 %	0 %	25 %	75 %	24372629
16002	NC_004347	AAT	2	6	1081793	1081798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372629
16003	NC_004347	AGCG	2	8	1081830	1081837	25 %	0 %	50 %	25 %	24372629
16004	NC_004347	CG	3	6	1081836	1081841	0 %	0 %	50 %	50 %	24372629
16005	NC_004347	AAT	2	6	1081883	1081888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372629
16006	NC_004347	TGC	2	6	1081958	1081963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372629
16007	NC_004347	CAC	3	9	1081994	1082002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372629
16008	NC_004347	CGG	2	6	1082035	1082040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372629
16009	NC_004347	TCA	2	6	1082071	1082076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372629
16010	NC_004347	GTG	2	6	1082079	1082084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372629
16011	NC_004347	GAA	2	6	1082117	1082122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372629
16012	NC_004347	CGT	2	6	1082179	1082184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372629
16013	NC_004347	ATTG	2	8	1082210	1082217	25 %	50 %	25 %	0 %	24372629
16014	NC_004347	TTTC	2	8	1082274	1082281	0 %	75 %	0 %	25 %	24372630
16015	NC_004347	GAG	2	6	1082311	1082316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372630
16016	NC_004347	GGA	2	6	1082357	1082362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372630
16017	NC_004347	AGC	2	6	1082410	1082415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372630
16018	NC_004347	ACA	2	6	1082430	1082435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372630
16019	NC_004347	T	6	6	1082512	1082517	0 %	100 %	0 %	0 %	24372630
16020	NC_004347	CAT	2	6	1082521	1082526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372630
16021	NC_004347	CGG	2	6	1082529	1082534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372630
16022	NC_004347	TCA	2	6	1082573	1082578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372630
16023	NC_004347	TGCC	2	8	1082659	1082666	0 %	25 %	25 %	50 %	24372630
16024	NC_004347	AATC	2	8	1082700	1082707	50 %	25 %	0 %	25 %	24372630
16025	NC_004347	TCG	2	6	1082822	1082827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372630
16026	NC_004347	AAC	2	6	1082915	1082920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372630
16027	NC_004347	GCC	2	6	1082941	1082946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372630
16028	NC_004347	TAA	2	6	1082947	1082952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372630
16029	NC_004347	T	6	6	1082959	1082964	0 %	100 %	0 %	0 %	24372630
16030	NC_004347	GCT	2	6	1083368	1083373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561846
16031	NC_004347	AGA	2	6	1083401	1083406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561846
16032	NC_004347	CAT	2	6	1083491	1083496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561846
16033	NC_004347	TAC	2	6	1083506	1083511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561846
16034	NC_004347	TCTG	2	8	1083527	1083534	0 %	50 %	25 %	25 %	414561846
16035	NC_004347	TGC	2	6	1083614	1083619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561846
16036	NC_004347	CGA	2	6	1083809	1083814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561846
16037	NC_004347	GTTTTG	2	12	1083889	1083900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561846
16038	NC_004347	GCT	2	6	1083930	1083935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561846
16039	NC_004347	TTAC	2	8	1084097	1084104	25 %	50 %	0 %	25 %	414561846
16040	NC_004347	T	6	6	1084186	1084191	0 %	100 %	0 %	0 %	24372632
16041	NC_004347	ATC	2	6	1084201	1084206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372632
16042	NC_004347	TCA	2	6	1084270	1084275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372632
16043	NC_004347	CGC	2	6	1084315	1084320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372632
16044	NC_004347	ATC	2	6	1084339	1084344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372632
16045	NC_004347	CCA	2	6	1084361	1084366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372632
16046	NC_004347	G	6	6	1084409	1084414	0 %	0 %	100 %	0 %	24372632
16047	NC_004347	ACC	3	9	1084552	1084560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372632
16048	NC_004347	TGA	2	6	1084607	1084612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372632
16049	NC_004347	TAA	2	6	1084677	1084682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372632
16050	NC_004347	CTG	2	6	1084704	1084709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372632
16051	NC_004347	GGC	2	6	1084826	1084831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372632
16052	NC_004347	AGC	2	6	1084915	1084920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372632
16053	NC_004347	CTT	2	6	1084934	1084939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372632
16054	NC_004347	AG	3	6	1084959	1084964	50 %	0 %	50 %	0 %	24372632
16055	NC_004347	ACC	2	6	1085007	1085012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372632
16056	NC_004347	GCA	2	6	1085039	1085044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372632
16057	NC_004347	CT	3	6	1085243	1085248	0 %	50 %	0 %	50 %	414561847
16058	NC_004347	TGCC	2	8	1085265	1085272	0 %	25 %	25 %	50 %	414561847
16059	NC_004347	GT	3	6	1085312	1085317	0 %	50 %	50 %	0 %	414561847
16060	NC_004347	GCT	2	6	1085386	1085391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561847
16061	NC_004347	CTG	2	6	1085410	1085415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561847
16062	NC_004347	T	6	6	1085416	1085421	0 %	100 %	0 %	0 %	414561847
16063	NC_004347	GT	3	6	1085507	1085512	0 %	50 %	50 %	0 %	414561847
16064	NC_004347	TGG	2	6	1085519	1085524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561847
16065	NC_004347	TCG	2	6	1085589	1085594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561847
16066	NC_004347	CTTAA	2	10	1085622	1085631	40 %	40 %	0 %	20 %	24372634
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16070	NC_004347	TTTGC	2	10	1085880	1085889	0 %	60 %	20 %	20 %	24372634
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16075	NC_004347	GCA	2	6	1086231	1086236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372634
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16079	NC_004347	GCA	2	6	1086894	1086899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372635
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16083	NC_004347	TTGA	2	8	1087198	1087205	25 %	50 %	25 %	0 %	24372635
16084	NC_004347	TGC	2	6	1087211	1087216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372635
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16089	NC_004347	A	6	6	1088106	1088111	100 %	0 %	0 %	0 %	414561848
16090	NC_004347	GTT	2	6	1088153	1088158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561848
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16095	NC_004347	TGG	2	6	1088668	1088673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561848
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16098	NC_004347	GT	3	6	1088881	1088886	0 %	50 %	50 %	0 %	414561848
16099	NC_004347	TCAGT	2	10	1088943	1088952	20 %	40 %	20 %	20 %	414561848
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16101	NC_004347	ACA	2	6	1089052	1089057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561848
16102	NC_004347	TGG	2	6	1089125	1089130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561848
16103	NC_004347	TGG	2	6	1089185	1089190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561848
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16107	NC_004347	GGT	2	6	1089811	1089816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372638
16108	NC_004347	TTC	2	6	1089817	1089822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372638
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16113	NC_004347	TGA	2	6	1090179	1090184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372638
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16115	NC_004347	GAGT	2	8	1090272	1090279	25 %	25 %	50 %	0 %	24372638
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16117	NC_004347	GTC	2	6	1090570	1090575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372638
16118	NC_004347	TCG	2	6	1090582	1090587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372638
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16231	NC_004347	GTTTT	2	10	1099009	1099018	0 %	80 %	20 %	0 %	24372644
16232	NC_004347	CGG	2	6	1099023	1099028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372644
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16463	NC_004347	AAAAC	2	10	1116557	1116566	80 %	0 %	0 %	20 %	24372660
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16470	NC_004347	GAT	2	6	1117137	1117142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372660
16471	NC_004347	AAGCT	2	10	1117190	1117199	40 %	20 %	20 %	20 %	24372660
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