MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004347	CTA	2	6	1022541	1022546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372577
15002	NC_004347	GTT	2	6	1022640	1022645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372577
15003	NC_004347	GTA	2	6	1022789	1022794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372577
15004	NC_004347	TG	3	6	1022865	1022870	0 %	50 %	50 %	0 %	24372577
15005	NC_004347	CCA	2	6	1022902	1022907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372577
15006	NC_004347	TGCT	2	8	1022985	1022992	0 %	50 %	25 %	25 %	24372577
15007	NC_004347	ATG	2	6	1023005	1023010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372577
15008	NC_004347	TTTG	2	8	1023051	1023058	0 %	75 %	25 %	0 %	24372577
15009	NC_004347	ATTTT	2	10	1023066	1023075	20 %	80 %	0 %	0 %	24372577
15010	NC_004347	T	7	7	1023072	1023078	0 %	100 %	0 %	0 %	24372577
15011	NC_004347	GAA	2	6	1023079	1023084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372577
15012	NC_004347	T	7	7	1023158	1023164	0 %	100 %	0 %	0 %	24372577
15013	NC_004347	AACC	2	8	1023185	1023192	50 %	0 %	0 %	50 %	24372577
15014	NC_004347	GGTT	2	8	1023296	1023303	0 %	50 %	50 %	0 %	24372577
15015	NC_004347	TTA	2	6	1023494	1023499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372577
15016	NC_004347	TCA	2	6	1023509	1023514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372577
15017	NC_004347	TCC	2	6	1023602	1023607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372577
15018	NC_004347	GGC	2	6	1023685	1023690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372577
15019	NC_004347	CAA	2	6	1023714	1023719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372577
15020	NC_004347	TTG	2	6	1023845	1023850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372577
15021	NC_004347	CTC	2	6	1023892	1023897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372577
15022	NC_004347	AAT	2	6	1023920	1023925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372577
15023	NC_004347	TAA	2	6	1023949	1023954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372577
15024	NC_004347	CTT	2	6	1024506	1024511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561841
15025	NC_004347	AGA	2	6	1024551	1024556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561841
15026	NC_004347	GC	3	6	1024626	1024631	0 %	0 %	50 %	50 %	414561841
15027	NC_004347	CGT	2	6	1024644	1024649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561841
15028	NC_004347	GAT	2	6	1024660	1024665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561841
15029	NC_004347	GAA	3	9	1024714	1024722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561841
15030	NC_004347	ACC	2	6	1024744	1024749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561841
15031	NC_004347	ATT	2	6	1024760	1024765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561841
15032	NC_004347	AG	3	6	1024767	1024772	50 %	0 %	50 %	0 %	414561841
15033	NC_004347	CCG	2	6	1024794	1024799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561841
15034	NC_004347	GTG	2	6	1024856	1024861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561841
15035	NC_004347	TAC	2	6	1024892	1024897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561841
15036	NC_004347	GTAT	2	8	1024898	1024905	25 %	50 %	25 %	0 %	414561841
15037	NC_004347	G	6	6	1024913	1024918	0 %	0 %	100 %	0 %	414561841
15038	NC_004347	TGGT	2	8	1025016	1025023	0 %	50 %	50 %	0 %	414561841
15039	NC_004347	TGA	2	6	1025127	1025132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561841
15040	NC_004347	CTG	2	6	1025156	1025161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561841
15041	NC_004347	GGT	2	6	1025197	1025202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561841
15042	NC_004347	AACCG	2	10	1025212	1025221	40 %	0 %	20 %	40 %	414561841
15043	NC_004347	AGTGC	2	10	1025262	1025271	20 %	20 %	40 %	20 %	414561841
15044	NC_004347	GCC	2	6	1025374	1025379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561841
15045	NC_004347	GAT	2	6	1025434	1025439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561841
15046	NC_004347	TAAT	2	8	1025545	1025552	50 %	50 %	0 %	0 %	414561841
15047	NC_004347	AAAC	2	8	1025600	1025607	75 %	0 %	0 %	25 %	24372578
15048	NC_004347	CGT	2	6	1025619	1025624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372578
15049	NC_004347	GAA	2	6	1025736	1025741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372578
15050	NC_004347	CAT	2	6	1025903	1025908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372578
15051	NC_004347	CTG	2	6	1025976	1025981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372578
15052	NC_004347	GAA	2	6	1026075	1026080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372578
15053	NC_004347	A	6	6	1026141	1026146	100 %	0 %	0 %	0 %	24372578
15054	NC_004347	ATG	2	6	1026171	1026176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372578
15055	NC_004347	GGC	2	6	1026189	1026194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372578
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15058	NC_004347	GGT	2	6	1026291	1026296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372578
15059	NC_004347	GT	3	6	1026304	1026309	0 %	50 %	50 %	0 %	24372578
15060	NC_004347	AATC	2	8	1026314	1026321	50 %	25 %	0 %	25 %	24372578
15061	NC_004347	CAC	2	6	1026346	1026351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372578
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15063	NC_004347	GAA	2	6	1026426	1026431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372578
15064	NC_004347	GC	3	6	1026466	1026471	0 %	0 %	50 %	50 %	24372578
15065	NC_004347	GGT	2	6	1026504	1026509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372578
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15067	NC_004347	TCA	2	6	1026727	1026732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372578
15068	NC_004347	CGT	2	6	1026765	1026770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372578
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15070	NC_004347	TTC	2	6	1026807	1026812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372578
15071	NC_004347	ATG	2	6	1026853	1026858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372578
15072	NC_004347	CACTG	2	10	1026947	1026956	20 %	20 %	20 %	40 %	24372578
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15075	NC_004347	GGTATC	2	12	1026987	1026998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24372578
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15083	NC_004347	TTG	2	6	1027408	1027413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372580
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15086	NC_004347	T	7	7	1027620	1027626	0 %	100 %	0 %	0 %	24372580
15087	NC_004347	CAT	2	6	1027629	1027634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372580
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15089	NC_004347	GCG	2	6	1028233	1028238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372582
15090	NC_004347	T	6	6	1028243	1028248	0 %	100 %	0 %	0 %	24372582
15091	NC_004347	GTT	2	6	1028316	1028321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372582
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15094	NC_004347	ATGCTT	2	12	1028746	1028757	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	24372583
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15098	NC_004347	GC	3	6	1028992	1028997	0 %	0 %	50 %	50 %	24372583
15099	NC_004347	ATA	2	6	1029008	1029013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372583
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15101	NC_004347	TAAC	2	8	1029158	1029165	50 %	25 %	0 %	25 %	24372583
15102	NC_004347	GAG	2	6	1029194	1029199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372583
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15105	NC_004347	TGG	2	6	1029366	1029371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372583
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15107	NC_004347	GGC	2	6	1029660	1029665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372583
15108	NC_004347	TAAT	2	8	1029678	1029685	50 %	50 %	0 %	0 %	24372583
15109	NC_004347	GCA	2	6	1030018	1030023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372585
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15112	NC_004347	AAG	2	6	1030126	1030131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372585
15113	NC_004347	TGG	2	6	1030150	1030155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372585
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15118	NC_004347	AAAGCC	2	12	1030467	1030478	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24372585
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15348	NC_004347	TGT	2	6	1044663	1044668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372594
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15350	NC_004347	A	6	6	1044706	1044711	100 %	0 %	0 %	0 %	24372594
15351	NC_004347	TC	3	6	1044714	1044719	0 %	50 %	0 %	50 %	24372594
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15469	NC_004347	GCC	2	6	1049726	1049731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372597
15470	NC_004347	GTT	2	6	1049737	1049742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372597
15471	NC_004347	GTA	2	6	1049752	1049757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372597
15472	NC_004347	CAG	2	6	1049767	1049772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372597
15473	NC_004347	CAG	2	6	1049815	1049820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372597
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15499	NC_004347	CAT	2	6	1050866	1050871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372599
15500	NC_004347	CAC	2	6	1050872	1050877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372599

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