MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_004347	GCG	2	6	958069	958074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372516
14002	NC_004347	CTT	2	6	958166	958171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372516
14003	NC_004347	CAG	2	6	958271	958276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372516
14004	NC_004347	AGC	2	6	958311	958316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372516
14005	NC_004347	CCA	2	6	958357	958362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372516
14006	NC_004347	ACC	2	6	958377	958382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372516
14007	NC_004347	GAT	2	6	958395	958400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372516
14008	NC_004347	ACC	2	6	958434	958439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372516
14009	NC_004347	TGA	2	6	958463	958468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372516
14010	NC_004347	TGA	2	6	958514	958519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372516
14011	NC_004347	TCAA	2	8	958537	958544	50 %	25 %	0 %	25 %	24372516
14012	NC_004347	CAA	2	6	958601	958606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372516
14013	NC_004347	TTG	2	6	958609	958614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372516
14014	NC_004347	GGT	2	6	958962	958967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372516
14015	NC_004347	CTA	2	6	958979	958984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372516
14016	NC_004347	CGCA	2	8	959012	959019	25 %	0 %	25 %	50 %	24372516
14017	NC_004347	ATCTG	2	10	959071	959080	20 %	40 %	20 %	20 %	24372516
14018	NC_004347	TAG	2	6	959138	959143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372516
14019	NC_004347	TAGA	2	8	959779	959786	50 %	25 %	25 %	0 %	24372517
14020	NC_004347	CT	3	6	959799	959804	0 %	50 %	0 %	50 %	24372517
14021	NC_004347	TTA	2	6	959835	959840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372517
14022	NC_004347	A	6	6	960004	960009	100 %	0 %	0 %	0 %	24372517
14023	NC_004347	TTG	2	6	960046	960051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372517
14024	NC_004347	CTTAGG	2	12	960131	960142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24372517
14025	NC_004347	TGA	2	6	960209	960214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372517
14026	NC_004347	TGGC	2	8	960239	960246	0 %	25 %	50 %	25 %	24372517
14027	NC_004347	GCGAT	2	10	960277	960286	20 %	20 %	40 %	20 %	24372517
14028	NC_004347	CG	3	6	960288	960293	0 %	0 %	50 %	50 %	24372517
14029	NC_004347	ACCA	2	8	960326	960333	50 %	0 %	0 %	50 %	24372517
14030	NC_004347	CTG	2	6	960338	960343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372517
14031	NC_004347	CAAA	2	8	960370	960377	75 %	0 %	0 %	25 %	24372517
14032	NC_004347	CGC	2	6	960425	960430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372517
14033	NC_004347	TGC	3	9	960557	960565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372517
14034	NC_004347	GCT	2	6	960579	960584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372517
14035	NC_004347	GCCAA	2	10	960661	960670	40 %	0 %	20 %	40 %	24372517
14036	NC_004347	GGC	2	6	960747	960752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372517
14037	NC_004347	GAT	2	6	960810	960815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372517
14038	NC_004347	TAC	2	6	960834	960839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372517
14039	NC_004347	CAT	2	6	960866	960871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372517
14040	NC_004347	GT	3	6	960877	960882	0 %	50 %	50 %	0 %	24372517
14041	NC_004347	GGT	2	6	960891	960896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372517
14042	NC_004347	TCA	2	6	960898	960903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372517
14043	NC_004347	ATG	2	6	960921	960926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372517
14044	NC_004347	AGC	2	6	961130	961135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372517
14045	NC_004347	CGT	2	6	961143	961148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372517
14046	NC_004347	CTG	2	6	961204	961209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372517
14047	NC_004347	AGC	2	6	961316	961321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372517
14048	NC_004347	CTGA	2	8	961329	961336	25 %	25 %	25 %	25 %	24372517
14049	NC_004347	GCAA	2	8	961342	961349	50 %	0 %	25 %	25 %	24372517
14050	NC_004347	ACC	2	6	961515	961520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372517
14051	NC_004347	CAAT	2	8	961752	961759	50 %	25 %	0 %	25 %	24372518
14052	NC_004347	CAAT	2	8	961836	961843	50 %	25 %	0 %	25 %	24372518
14053	NC_004347	ATT	2	6	961865	961870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372518
14054	NC_004347	TAC	2	6	961888	961893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372518
14055	NC_004347	GCAGAT	2	12	961933	961944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24372518
14056	NC_004347	CGA	2	6	961948	961953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372518
14057	NC_004347	GC	3	6	962164	962169	0 %	0 %	50 %	50 %	24372518
14058	NC_004347	ACC	2	6	962201	962206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372518
14059	NC_004347	TGAT	2	8	962223	962230	25 %	50 %	25 %	0 %	24372518
14060	NC_004347	ACC	2	6	962270	962275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372518
14061	NC_004347	TGAT	2	8	962304	962311	25 %	50 %	25 %	0 %	24372518
14062	NC_004347	ATG	2	6	962319	962324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372518
14063	NC_004347	CGC	2	6	962330	962335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372518
14064	NC_004347	ATT	2	6	962357	962362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372518
14065	NC_004347	TCAA	2	8	962514	962521	50 %	25 %	0 %	25 %	24372518
14066	NC_004347	GCC	2	6	962534	962539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372518
14067	NC_004347	TGC	2	6	962670	962675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372518
14068	NC_004347	GAT	2	6	962731	962736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372518
14069	NC_004347	CGT	2	6	962975	962980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372519
14070	NC_004347	GC	3	6	962991	962996	0 %	0 %	50 %	50 %	24372519
14071	NC_004347	CT	3	6	963005	963010	0 %	50 %	0 %	50 %	24372519
14072	NC_004347	GCG	2	6	963042	963047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372519
14073	NC_004347	GTC	2	6	963070	963075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372519
14074	NC_004347	ACA	2	6	963091	963096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372519
14075	NC_004347	CGAC	2	8	963163	963170	25 %	0 %	25 %	50 %	24372519
14076	NC_004347	GTG	3	9	963204	963212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372519
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14081	NC_004347	GATG	2	8	963299	963306	25 %	25 %	50 %	0 %	24372519
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14086	NC_004347	TGA	2	6	963605	963610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372519
14087	NC_004347	TACC	2	8	963661	963668	25 %	25 %	0 %	50 %	24372519
14088	NC_004347	GCT	2	6	963705	963710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372519
14089	NC_004347	AGTG	2	8	963722	963729	25 %	25 %	50 %	0 %	24372519
14090	NC_004347	GCGATA	2	12	963736	963747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24372519
14091	NC_004347	CTG	2	6	963802	963807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372519
14092	NC_004347	GT	3	6	963835	963840	0 %	50 %	50 %	0 %	24372519
14093	NC_004347	GGT	2	6	963921	963926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372519
14094	NC_004347	GGC	2	6	963935	963940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372519
14095	NC_004347	CTG	2	6	964030	964035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372519
14096	NC_004347	A	7	7	964046	964052	100 %	0 %	0 %	0 %	24372519
14097	NC_004347	GTG	2	6	964054	964059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372519
14098	NC_004347	A	6	6	964247	964252	100 %	0 %	0 %	0 %	24372520
14099	NC_004347	ACT	2	6	964275	964280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372520
14100	NC_004347	GC	3	6	964344	964349	0 %	0 %	50 %	50 %	24372520
14101	NC_004347	CAT	2	6	964350	964355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372520
14102	NC_004347	TGA	2	6	964445	964450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372520
14103	NC_004347	TTCAA	2	10	964530	964539	40 %	40 %	0 %	20 %	24372520
14104	NC_004347	TGA	2	6	964556	964561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372520
14105	NC_004347	GT	3	6	964658	964663	0 %	50 %	50 %	0 %	24372520
14106	NC_004347	GTT	2	6	964682	964687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372520
14107	NC_004347	GAA	2	6	964717	964722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372520
14108	NC_004347	CTG	2	6	964762	964767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372520
14109	NC_004347	AGA	2	6	964776	964781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372520
14110	NC_004347	GCC	2	6	964783	964788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372520
14111	NC_004347	TTG	2	6	964793	964798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372520
14112	NC_004347	GCGATT	2	12	964822	964833	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24372520
14113	NC_004347	ATC	2	6	964981	964986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372520
14114	NC_004347	GGT	2	6	964996	965001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372520
14115	NC_004347	AGA	2	6	965031	965036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372520
14116	NC_004347	GCGT	2	8	965060	965067	0 %	25 %	50 %	25 %	24372520
14117	NC_004347	GAA	2	6	965459	965464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372521
14118	NC_004347	TGA	2	6	965485	965490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372521
14119	NC_004347	TA	3	6	965671	965676	50 %	50 %	0 %	0 %	24372521
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14121	NC_004347	ATGA	2	8	965739	965746	50 %	25 %	25 %	0 %	24372521
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14365	NC_004347	CTT	2	6	980217	980222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372532
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14485	NC_004347	GCT	2	6	988104	988109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372538
14486	NC_004347	AGA	2	6	988187	988192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372538
14487	NC_004347	ACC	2	6	988217	988222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372538
14488	NC_004347	TGC	2	6	988231	988236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372538
14489	NC_004347	GC	3	6	988248	988253	0 %	0 %	50 %	50 %	24372538
14490	NC_004347	AAT	2	6	988255	988260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372538
14491	NC_004347	CGT	2	6	988370	988375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372539
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