MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004347	ATGA	2	8	887258	887265	50 %	25 %	25 %	0 %	24372448
13002	NC_004347	GCCAA	2	10	887273	887282	40 %	0 %	20 %	40 %	24372448
13003	NC_004347	TGT	2	6	887359	887364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372448
13004	NC_004347	AACGT	2	10	887514	887523	40 %	20 %	20 %	20 %	24372448
13005	NC_004347	GATCA	2	10	887528	887537	40 %	20 %	20 %	20 %	24372448
13006	NC_004347	TGCGG	2	10	887569	887578	0 %	20 %	60 %	20 %	24372448
13007	NC_004347	TTC	2	6	887617	887622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372448
13008	NC_004347	CCAAAT	2	12	887695	887706	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	24372448
13009	NC_004347	TGC	2	6	887806	887811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372448
13010	NC_004347	AGA	2	6	887836	887841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372448
13011	NC_004347	GCA	2	6	887905	887910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372448
13012	NC_004347	GAT	2	6	887929	887934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372448
13013	NC_004347	TGAT	2	8	887967	887974	25 %	50 %	25 %	0 %	24372448
13014	NC_004347	TGCT	2	8	887979	887986	0 %	50 %	25 %	25 %	24372448
13015	NC_004347	CAA	2	6	888070	888075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561820
13016	NC_004347	GTC	2	6	888081	888086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561820
13017	NC_004347	GAT	2	6	888087	888092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561820
13018	NC_004347	TGG	2	6	888115	888120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561820
13019	NC_004347	ATG	2	6	888222	888227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561820
13020	NC_004347	GAAT	2	8	888232	888239	50 %	25 %	25 %	0 %	414561820
13021	NC_004347	ATTAC	2	10	888361	888370	40 %	40 %	0 %	20 %	414561820
13022	NC_004347	GTC	2	6	888390	888395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561820
13023	NC_004347	GAA	2	6	888480	888485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561820
13024	NC_004347	ATT	2	6	888498	888503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561820
13025	NC_004347	CGC	2	6	888518	888523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561820
13026	NC_004347	A	6	6	888687	888692	100 %	0 %	0 %	0 %	414561820
13027	NC_004347	GCA	3	9	888728	888736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561820
13028	NC_004347	GCT	2	6	888779	888784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561820
13029	NC_004347	GCG	2	6	888794	888799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561820
13030	NC_004347	CAC	2	6	888813	888818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414561820
13031	NC_004347	ATGGG	2	10	888824	888833	20 %	20 %	60 %	0 %	414561820
13032	NC_004347	AGC	2	6	888937	888942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561820
13033	NC_004347	CGA	2	6	888958	888963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561820
13034	NC_004347	ACT	2	6	888968	888973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561820
13035	NC_004347	GCA	2	6	888989	888994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561820
13036	NC_004347	TGG	2	6	889009	889014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561820
13037	NC_004347	ACTT	2	8	889059	889066	25 %	50 %	0 %	25 %	414561820
13038	NC_004347	AAC	2	6	889179	889184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372450
13039	NC_004347	GA	3	6	889196	889201	50 %	0 %	50 %	0 %	24372450
13040	NC_004347	GGA	2	6	889414	889419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372450
13041	NC_004347	TTA	2	6	889491	889496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372450
13042	NC_004347	GTAC	2	8	889537	889544	25 %	25 %	25 %	25 %	24372450
13043	NC_004347	AAAT	2	8	889669	889676	75 %	25 %	0 %	0 %	24372450
13044	NC_004347	TCC	2	6	889797	889802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372450
13045	NC_004347	CAG	2	6	889886	889891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372450
13046	NC_004347	TTGG	2	8	889973	889980	0 %	50 %	50 %	0 %	24372450
13047	NC_004347	CTA	2	6	890322	890327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372451
13048	NC_004347	CTT	2	6	890331	890336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372451
13049	NC_004347	GGT	2	6	890383	890388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372451
13050	NC_004347	TTG	2	6	890435	890440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372451
13051	NC_004347	TGG	2	6	890468	890473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372451
13052	NC_004347	GCCA	2	8	890575	890582	25 %	0 %	25 %	50 %	24372451
13053	NC_004347	ACC	2	6	890620	890625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372451
13054	NC_004347	AGC	2	6	890639	890644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372451
13055	NC_004347	TCA	3	9	890678	890686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372451
13056	NC_004347	TGC	2	6	890805	890810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372451
13057	NC_004347	CGG	2	6	890832	890837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372451
13058	NC_004347	GAA	2	6	890965	890970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372451
13059	NC_004347	GCG	2	6	891074	891079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372451
13060	NC_004347	ACC	2	6	891091	891096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372451
13061	NC_004347	CGG	2	6	891222	891227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372451
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13064	NC_004347	CGG	2	6	891303	891308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372451
13065	NC_004347	TCA	2	6	891371	891376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372451
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13067	NC_004347	CAG	2	6	891435	891440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372451
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13073	NC_004347	T	6	6	891829	891834	0 %	100 %	0 %	0 %	24372452
13074	NC_004347	TG	3	6	891851	891856	0 %	50 %	50 %	0 %	24372452
13075	NC_004347	TTGT	2	8	891857	891864	0 %	75 %	25 %	0 %	24372452
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13085	NC_004347	GGT	2	6	893045	893050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561821
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13087	NC_004347	TGC	2	6	893098	893103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561821
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13089	NC_004347	ATT	2	6	893130	893135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561821
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13091	NC_004347	TCT	2	6	893217	893222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561821
13092	NC_004347	ATT	2	6	893258	893263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561821
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13096	NC_004347	CTG	2	6	893738	893743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372454
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13102	NC_004347	GTT	2	6	893982	893987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372454
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13104	NC_004347	AAATCG	2	12	894004	894015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	24372454
13105	NC_004347	GTT	2	6	894062	894067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372454
13106	NC_004347	CGT	2	6	894077	894082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372454
13107	NC_004347	ATC	2	6	894228	894233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372454
13108	NC_004347	GTT	2	6	894261	894266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372454
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13110	NC_004347	TGT	2	6	894362	894367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372454
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13116	NC_004347	CTT	2	6	894560	894565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372454
13117	NC_004347	CAA	2	6	894569	894574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372454
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13483	NC_004347	CTGGCG	2	12	917976	917987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24372477
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