MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004347	TCG	2	6	676711	676716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372243
10002	NC_004347	CCA	2	6	676812	676817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372243
10003	NC_004347	CCTA	2	8	676827	676834	25 %	25 %	0 %	50 %	24372243
10004	NC_004347	GGCG	2	8	676835	676842	0 %	0 %	75 %	25 %	24372243
10005	NC_004347	GCA	2	6	676994	676999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372243
10006	NC_004347	TGA	2	6	677187	677192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561794
10007	NC_004347	GATT	2	8	677234	677241	25 %	50 %	25 %	0 %	414561794
10008	NC_004347	AGA	2	6	677247	677252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561794
10009	NC_004347	T	6	6	677319	677324	0 %	100 %	0 %	0 %	414561794
10010	NC_004347	TTG	2	6	677334	677339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561794
10011	NC_004347	ACAGGA	2	12	677359	677370	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414561794
10012	NC_004347	ACT	2	6	677378	677383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561794
10013	NC_004347	GAT	2	6	677395	677400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561794
10014	NC_004347	ATGT	2	8	677422	677429	25 %	50 %	25 %	0 %	414561794
10015	NC_004347	T	7	7	677449	677455	0 %	100 %	0 %	0 %	414561794
10016	NC_004347	TAC	2	6	677588	677593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561794
10017	NC_004347	GAAA	2	8	677595	677602	75 %	0 %	25 %	0 %	414561794
10018	NC_004347	TAAA	2	8	677642	677649	75 %	25 %	0 %	0 %	414561794
10019	NC_004347	TGAA	2	8	677654	677661	50 %	25 %	25 %	0 %	414561794
10020	NC_004347	T	6	6	677712	677717	0 %	100 %	0 %	0 %	414561794
10021	NC_004347	ATG	2	6	677750	677755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561794
10022	NC_004347	GAT	2	6	677830	677835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561794
10023	NC_004347	TGC	2	6	677868	677873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561794
10024	NC_004347	A	7	7	677937	677943	100 %	0 %	0 %	0 %	24372245
10025	NC_004347	ATT	2	6	677952	677957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372245
10026	NC_004347	TGC	2	6	677963	677968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372245
10027	NC_004347	CCAA	2	8	678118	678125	50 %	0 %	0 %	50 %	24372245
10028	NC_004347	ATCGT	2	10	678219	678228	20 %	40 %	20 %	20 %	24372245
10029	NC_004347	TGG	2	6	678340	678345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372245
10030	NC_004347	GTT	2	6	678363	678368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372245
10031	NC_004347	AGA	2	6	678377	678382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372245
10032	NC_004347	CTAT	2	8	678604	678611	25 %	50 %	0 %	25 %	24372246
10033	NC_004347	GAT	2	6	678731	678736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372246
10034	NC_004347	ATC	2	6	678785	678790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372246
10035	NC_004347	TTA	2	6	678881	678886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24372246
10036	NC_004347	A	6	6	679116	679121	100 %	0 %	0 %	0 %	414561795
10037	NC_004347	GGAA	2	8	679243	679250	50 %	0 %	50 %	0 %	414561795
10038	NC_004347	CAA	2	6	679266	679271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561795
10039	NC_004347	AGA	2	6	679283	679288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561795
10040	NC_004347	TGA	2	6	679298	679303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561795
10041	NC_004347	A	6	6	679358	679363	100 %	0 %	0 %	0 %	414561795
10042	NC_004347	CTT	2	6	679373	679378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561795
10043	NC_004347	GA	3	6	679382	679387	50 %	0 %	50 %	0 %	414561795
10044	NC_004347	TCA	2	6	679407	679412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561795
10045	NC_004347	GAA	2	6	679597	679602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561795
10046	NC_004347	AAGG	2	8	679610	679617	50 %	0 %	50 %	0 %	414561795
10047	NC_004347	TCGT	2	8	679638	679645	0 %	50 %	25 %	25 %	414561795
10048	NC_004347	GAC	2	6	679699	679704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561795
10049	NC_004347	GTGAC	2	10	679788	679797	20 %	20 %	40 %	20 %	414561795
10050	NC_004347	TAA	2	6	679917	679922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561795
10051	NC_004347	GCT	2	6	680008	680013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561795
10052	NC_004347	GTT	2	6	680072	680077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561795
10053	NC_004347	CAAC	2	8	680126	680133	50 %	0 %	0 %	50 %	414561795
10054	NC_004347	TAA	2	6	680203	680208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561795
10055	NC_004347	GCG	2	6	680428	680433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561796
10056	NC_004347	TGCC	2	8	680462	680469	0 %	25 %	25 %	50 %	414561796
10057	NC_004347	TAC	2	6	680478	680483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561796
10058	NC_004347	TTA	2	6	680535	680540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561796
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10060	NC_004347	GCA	2	6	680666	680671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372250
10061	NC_004347	AGC	2	6	680868	680873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372250
10062	NC_004347	TGC	2	6	680874	680879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372250
10063	NC_004347	CTA	2	6	681039	681044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372250
10064	NC_004347	GCCGA	2	10	681132	681141	20 %	0 %	40 %	40 %	24372250
10065	NC_004347	CGCC	2	8	681194	681201	0 %	0 %	25 %	75 %	414561797
10066	NC_004347	ACA	2	6	681280	681285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561797
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10068	NC_004347	TCAA	2	8	681485	681492	50 %	25 %	0 %	25 %	414561797
10069	NC_004347	TGT	2	6	681555	681560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561797
10070	NC_004347	GCA	2	6	681697	681702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561797
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10072	NC_004347	ACA	2	6	681930	681935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24372252
10073	NC_004347	ATTG	2	8	681958	681965	25 %	50 %	25 %	0 %	24372252
10074	NC_004347	AGC	2	6	682043	682048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372252
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10080	NC_004347	ACT	2	6	682614	682619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372254
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10086	NC_004347	CAG	2	6	683069	683074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372256
10087	NC_004347	GAA	2	6	683087	683092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372256
10088	NC_004347	AGC	2	6	683110	683115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372256
10089	NC_004347	TCT	2	6	683134	683139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372256
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10092	NC_004347	GCCA	2	8	683399	683406	25 %	0 %	25 %	50 %	24372256
10093	NC_004347	GCC	2	6	683438	683443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372256
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10098	NC_004347	ACTG	2	8	683769	683776	25 %	25 %	25 %	25 %	24372257
10099	NC_004347	GCC	2	6	683782	683787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372257
10100	NC_004347	ACCA	2	8	683803	683810	50 %	0 %	0 %	50 %	24372257
10101	NC_004347	TGC	2	6	683856	683861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372257
10102	NC_004347	AGC	2	6	683889	683894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372257
10103	NC_004347	GAT	2	6	683923	683928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372257
10104	NC_004347	AAG	2	6	683933	683938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372257
10105	NC_004347	TCT	2	6	683971	683976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24372257
10106	NC_004347	A	6	6	684193	684198	100 %	0 %	0 %	0 %	24372257
10107	NC_004347	GGA	2	6	684354	684359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24372257
10108	NC_004347	TTGA	2	8	684409	684416	25 %	50 %	25 %	0 %	24372257
10109	NC_004347	AGT	2	6	684529	684534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372257
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10111	NC_004347	TTG	2	6	684725	684730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372257
10112	NC_004347	GGT	2	6	684751	684756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372257
10113	NC_004347	TGAG	2	8	684842	684849	25 %	25 %	50 %	0 %	24372257
10114	NC_004347	TGA	2	6	684918	684923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372257
10115	NC_004347	ATAA	2	8	684955	684962	75 %	25 %	0 %	0 %	24372257
10116	NC_004347	AAAGAA	2	12	685000	685011	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	24372257
10117	NC_004347	TGC	2	6	685023	685028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372257
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10119	NC_004347	GAT	3	9	685144	685152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372257
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