MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_004347	CAG	2	6	535694	535699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372104
8002	NC_004347	CG	4	8	535711	535718	0 %	0 %	50 %	50 %	24372104
8003	NC_004347	TCA	2	6	535818	535823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372104
8004	NC_004347	GCA	2	6	535833	535838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372104
8005	NC_004347	TTG	2	6	535853	535858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372104
8006	NC_004347	GCG	2	6	535959	535964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372104
8007	NC_004347	ATC	2	6	535995	536000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372104
8008	NC_004347	TCA	2	6	536064	536069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372105
8009	NC_004347	ATG	2	6	536094	536099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372105
8010	NC_004347	GCA	2	6	536217	536222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372105
8011	NC_004347	GA	3	6	536242	536247	50 %	0 %	50 %	0 %	24372105
8012	NC_004347	GGCAT	2	10	536271	536280	20 %	20 %	40 %	20 %	24372105
8013	NC_004347	TG	3	6	536319	536324	0 %	50 %	50 %	0 %	24372105
8014	NC_004347	CTC	2	6	536387	536392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24372105
8015	NC_004347	T	6	6	536447	536452	0 %	100 %	0 %	0 %	24372105
8016	NC_004347	GTG	2	6	536619	536624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372106
8017	NC_004347	AGT	2	6	536689	536694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372106
8018	NC_004347	ATA	2	6	536740	536745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372106
8019	NC_004347	ATC	2	6	536746	536751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372106
8020	NC_004347	CAG	2	6	536825	536830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372106
8021	NC_004347	TGA	2	6	536875	536880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372106
8022	NC_004347	CGG	2	6	536899	536904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372106
8023	NC_004347	TGA	2	6	536930	536935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372106
8024	NC_004347	T	6	6	537102	537107	0 %	100 %	0 %	0 %	414561778
8025	NC_004347	GTTTG	2	10	537118	537127	0 %	60 %	40 %	0 %	414561778
8026	NC_004347	GCT	2	6	537128	537133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561778
8027	NC_004347	T	6	6	537158	537163	0 %	100 %	0 %	0 %	414561778
8028	NC_004347	CTGGC	2	10	537240	537249	0 %	20 %	40 %	40 %	414561778
8029	NC_004347	ATG	2	6	537255	537260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561778
8030	NC_004347	GCA	2	6	537298	537303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414561778
8031	NC_004347	GCT	2	6	537307	537312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561778
8032	NC_004347	AGG	2	6	537328	537333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414561778
8033	NC_004347	TTATG	2	10	537607	537616	20 %	60 %	20 %	0 %	414561779
8034	NC_004347	TTA	2	6	537643	537648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561779
8035	NC_004347	CT	3	6	537669	537674	0 %	50 %	0 %	50 %	414561779
8036	NC_004347	CAGC	2	8	537699	537706	25 %	0 %	25 %	50 %	414561779
8037	NC_004347	GGC	2	6	537846	537851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561779
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8039	NC_004347	GAAT	2	8	538000	538007	50 %	25 %	25 %	0 %	414561780
8040	NC_004347	TTG	2	6	538015	538020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561780
8041	NC_004347	TGA	2	6	538025	538030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561780
8042	NC_004347	TGC	2	6	538393	538398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372110
8043	NC_004347	GAA	2	6	538452	538457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24372110
8044	NC_004347	ATC	2	6	538465	538470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372110
8045	NC_004347	ACC	2	6	538497	538502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24372110
8046	NC_004347	TG	3	6	538512	538517	0 %	50 %	50 %	0 %	24372110
8047	NC_004347	AGC	2	6	538574	538579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372110
8048	NC_004347	CAG	2	6	538597	538602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372110
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8050	NC_004347	CGG	2	6	538682	538687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372110
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8052	NC_004347	GTTTG	2	10	539059	539068	0 %	60 %	40 %	0 %	24372112
8053	NC_004347	GCT	2	6	539087	539092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372112
8054	NC_004347	GTT	2	6	539108	539113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372112
8055	NC_004347	GCA	2	6	539114	539119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372112
8056	NC_004347	CAAA	2	8	539233	539240	75 %	0 %	0 %	25 %	24372112
8057	NC_004347	GCA	2	6	539278	539283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372112
8058	NC_004347	GCG	3	9	539303	539311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372112
8059	NC_004347	GCG	2	6	539415	539420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372112
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8061	NC_004347	AGC	2	6	539598	539603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24372112
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8070	NC_004347	TAA	2	6	539977	539982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372112
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8085	NC_004347	A	6	6	540838	540843	100 %	0 %	0 %	0 %	24372113
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8088	NC_004347	GGTGAT	2	12	541486	541497	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	24372113
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8093	NC_004347	GTG	2	6	541788	541793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372114
8094	NC_004347	GCT	2	6	541799	541804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372114
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8099	NC_004347	GTC	2	6	542025	542030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24372114
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8102	NC_004347	GGGT	2	8	542113	542120	0 %	25 %	75 %	0 %	24372114
8103	NC_004347	GCC	2	6	542205	542210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372114
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8107	NC_004347	GTGA	2	8	542364	542371	25 %	25 %	50 %	0 %	24372114
8108	NC_004347	AAT	2	6	542385	542390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24372114
8109	NC_004347	TGG	2	6	542399	542404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372114
8110	NC_004347	GTG	2	6	542436	542441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372114
8111	NC_004347	CCG	2	6	542461	542466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372114
8112	NC_004347	CGC	2	6	542595	542600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372114
8113	NC_004347	GTG	2	6	542646	542651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372114
8114	NC_004347	GAT	2	6	542688	542693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372114
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8118	NC_004347	CGC	2	6	543051	543056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24372114
8119	NC_004347	TGA	2	6	543110	543115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24372114
8120	NC_004347	TGG	2	6	543119	543124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24372114
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8122	NC_004347	ATC	2	6	543145	543150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24372114
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8494	NC_004347	GTT	2	6	566391	566396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24372138
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8496	NC_004347	GGC	2	6	566529	566534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24372138
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8499	NC_004347	GTTG	2	8	566653	566660	0 %	50 %	50 %	0 %	414561782
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