MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_004347	GCACTG	2	12	4335733	4335744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	24375648
63002	NC_004347	ACCA	2	8	4335820	4335827	50 %	0 %	0 %	50 %	24375648
63003	NC_004347	GAA	2	6	4335841	4335846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375648
63004	NC_004347	C	6	6	4335890	4335895	0 %	0 %	0 %	100 %	24375649
63005	NC_004347	AAG	2	6	4336013	4336018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375649
63006	NC_004347	A	6	6	4336026	4336031	100 %	0 %	0 %	0 %	24375649
63007	NC_004347	TGA	2	6	4336037	4336042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375649
63008	NC_004347	CGC	2	6	4336078	4336083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375649
63009	NC_004347	AAG	2	6	4336157	4336162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375649
63010	NC_004347	ATC	2	6	4336171	4336176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375649
63011	NC_004347	AGC	2	6	4336214	4336219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375649
63012	NC_004347	GCC	2	6	4336232	4336237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375649
63013	NC_004347	AGA	2	6	4336245	4336250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375649
63014	NC_004347	CTG	2	6	4336279	4336284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375649
63015	NC_004347	GAC	2	6	4336306	4336311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375649
63016	NC_004347	AAG	2	6	4336348	4336353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375649
63017	NC_004347	GAA	2	6	4336444	4336449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375649
63018	NC_004347	ACCA	2	8	4336453	4336460	50 %	0 %	0 %	50 %	24375649
63019	NC_004347	AAG	2	6	4336523	4336528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375649
63020	NC_004347	GAA	3	9	4336546	4336554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375649
63021	NC_004347	AAG	2	6	4336574	4336579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375649
63022	NC_004347	CGA	2	6	4336632	4336637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375649
63023	NC_004347	GAT	2	6	4336879	4336884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375649
63024	NC_004347	AT	3	6	4336929	4336934	50 %	50 %	0 %	0 %	24375649
63025	NC_004347	ATT	2	6	4336960	4336965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375649
63026	NC_004347	GGC	2	6	4337001	4337006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375649
63027	NC_004347	CGT	2	6	4337044	4337049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375649
63028	NC_004347	TGAT	2	8	4337123	4337130	25 %	50 %	25 %	0 %	24375649
63029	NC_004347	CCG	2	6	4337472	4337477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375650
63030	NC_004347	CGA	2	6	4337578	4337583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375650
63031	NC_004347	AGC	2	6	4338549	4338554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375651
63032	NC_004347	TCCG	2	8	4338616	4338623	0 %	25 %	25 %	50 %	24375651
63033	NC_004347	CAGT	2	8	4338813	4338820	25 %	25 %	25 %	25 %	24375651
63034	NC_004347	A	6	6	4338985	4338990	100 %	0 %	0 %	0 %	24375651
63035	NC_004347	TAA	2	6	4339060	4339065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375651
63036	NC_004347	GTG	2	6	4339068	4339073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24375651
63037	NC_004347	CCA	2	6	4339171	4339176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375651
63038	NC_004347	A	6	6	4339207	4339212	100 %	0 %	0 %	0 %	24375651
63039	NC_004347	AAG	2	6	4339263	4339268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375651
63040	NC_004347	ATT	2	6	4339365	4339370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375651
63041	NC_004347	ACCAAA	2	12	4339451	4339462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375651
63042	NC_004347	TTG	2	6	4339487	4339492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375651
63043	NC_004347	ATTT	2	8	4339580	4339587	25 %	75 %	0 %	0 %	24375651
63044	NC_004347	CAG	2	6	4341824	4341829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375655
63045	NC_004347	CGA	2	6	4342060	4342065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375655
63046	NC_004347	CTC	2	6	4342163	4342168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24375655
63047	NC_004347	CAA	2	6	4342375	4342380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375655
63048	NC_004347	TCGC	2	8	4342458	4342465	0 %	25 %	25 %	50 %	24375655
63049	NC_004347	CG	3	6	4342529	4342534	0 %	0 %	50 %	50 %	24375655
63050	NC_004347	ACT	2	6	4342866	4342871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375655
63051	NC_004347	TGGCA	2	10	4342874	4342883	20 %	20 %	40 %	20 %	24375655
63052	NC_004347	GAAT	2	8	4342890	4342897	50 %	25 %	25 %	0 %	24375655
63053	NC_004347	CAC	2	6	4342904	4342909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375655
63054	NC_004347	CAT	2	6	4342943	4342948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375655
63055	NC_004347	GCG	2	6	4343196	4343201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375655
63056	NC_004347	CG	3	6	4343252	4343257	0 %	0 %	50 %	50 %	24375655
63057	NC_004347	GGC	2	6	4343424	4343429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375656
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63059	NC_004347	CAT	2	6	4343508	4343513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375656
63060	NC_004347	GAG	2	6	4343571	4343576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24375656
63061	NC_004347	TGC	2	6	4343638	4343643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375656
63062	NC_004347	A	6	6	4343665	4343670	100 %	0 %	0 %	0 %	24375656
63063	NC_004347	T	6	6	4343693	4343698	0 %	100 %	0 %	0 %	24375656
63064	NC_004347	ATA	2	6	4343704	4343709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375656
63065	NC_004347	TGC	2	6	4343734	4343739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375656
63066	NC_004347	GCA	2	6	4343812	4343817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375656
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63068	NC_004347	GCG	2	6	4343865	4343870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375656
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63071	NC_004347	CAC	2	6	4343951	4343956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375656
63072	NC_004347	CAG	2	6	4343982	4343987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375656
63073	NC_004347	TAT	2	6	4344044	4344049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375656
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63077	NC_004347	TAA	2	6	4344301	4344306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375657
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63083	NC_004347	CCGC	2	8	4344495	4344502	0 %	0 %	25 %	75 %	24375657
63084	NC_004347	CTG	2	6	4344527	4344532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375657
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63086	NC_004347	TCAC	2	8	4344688	4344695	25 %	25 %	0 %	50 %	24375658
63087	NC_004347	TAA	2	6	4344705	4344710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375658
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63089	NC_004347	CTG	2	6	4344789	4344794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375658
63090	NC_004347	GCG	2	6	4344827	4344832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375658
63091	NC_004347	GTC	2	6	4344834	4344839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375658
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63099	NC_004347	ATC	2	6	4345191	4345196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375658
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63101	NC_004347	GCC	2	6	4345280	4345285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414562235
63102	NC_004347	TAA	2	6	4345382	4345387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562235
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63104	NC_004347	GCGG	2	8	4345523	4345530	0 %	0 %	75 %	25 %	414562235
63105	NC_004347	TCT	2	6	4345590	4345595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562235
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63108	NC_004347	GAC	2	6	4345705	4345710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562235
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63110	NC_004347	TGG	2	6	4345993	4345998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562235
63111	NC_004347	CCATG	2	10	4346059	4346068	20 %	20 %	20 %	40 %	414562235
63112	NC_004347	TGC	2	6	4346070	4346075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562235
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63115	NC_004347	CGCCC	2	10	4346216	4346225	0 %	0 %	20 %	80 %	414562235
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