MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_004347	CCA	2	6	3845304	3845309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375191
56002	NC_004347	CG	3	6	3845316	3845321	0 %	0 %	50 %	50 %	24375191
56003	NC_004347	CTC	2	6	3845362	3845367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24375191
56004	NC_004347	TAA	2	6	3845530	3845535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375191
56005	NC_004347	CCA	2	6	3845543	3845548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375191
56006	NC_004347	AGG	2	6	3845591	3845596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24375191
56007	NC_004347	GAC	2	6	3846040	3846045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375192
56008	NC_004347	CG	3	6	3846115	3846120	0 %	0 %	50 %	50 %	24375192
56009	NC_004347	C	6	6	3846142	3846147	0 %	0 %	0 %	100 %	24375192
56010	NC_004347	CGAT	2	8	3846149	3846156	25 %	25 %	25 %	25 %	24375192
56011	NC_004347	TAC	2	6	3846175	3846180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375192
56012	NC_004347	TAAAGC	2	12	3846273	3846284	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	24375192
56013	NC_004347	CTG	2	6	3846317	3846322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375192
56014	NC_004347	CGA	3	9	3846326	3846334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375192
56015	NC_004347	A	6	6	3846360	3846365	100 %	0 %	0 %	0 %	24375192
56016	NC_004347	TGT	2	6	3846404	3846409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375192
56017	NC_004347	TGAC	2	8	3846428	3846435	25 %	25 %	25 %	25 %	24375192
56018	NC_004347	CAC	2	6	3846537	3846542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24375192
56019	NC_004347	GCC	2	6	3846586	3846591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375192
56020	NC_004347	TGGC	2	8	3846635	3846642	0 %	25 %	50 %	25 %	24375192
56021	NC_004347	AGCA	2	8	3846695	3846702	50 %	0 %	25 %	25 %	24375192
56022	NC_004347	TTC	2	6	3846736	3846741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24375192
56023	NC_004347	GCC	2	6	3846784	3846789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375192
56024	NC_004347	A	6	6	3846949	3846954	100 %	0 %	0 %	0 %	24375192
56025	NC_004347	GTC	2	6	3846997	3847002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375192
56026	NC_004347	ATTG	2	8	3847024	3847031	25 %	50 %	25 %	0 %	24375192
56027	NC_004347	TTA	2	6	3847244	3847249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375193
56028	NC_004347	TGA	2	6	3847269	3847274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375193
56029	NC_004347	TTC	2	6	3847288	3847293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24375193
56030	NC_004347	TTA	2	6	3847390	3847395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375193
56031	NC_004347	AGA	2	6	3847450	3847455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375193
56032	NC_004347	ACA	2	6	3847458	3847463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375193
56033	NC_004347	ATA	2	6	3847575	3847580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375193
56034	NC_004347	TTG	2	6	3847581	3847586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375193
56035	NC_004347	CAA	2	6	3847721	3847726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24375193
56036	NC_004347	CGC	2	6	3847805	3847810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375193
56037	NC_004347	CAAC	2	8	3847873	3847880	50 %	0 %	0 %	50 %	24375193
56038	NC_004347	GGC	2	6	3847909	3847914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375193
56039	NC_004347	TAT	2	6	3848126	3848131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375193
56040	NC_004347	CAAC	2	8	3848472	3848479	50 %	0 %	0 %	50 %	414562183
56041	NC_004347	GCT	2	6	3848566	3848571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562183
56042	NC_004347	GTC	2	6	3848641	3848646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562183
56043	NC_004347	ACG	2	6	3848687	3848692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562183
56044	NC_004347	TGG	2	6	3848708	3848713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562183
56045	NC_004347	GTGA	2	8	3848722	3848729	25 %	25 %	50 %	0 %	414562183
56046	NC_004347	ATC	2	6	3848978	3848983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375195
56047	NC_004347	GCC	2	6	3849149	3849154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24375195
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56049	NC_004347	GTG	2	6	3849285	3849290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24375195
56050	NC_004347	GT	3	6	3849360	3849365	0 %	50 %	50 %	0 %	24375195
56051	NC_004347	TAA	2	6	3849931	3849936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562184
56052	NC_004347	CAAAAC	2	12	3849989	3850000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562184
56053	NC_004347	CCA	2	6	3850074	3850079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562184
56054	NC_004347	ATG	2	6	3850121	3850126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562184
56055	NC_004347	ACT	2	6	3850128	3850133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562184
56056	NC_004347	CGCAA	2	10	3850204	3850213	40 %	0 %	20 %	40 %	414562184
56057	NC_004347	TCC	2	6	3850224	3850229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562184
56058	NC_004347	CGA	2	6	3850565	3850570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24375197
56059	NC_004347	GCAAG	2	10	3850571	3850580	40 %	0 %	40 %	20 %	24375197
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56061	NC_004347	CT	3	6	3850667	3850672	0 %	50 %	0 %	50 %	24375197
56062	NC_004347	GCTG	2	8	3850673	3850680	0 %	25 %	50 %	25 %	24375197
56063	NC_004347	TGA	2	6	3850751	3850756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24375197
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56065	NC_004347	CTG	2	6	3850846	3850851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375197
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56071	NC_004347	GCT	2	6	3851220	3851225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24375197
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56074	NC_004347	T	6	6	3851370	3851375	0 %	100 %	0 %	0 %	24375197
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56091	NC_004347	TAA	2	6	3852319	3852324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24375198
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56102	NC_004347	TTG	2	6	3853335	3853340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24375201
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56116	NC_004347	ACACC	2	10	3855004	3855013	40 %	0 %	0 %	60 %	24375202
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56226	NC_004347	TTGA	2	8	3862036	3862043	25 %	50 %	25 %	0 %	24375211
56227	NC_004347	CTT	2	6	3862085	3862090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24375211
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56230	NC_004347	A	8	8	3862287	3862294	100 %	0 %	0 %	0 %	24375211
56231	NC_004347	AGA	2	6	3862344	3862349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24375211
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56233	NC_004347	TCC	2	6	3862401	3862406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24375211
56234	NC_004347	TTA	2	6	3862909	3862914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24375212
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56475	NC_004347	TCA	2	6	3881830	3881835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24375233
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56477	NC_004347	CGG	2	6	3882008	3882013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24375233
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