MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_004337	CCG	2	6	3112124	3112129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480230
49003	NC_004337	AAT	2	6	3112192	3112197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56480230
49004	NC_004337	T	7	7	3112239	3112245	0 %	100 %	0 %	0 %	56480230
49005	NC_004337	CTC	2	6	3113470	3113475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532141289
49006	NC_004337	CGC	2	6	3113509	3113514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141289
49007	NC_004337	GCT	2	6	3113524	3113529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141289
49008	NC_004337	GCT	2	6	3113536	3113541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141289
49009	NC_004337	CCA	2	6	3113580	3113585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532141289
49010	NC_004337	GCGAT	2	10	3113628	3113637	20 %	20 %	40 %	20 %	532141289
49011	NC_004337	CAGC	2	8	3113666	3113673	25 %	0 %	25 %	50 %	532141289
49012	NC_004337	CGCCC	2	10	3113678	3113687	0 %	0 %	20 %	80 %	532141289
49013	NC_004337	CAT	2	6	3113717	3113722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141289
49014	NC_004337	GAA	2	6	3113771	3113776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532141289
49015	NC_004337	GTT	3	9	3113782	3113790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532141289
49016	NC_004337	TGC	2	6	3113799	3113804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141289
49017	NC_004337	CAG	2	6	3113834	3113839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141289
49018	NC_004337	GCT	2	6	3113847	3113852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141289
49019	NC_004337	CGC	2	6	3113866	3113871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141289
49020	NC_004337	CTT	2	6	3113962	3113967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532141289
49021	NC_004337	AG	3	6	3113994	3113999	50 %	0 %	50 %	0 %	532141289
49022	NC_004337	CGCGGT	2	12	3114003	3114014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532141289
49023	NC_004337	GA	3	6	3114078	3114083	50 %	0 %	50 %	0 %	532141289
49024	NC_004337	TCA	2	6	3114103	3114108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141289
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49026	NC_004337	ATG	2	6	3114147	3114152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532141289
49027	NC_004337	CTT	2	6	3114241	3114246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532141289
49028	NC_004337	GCG	2	6	3114256	3114261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532141289
49029	NC_004337	CCA	2	6	3114310	3114315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532141289
49030	NC_004337	GCG	2	6	3114316	3114321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532141289
49031	NC_004337	TCGG	2	8	3114348	3114355	0 %	25 %	50 %	25 %	532141289
49032	NC_004337	TGC	2	6	3114436	3114441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141289
49033	NC_004337	GCG	2	6	3114454	3114459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532141289
49034	NC_004337	CAG	2	6	3114491	3114496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141289
49035	NC_004337	AG	3	6	3116314	3116319	50 %	0 %	50 %	0 %	56480231
49036	NC_004337	GGTC	2	8	3116353	3116360	0 %	25 %	50 %	25 %	56480231
49037	NC_004337	TG	3	6	3116385	3116390	0 %	50 %	50 %	0 %	56480231
49038	NC_004337	TGC	2	6	3116436	3116441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480231
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49043	NC_004337	CGC	2	6	3116671	3116676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480231
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49046	NC_004337	GATC	2	8	3116866	3116873	25 %	25 %	25 %	25 %	56480231
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49048	NC_004337	GC	3	6	3116936	3116941	0 %	0 %	50 %	50 %	56480231
49049	NC_004337	CCA	2	6	3116992	3116997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480231
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49051	NC_004337	CCTA	2	8	3118708	3118715	25 %	25 %	0 %	50 %	56480232
49052	NC_004337	CGC	2	6	3118759	3118764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480232
49053	NC_004337	GAAT	2	8	3118779	3118786	50 %	25 %	25 %	0 %	56480232
49054	NC_004337	GTT	2	6	3118867	3118872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56480232
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49056	NC_004337	T	7	7	3118942	3118948	0 %	100 %	0 %	0 %	56480232
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49059	NC_004337	GCA	2	6	3119229	3119234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56480232
49060	NC_004337	C	6	6	3119387	3119392	0 %	0 %	0 %	100 %	56480232
49061	NC_004337	ATT	2	6	3119415	3119420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56480232
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49064	NC_004337	TGAA	2	8	3119535	3119542	50 %	25 %	25 %	0 %	56480232
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49067	NC_004337	GCTG	2	8	3119701	3119708	0 %	25 %	50 %	25 %	56480232
49068	NC_004337	TGA	2	6	3119719	3119724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56480232
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49070	NC_004337	CTG	2	6	3120017	3120022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56480232
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49073	NC_004337	ATTC	2	8	3120128	3120135	25 %	50 %	0 %	25 %	56480232
49074	NC_004337	GCGAT	2	10	3120138	3120147	20 %	20 %	40 %	20 %	56480232
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49088	NC_004337	GCA	2	6	3120799	3120804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24114283
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49090	NC_004337	CT	3	6	3120937	3120942	0 %	50 %	0 %	50 %	24114283
49091	NC_004337	TTC	2	6	3120944	3120949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114283
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49097	NC_004337	GC	3	6	3121616	3121621	0 %	0 %	50 %	50 %	24114285
49098	NC_004337	TGA	2	6	3121681	3121686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114285
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49100	NC_004337	AAT	2	6	3121745	3121750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114285
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49102	NC_004337	GGCACC	2	12	3121814	3121825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	24114285
49103	NC_004337	TGT	2	6	3122806	3122811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114287
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49105	NC_004337	CAGC	2	8	3123017	3123024	25 %	0 %	25 %	50 %	24114287
49106	NC_004337	ATC	2	6	3123028	3123033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114287
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49114	NC_004337	TCG	2	6	3123340	3123345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114287
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49116	NC_004337	GATTT	2	10	3123481	3123490	20 %	60 %	20 %	0 %	24114287
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