MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004337	TGG	2	6	198468	198473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111619
3502	NC_004337	CCA	2	6	198506	198511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111619
3503	NC_004337	ACG	3	9	198546	198554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111619
3504	NC_004337	CAT	2	6	198613	198618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111619
3505	NC_004337	TAA	2	6	198628	198633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111619
3506	NC_004337	GGC	2	6	198635	198640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
3507	NC_004337	CGG	2	6	198695	198700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
3508	NC_004337	CG	3	6	198752	198757	0 %	0 %	50 %	50 %	24111619
3509	NC_004337	TGA	2	6	198762	198767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
3510	NC_004337	GGT	2	6	198910	198915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111619
3511	NC_004337	TCA	2	6	199047	199052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111619
3512	NC_004337	GTT	2	6	199067	199072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111619
3513	NC_004337	CG	3	6	199075	199080	0 %	0 %	50 %	50 %	24111619
3514	NC_004337	GGC	2	6	199140	199145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111619
3515	NC_004337	TGT	2	6	199155	199160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111619
3516	NC_004337	TGA	2	6	199237	199242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
3517	NC_004337	TGA	2	6	199348	199353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111619
3518	NC_004337	CTA	2	6	199420	199425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111619
3519	NC_004337	CG	4	8	199442	199449	0 %	0 %	50 %	50 %	24111619
3520	NC_004337	TC	3	6	199476	199481	0 %	50 %	0 %	50 %	24111619
3521	NC_004337	TTA	2	6	199493	199498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111619
3522	NC_004337	GAA	2	6	199676	199681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111620
3523	NC_004337	A	6	6	199698	199703	100 %	0 %	0 %	0 %	24111620
3524	NC_004337	TGA	2	6	199813	199818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111620
3525	NC_004337	CTGG	2	8	199829	199836	0 %	25 %	50 %	25 %	24111620
3526	NC_004337	TCG	2	6	199866	199871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111620
3527	NC_004337	GTC	2	6	199893	199898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111620
3528	NC_004337	TGA	2	6	199902	199907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111620
3529	NC_004337	TCA	2	6	199915	199920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111620
3530	NC_004337	A	6	6	199941	199946	100 %	0 %	0 %	0 %	24111620
3531	NC_004337	ATC	2	6	200033	200038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111620
3532	NC_004337	AGA	2	6	200080	200085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111620
3533	NC_004337	GGT	2	6	200171	200176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111620
3534	NC_004337	TGC	2	6	200220	200225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111620
3535	NC_004337	GGC	2	6	200302	200307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111620
3536	NC_004337	ATC	2	6	200321	200326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111620
3537	NC_004337	CAT	2	6	200362	200367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111620
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3539	NC_004337	GGC	2	6	200410	200415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111620
3540	NC_004337	CTG	2	6	200432	200437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111620
3541	NC_004337	A	6	6	200479	200484	100 %	0 %	0 %	0 %	24111620
3542	NC_004337	TCG	2	6	200485	200490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111620
3543	NC_004337	TGA	2	6	200502	200507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111620
3544	NC_004337	CAT	2	6	200628	200633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111621
3545	NC_004337	TGG	2	6	200699	200704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111621
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3552	NC_004337	GGC	2	6	201082	201087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111621
3553	NC_004337	A	6	6	201098	201103	100 %	0 %	0 %	0 %	24111621
3554	NC_004337	CTGT	2	8	201114	201121	0 %	50 %	25 %	25 %	24111621
3555	NC_004337	T	6	6	201129	201134	0 %	100 %	0 %	0 %	24111621
3556	NC_004337	CGG	2	6	201135	201140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111621
3557	NC_004337	CG	3	6	201234	201239	0 %	0 %	50 %	50 %	24111621
3558	NC_004337	CGC	2	6	201312	201317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111621
3559	NC_004337	TGA	3	9	201377	201385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111621
3560	NC_004337	G	7	7	201438	201444	0 %	0 %	100 %	0 %	24111621
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3562	NC_004337	ACA	2	6	201560	201565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111621
3563	NC_004337	GCG	2	6	201671	201676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111621
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3570	NC_004337	TGC	2	6	201866	201871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111621
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3592	NC_004337	GC	3	6	203406	203411	0 %	0 %	50 %	50 %	24111623
3593	NC_004337	TGG	2	6	203498	203503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111623
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3595	NC_004337	CGA	2	6	203625	203630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111623
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3603	NC_004337	CTG	2	6	203950	203955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111623
3604	NC_004337	GAT	2	6	203959	203964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111623
3605	NC_004337	CG	3	6	204034	204039	0 %	0 %	50 %	50 %	24111623
3606	NC_004337	ATT	2	6	204043	204048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111623
3607	NC_004337	CGC	2	6	204049	204054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111623
3608	NC_004337	TGGC	2	8	204055	204062	0 %	25 %	50 %	25 %	24111623
3609	NC_004337	TGGCGC	2	12	204119	204130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24111623
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3611	NC_004337	TGG	2	6	204196	204201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111623
3612	NC_004337	CGG	2	6	204272	204277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111623
3613	NC_004337	GCGT	2	8	204344	204351	0 %	25 %	50 %	25 %	24111623
3614	NC_004337	TGC	2	6	204368	204373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111623
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3618	NC_004337	CTG	2	6	204460	204465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111623
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3621	NC_004337	ACC	3	9	204635	204643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111624
3622	NC_004337	CGA	2	6	204714	204719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111624
3623	NC_004337	ATG	2	6	204808	204813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111624
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3735	NC_004337	CAA	2	6	211312	211317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111633
3736	NC_004337	GCA	2	6	211333	211338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111633
3737	NC_004337	GCA	4	12	211378	211389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111633
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3740	NC_004337	CAA	2	6	211708	211713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111633
3741	NC_004337	CCAGTG	2	12	211765	211776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	24111633
3742	NC_004337	TTTGAA	2	12	211808	211819	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	24111633
3743	NC_004337	TAAA	2	8	211913	211920	75 %	25 %	0 %	0 %	24111634
3744	NC_004337	TCA	2	6	211951	211956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111634
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3746	NC_004337	CAC	2	6	212023	212028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111634
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3991	NC_004337	GCG	2	6	232090	232095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111649
3992	NC_004337	GGCG	2	8	232101	232108	0 %	0 %	75 %	25 %	24111649
3993	NC_004337	CGCC	2	8	232120	232127	0 %	0 %	25 %	75 %	24111649
3994	NC_004337	GTGATG	2	12	232212	232223	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	24111649
3995	NC_004337	CGG	2	6	232314	232319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111649
3996	NC_004337	GCG	2	6	232334	232339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111649
3997	NC_004337	TCA	2	6	232380	232385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111649
3998	NC_004337	GTG	2	6	232428	232433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111649
3999	NC_004337	CCA	3	9	232498	232506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111649
4000	NC_004337	CGT	2	6	232517	232522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111649

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