MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_004337	GC	3	6	1181782	1181787	0 %	0 %	50 %	50 %	532141224
19503	NC_004337	ACAG	2	8	1181819	1181826	50 %	0 %	25 %	25 %	532141224
19504	NC_004337	A	6	6	1183369	1183374	100 %	0 %	0 %	0 %	56479834
19505	NC_004337	CAC	2	6	1183409	1183414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479834
19506	NC_004337	GTT	2	6	1183443	1183448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479834
19507	NC_004337	G	6	6	1183504	1183509	0 %	0 %	100 %	0 %	56479834
19508	NC_004337	GCG	2	6	1183527	1183532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479834
19509	NC_004337	TGCG	2	8	1183764	1183771	0 %	25 %	50 %	25 %	56479834
19510	NC_004337	TGG	2	6	1183780	1183785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479834
19511	NC_004337	CCG	2	6	1183850	1183855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479834
19512	NC_004337	AGC	2	6	1183867	1183872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479834
19513	NC_004337	A	6	6	1183879	1183884	100 %	0 %	0 %	0 %	56479834
19514	NC_004337	CGC	2	6	1183902	1183907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479834
19515	NC_004337	TGG	2	6	1183908	1183913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479834
19516	NC_004337	A	7	7	1183953	1183959	100 %	0 %	0 %	0 %	24112540
19517	NC_004337	AGC	2	6	1183961	1183966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112540
19518	NC_004337	GCA	2	6	1183967	1183972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112540
19519	NC_004337	TGA	2	6	1183980	1183985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112540
19520	NC_004337	ATC	2	6	1184034	1184039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112540
19521	NC_004337	CCG	2	6	1184060	1184065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112540
19522	NC_004337	TACCTG	2	12	1184116	1184127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	24112540
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19524	NC_004337	ATG	2	6	1184239	1184244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112540
19525	NC_004337	CGG	2	6	1184309	1184314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112540
19526	NC_004337	CGC	2	6	1184330	1184335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112540
19527	NC_004337	CAA	2	6	1184521	1184526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112540
19528	NC_004337	ATG	2	6	1184557	1184562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112540
19529	NC_004337	G	6	6	1184680	1184685	0 %	0 %	100 %	0 %	24112540
19530	NC_004337	CAG	2	6	1184695	1184700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112540
19531	NC_004337	TGGC	2	8	1184728	1184735	0 %	25 %	50 %	25 %	24112540
19532	NC_004337	T	7	7	1184789	1184795	0 %	100 %	0 %	0 %	24112540
19533	NC_004337	ACAGCA	2	12	1184804	1184815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	24112540
19534	NC_004337	TGGC	2	8	1184872	1184879	0 %	25 %	50 %	25 %	24112540
19535	NC_004337	AGC	2	6	1184888	1184893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112540
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19537	NC_004337	TGG	2	6	1184912	1184917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112540
19538	NC_004337	CGAA	2	8	1185038	1185045	50 %	0 %	25 %	25 %	24112540
19539	NC_004337	TGG	2	6	1185078	1185083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112540
19540	NC_004337	TGA	2	6	1185084	1185089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112540
19541	NC_004337	GGA	2	6	1185230	1185235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112541
19542	NC_004337	CA	3	6	1185240	1185245	50 %	0 %	0 %	50 %	24112541
19543	NC_004337	CAG	2	6	1185269	1185274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112541
19544	NC_004337	AGG	2	6	1185277	1185282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112541
19545	NC_004337	CCA	2	6	1185355	1185360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112541
19546	NC_004337	ATC	2	6	1185408	1185413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112541
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19550	NC_004337	CGA	2	6	1185535	1185540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112542
19551	NC_004337	AGGC	2	8	1185601	1185608	25 %	0 %	50 %	25 %	24112542
19552	NC_004337	TGA	2	6	1185613	1185618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112542
19553	NC_004337	GCCA	2	8	1185634	1185641	25 %	0 %	25 %	50 %	24112542
19554	NC_004337	ATG	2	6	1185656	1185661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112542
19555	NC_004337	G	7	7	1185763	1185769	0 %	0 %	100 %	0 %	24112542
19556	NC_004337	GAG	2	6	1185844	1185849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532141225
19557	NC_004337	GGCG	2	8	1185854	1185861	0 %	0 %	75 %	25 %	532141225
19558	NC_004337	CCG	2	6	1185894	1185899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141225
19559	NC_004337	CG	4	8	1185898	1185905	0 %	0 %	50 %	50 %	532141225
19560	NC_004337	TGCG	2	8	1185964	1185971	0 %	25 %	50 %	25 %	532141225
19561	NC_004337	AT	3	6	1185988	1185993	50 %	50 %	0 %	0 %	532141225
19562	NC_004337	CGCC	2	8	1185995	1186002	0 %	0 %	25 %	75 %	532141225
19563	NC_004337	GTG	3	9	1186003	1186011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532141225
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19573	NC_004337	ACCG	2	8	1186337	1186344	25 %	0 %	25 %	50 %	24112544
19574	NC_004337	TGA	2	6	1186379	1186384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112544
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19579	NC_004337	GCG	2	6	1186612	1186617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112545
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19585	NC_004337	TTAAGG	2	12	1186994	1187005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479836
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19589	NC_004337	ACC	2	6	1187336	1187341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479836
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19598	NC_004337	TATGC	2	10	1187825	1187834	20 %	40 %	20 %	20 %	56479836
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19600	NC_004337	CAT	2	6	1188003	1188008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479836
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19602	NC_004337	ACCT	2	8	1188121	1188128	25 %	25 %	0 %	50 %	56479836
19603	NC_004337	CGG	2	6	1188140	1188145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479836
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19605	NC_004337	A	6	6	1188271	1188276	100 %	0 %	0 %	0 %	56479836
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19610	NC_004337	GTT	2	6	1188533	1188538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112547
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19612	NC_004337	CGC	2	6	1188629	1188634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112547
19613	NC_004337	GGAGAA	2	12	1188649	1188660	50 %	0 %	50 %	0 %	24112547
19614	NC_004337	GAA	2	6	1188676	1188681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112547
19615	NC_004337	CGG	2	6	1188695	1188700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112547
19616	NC_004337	CT	3	6	1189567	1189572	0 %	50 %	0 %	50 %	24112548
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19733	NC_004337	GCTCAA	2	12	1195205	1195216	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	24112553
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