MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_004337	GC	3	6	1118896	1118901	0 %	0 %	50 %	50 %	24112484
18502	NC_004337	A	6	6	1118926	1118931	100 %	0 %	0 %	0 %	24112484
18503	NC_004337	GCA	2	6	1118988	1118993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112484
18504	NC_004337	CCT	2	6	1119016	1119021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24112484
18505	NC_004337	ATG	2	6	1119166	1119171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112484
18506	NC_004337	ACC	3	9	1119629	1119637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915245
18507	NC_004337	ACC	2	6	1119662	1119667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915245
18508	NC_004337	AGT	2	6	1119671	1119676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915245
18509	NC_004337	GCA	2	6	1119687	1119692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915245
18510	NC_004337	CGC	2	6	1119694	1119699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915245
18511	NC_004337	TGG	2	6	1119729	1119734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915245
18512	NC_004337	CCAAT	2	10	1119759	1119768	40 %	20 %	0 %	40 %	344915245
18513	NC_004337	AAC	2	6	1119773	1119778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915245
18514	NC_004337	TGA	2	6	1119912	1119917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915245
18515	NC_004337	GAA	2	6	1119953	1119958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344915245
18516	NC_004337	GACCAC	2	12	1119967	1119978	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344915245
18517	NC_004337	GGC	2	6	1120003	1120008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915245
18518	NC_004337	CCA	2	6	1120023	1120028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915245
18519	NC_004337	CCG	2	6	1120080	1120085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915245
18520	NC_004337	GCA	2	6	1120125	1120130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915245
18521	NC_004337	GGT	2	6	1120175	1120180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915245
18522	NC_004337	CAC	3	9	1120273	1120281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915245
18523	NC_004337	CGA	2	6	1120285	1120290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915245
18524	NC_004337	AGTC	2	8	1120326	1120333	25 %	25 %	25 %	25 %	344915245
18525	NC_004337	GCC	2	6	1120370	1120375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915245
18526	NC_004337	CAA	2	6	1120396	1120401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915245
18527	NC_004337	ACC	2	6	1120529	1120534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915245
18528	NC_004337	T	6	6	1120576	1120581	0 %	100 %	0 %	0 %	344915245
18529	NC_004337	CGC	2	6	1120704	1120709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915245
18530	NC_004337	ACC	2	6	1120778	1120783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915245
18531	NC_004337	A	6	6	1120871	1120876	100 %	0 %	0 %	0 %	344915245
18532	NC_004337	CATGA	2	10	1120913	1120922	40 %	20 %	20 %	20 %	344915245
18533	NC_004337	ATA	2	6	1120947	1120952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915245
18534	NC_004337	ACA	2	6	1121009	1121014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915245
18535	NC_004337	AAT	2	6	1121060	1121065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915245
18536	NC_004337	GCA	2	6	1121131	1121136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915245
18537	NC_004337	AAC	2	6	1121150	1121155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915245
18538	NC_004337	ACC	2	6	1121165	1121170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915245
18539	NC_004337	ATCAA	2	10	1121205	1121214	60 %	20 %	0 %	20 %	344915245
18540	NC_004337	TGA	2	6	1121215	1121220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915245
18541	NC_004337	CAA	2	6	1121236	1121241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915245
18542	NC_004337	CTG	2	6	1121261	1121266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915245
18543	NC_004337	CAA	2	6	1121293	1121298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915245
18544	NC_004337	GTCTG	2	10	1121327	1121336	0 %	40 %	40 %	20 %	344915245
18545	NC_004337	TCT	2	6	1121345	1121350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915245
18546	NC_004337	CGGGA	2	10	1121374	1121383	20 %	0 %	60 %	20 %	344915245
18547	NC_004337	CAA	2	6	1122519	1122524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112486
18548	NC_004337	GC	3	6	1122561	1122566	0 %	0 %	50 %	50 %	24112486
18549	NC_004337	ACC	2	6	1122628	1122633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112486
18550	NC_004337	AGGGC	2	10	1122744	1122753	20 %	0 %	60 %	20 %	24112486
18551	NC_004337	TCA	2	6	1122781	1122786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112486
18552	NC_004337	TGG	2	6	1122843	1122848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112486
18553	NC_004337	CAGC	2	8	1122859	1122866	25 %	0 %	25 %	50 %	24112486
18554	NC_004337	CAA	2	6	1122931	1122936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112486
18555	NC_004337	CAC	2	6	1122975	1122980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112486
18556	NC_004337	ATGA	2	8	1122985	1122992	50 %	25 %	25 %	0 %	24112486
18557	NC_004337	TCC	2	6	1123039	1123044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24112486
18558	NC_004337	CGAA	2	8	1123052	1123059	50 %	0 %	25 %	25 %	24112486
18559	NC_004337	CTG	2	6	1123087	1123092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112486
18560	NC_004337	GAA	2	6	1123132	1123137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112486
18561	NC_004337	CCA	2	6	1123193	1123198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112486
18562	NC_004337	TGC	2	6	1123208	1123213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112486
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18564	NC_004337	TTG	2	6	1123325	1123330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479816
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18566	NC_004337	TCG	2	6	1123489	1123494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479816
18567	NC_004337	CTC	2	6	1123558	1123563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56479816
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18569	NC_004337	TGACGG	2	12	1123728	1123739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56479816
18570	NC_004337	TGG	2	6	1123773	1123778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479816
18571	NC_004337	GCA	2	6	1123857	1123862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479816
18572	NC_004337	TACCG	2	10	1123864	1123873	20 %	20 %	20 %	40 %	56479816
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18575	NC_004337	TTC	2	6	1124021	1124026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479817
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18578	NC_004337	TAA	2	6	1124181	1124186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56479817
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18583	NC_004337	GTT	2	6	1124355	1124360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479817
18584	NC_004337	GGC	2	6	1124425	1124430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479817
18585	NC_004337	CCAG	2	8	1124522	1124529	25 %	0 %	25 %	50 %	56479817
18586	NC_004337	ACG	2	6	1124564	1124569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479817
18587	NC_004337	GCA	2	6	1124586	1124591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479817
18588	NC_004337	CGTG	2	8	1124613	1124620	0 %	25 %	50 %	25 %	56479817
18589	NC_004337	AGT	2	6	1124751	1124756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479817
18590	NC_004337	GGT	2	6	1124778	1124783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479817
18591	NC_004337	TC	3	6	1124832	1124837	0 %	50 %	0 %	50 %	56479817
18592	NC_004337	CAGC	2	8	1124865	1124872	25 %	0 %	25 %	50 %	56479817
18593	NC_004337	TGG	3	9	1124886	1124894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479817
18594	NC_004337	TGT	2	6	1124901	1124906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479817
18595	NC_004337	GCG	2	6	1124939	1124944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479817
18596	NC_004337	GTG	2	6	1124986	1124991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479817
18597	NC_004337	CAAT	2	8	1125043	1125050	50 %	25 %	0 %	25 %	56479817
18598	NC_004337	ATC	2	6	1125085	1125090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479817
18599	NC_004337	TGA	2	6	1125091	1125096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479817
18600	NC_004337	ACT	2	6	1125110	1125115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479818
18601	NC_004337	AGCG	2	8	1125164	1125171	25 %	0 %	50 %	25 %	56479818
18602	NC_004337	CGG	2	6	1125178	1125183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479818
18603	NC_004337	TCCG	2	8	1125190	1125197	0 %	25 %	25 %	50 %	56479818
18604	NC_004337	GAT	2	6	1125230	1125235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479818
18605	NC_004337	CAG	2	6	1125278	1125283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479818
18606	NC_004337	GTAT	2	8	1125307	1125314	25 %	50 %	25 %	0 %	56479818
18607	NC_004337	CGG	2	6	1125340	1125345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479818
18608	NC_004337	GAT	2	6	1125368	1125373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479818
18609	NC_004337	AAC	2	6	1125394	1125399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479818
18610	NC_004337	CAG	2	6	1125421	1125426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479818
18611	NC_004337	GTG	2	6	1125453	1125458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479818
18612	NC_004337	GAT	2	6	1125516	1125521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479818
18613	NC_004337	GCCC	2	8	1125566	1125573	0 %	0 %	25 %	75 %	56479818
18614	NC_004337	CAT	2	6	1125603	1125608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479818
18615	NC_004337	CCG	2	6	1125659	1125664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479818
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18617	NC_004337	GCGAA	2	10	1125763	1125772	40 %	0 %	40 %	20 %	56479818
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18851	NC_004337	TGC	2	6	1140172	1140177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112501
18852	NC_004337	TAT	2	6	1140181	1140186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112501
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18862	NC_004337	GT	3	6	1140639	1140644	0 %	50 %	50 %	0 %	24112501
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18999	NC_004337	CG	3	6	1151634	1151639	0 %	0 %	50 %	50 %	24112511
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