MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18004	NC_004337	CAA	2	6	1083641	1083646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112446
18005	NC_004337	ATGA	2	8	1083651	1083658	50 %	25 %	25 %	0 %	24112446
18006	NC_004337	TGC	2	6	1083682	1083687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479802
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18008	NC_004337	GCA	2	6	1083861	1083866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479802
18009	NC_004337	TTG	2	6	1083888	1083893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479802
18010	NC_004337	GAC	2	6	1083897	1083902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479802
18011	NC_004337	GAC	2	6	1083921	1083926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479802
18012	NC_004337	GCTT	2	8	1083934	1083941	0 %	50 %	25 %	25 %	56479802
18013	NC_004337	AT	3	6	1084010	1084015	50 %	50 %	0 %	0 %	56479802
18014	NC_004337	GGA	2	6	1084089	1084094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56479802
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18019	NC_004337	ATC	2	6	1084357	1084362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479802
18020	NC_004337	TGA	2	6	1084412	1084417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479802
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18053	NC_004337	TGC	2	6	1086663	1086668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479804
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18118	NC_004337	CTGG	2	8	1090213	1090220	0 %	25 %	50 %	25 %	56479805
18119	NC_004337	TCT	2	6	1090230	1090235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479805
18120	NC_004337	GTTT	2	8	1090252	1090259	0 %	75 %	25 %	0 %	56479805
18121	NC_004337	CCG	2	6	1090337	1090342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479805
18122	NC_004337	TCG	2	6	1090555	1090560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479805
18123	NC_004337	TGC	2	6	1090566	1090571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479805
18124	NC_004337	TTC	2	6	1090633	1090638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479805
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18128	NC_004337	ATG	2	6	1091320	1091325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112451
18129	NC_004337	CTT	2	6	1091333	1091338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112451
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18132	NC_004337	GTA	2	6	1091373	1091378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112451
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18134	NC_004337	TTC	2	6	1091457	1091462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112451
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18139	NC_004337	CTTC	2	8	1091671	1091678	0 %	50 %	0 %	50 %	24112451
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18144	NC_004337	TG	3	6	1091868	1091873	0 %	50 %	50 %	0 %	24112451
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18152	NC_004337	GGAC	2	8	1092229	1092236	25 %	0 %	50 %	25 %	24112451
18153	NC_004337	GTT	2	6	1092248	1092253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112451
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18349	NC_004337	A	6	6	1107908	1107913	100 %	0 %	0 %	0 %	24112471
18350	NC_004337	ATC	2	6	1108102	1108107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112471
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18469	NC_004337	GCT	2	6	1116868	1116873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479815
18470	NC_004337	TGG	3	9	1116942	1116950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479815
18471	NC_004337	CCG	2	6	1117120	1117125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479815
18472	NC_004337	TGC	2	6	1117338	1117343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112481
18473	NC_004337	TTCT	2	8	1117403	1117410	0 %	75 %	0 %	25 %	24112481
18474	NC_004337	CAG	2	6	1117442	1117447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112481
18475	NC_004337	T	6	6	1117453	1117458	0 %	100 %	0 %	0 %	24112481
18476	NC_004337	AG	3	6	1117502	1117507	50 %	0 %	50 %	0 %	24112481
18477	NC_004337	TGC	2	6	1117512	1117517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112481
18478	NC_004337	TGC	2	6	1117615	1117620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112482
18479	NC_004337	CTG	2	6	1117723	1117728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112482
18480	NC_004337	TTGC	2	8	1117745	1117752	0 %	50 %	25 %	25 %	24112482
18481	NC_004337	CTGGTG	2	12	1117771	1117782	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	24112482
18482	NC_004337	GTT	2	6	1117789	1117794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112482
18483	NC_004337	GCC	2	6	1117798	1117803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112482
18484	NC_004337	GGT	2	6	1117827	1117832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112482
18485	NC_004337	CG	3	6	1117835	1117840	0 %	0 %	50 %	50 %	24112482
18486	NC_004337	CAA	2	6	1117997	1118002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112483
18487	NC_004337	CGC	2	6	1118003	1118008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112483
18488	NC_004337	CAA	2	6	1118213	1118218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112483
18489	NC_004337	TTGA	2	8	1118220	1118227	25 %	50 %	25 %	0 %	24112483
18490	NC_004337	TCC	2	6	1118301	1118306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24112483
18491	NC_004337	ATT	2	6	1118424	1118429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112483
18492	NC_004337	GCT	2	6	1118447	1118452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112483
18493	NC_004337	GTA	2	6	1118462	1118467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112483
18494	NC_004337	TCA	2	6	1118500	1118505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112483
18495	NC_004337	A	6	6	1118529	1118534	100 %	0 %	0 %	0 %	24112483
18496	NC_004337	GAT	2	6	1118592	1118597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112483
18497	NC_004337	CGC	2	6	1118796	1118801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112484
18498	NC_004337	CAA	2	6	1118812	1118817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112484
18499	NC_004337	GC	3	6	1118832	1118837	0 %	0 %	50 %	50 %	24112484
18500	NC_004337	GCA	2	6	1118857	1118862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112484

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