MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_004337	ATG	2	6	1051828	1051833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112413
17503	NC_004337	GTT	2	6	1051896	1051901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112413
17504	NC_004337	CGA	2	6	1051997	1052002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112413
17505	NC_004337	CGTC	2	8	1052028	1052035	0 %	25 %	25 %	50 %	24112413
17506	NC_004337	ATG	2	6	1052048	1052053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112413
17507	NC_004337	TAA	2	6	1052057	1052062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112413
17508	NC_004337	TA	3	6	1052332	1052337	50 %	50 %	0 %	0 %	24112414
17509	NC_004337	GTA	2	6	1052341	1052346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112414
17510	NC_004337	ATT	2	6	1052377	1052382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112414
17511	NC_004337	A	6	6	1052405	1052410	100 %	0 %	0 %	0 %	24112414
17512	NC_004337	A	7	7	1052419	1052425	100 %	0 %	0 %	0 %	24112414
17513	NC_004337	AC	3	6	1052455	1052460	50 %	0 %	0 %	50 %	24112414
17514	NC_004337	GT	3	6	1052463	1052468	0 %	50 %	50 %	0 %	24112414
17515	NC_004337	GTAAA	2	10	1052497	1052506	60 %	20 %	20 %	0 %	24112414
17516	NC_004337	AATGAT	2	12	1052568	1052579	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	24112414
17517	NC_004337	ATT	2	6	1052585	1052590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112414
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17519	NC_004337	TTA	2	6	1052738	1052743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112414
17520	NC_004337	AT	3	6	1052762	1052767	50 %	50 %	0 %	0 %	24112414
17521	NC_004337	TGA	2	6	1052786	1052791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112414
17522	NC_004337	T	6	6	1052794	1052799	0 %	100 %	0 %	0 %	24112414
17523	NC_004337	CCAG	2	8	1052834	1052841	25 %	0 %	25 %	50 %	24112414
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17528	NC_004337	TTG	2	6	1053097	1053102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112414
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17533	NC_004337	A	6	6	1053252	1053257	100 %	0 %	0 %	0 %	24112414
17534	NC_004337	TGCT	2	8	1053304	1053311	0 %	50 %	25 %	25 %	24112414
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17539	NC_004337	CCTC	2	8	1053503	1053510	0 %	25 %	0 %	75 %	24112414
17540	NC_004337	T	6	6	1053517	1053522	0 %	100 %	0 %	0 %	24112414
17541	NC_004337	A	6	6	1053539	1053544	100 %	0 %	0 %	0 %	24112414
17542	NC_004337	AATG	2	8	1053551	1053558	50 %	25 %	25 %	0 %	24112414
17543	NC_004337	CGC	2	6	1053903	1053908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479794
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17549	NC_004337	TATGCC	2	12	1054207	1054218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56479794
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17552	NC_004337	GAT	2	6	1054338	1054343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479794
17553	NC_004337	GAT	2	6	1054348	1054353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479794
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17557	NC_004337	CCTG	2	8	1054465	1054472	0 %	25 %	25 %	50 %	56479794
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17974	NC_004337	CTG	2	6	1081412	1081417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112443
17975	NC_004337	CA	3	6	1081480	1081485	50 %	0 %	0 %	50 %	24112443
17976	NC_004337	CCA	2	6	1081633	1081638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112443
17977	NC_004337	GTCTG	2	10	1081693	1081702	0 %	40 %	40 %	20 %	24112443
17978	NC_004337	ATC	2	6	1081796	1081801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112443
17979	NC_004337	GCT	2	6	1081807	1081812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112443
17980	NC_004337	A	6	6	1081814	1081819	100 %	0 %	0 %	0 %	24112443
17981	NC_004337	TAA	2	6	1081859	1081864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112443
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17984	NC_004337	ATT	2	6	1082344	1082349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479801
17985	NC_004337	TTACTC	2	12	1082357	1082368	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	56479801
17986	NC_004337	GTT	2	6	1082527	1082532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479801
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17988	NC_004337	T	6	6	1082730	1082735	0 %	100 %	0 %	0 %	24112445
17989	NC_004337	CT	3	6	1082739	1082744	0 %	50 %	0 %	50 %	24112445
17990	NC_004337	GTTT	2	8	1082756	1082763	0 %	75 %	25 %	0 %	24112445
17991	NC_004337	T	6	6	1082761	1082766	0 %	100 %	0 %	0 %	24112445
17992	NC_004337	TCA	2	6	1082860	1082865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112445
17993	NC_004337	GCTG	2	8	1083000	1083007	0 %	25 %	50 %	25 %	24112445
17994	NC_004337	TGT	2	6	1083142	1083147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112446
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17997	NC_004337	CAG	2	6	1083290	1083295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112446
17998	NC_004337	TTA	2	6	1083321	1083326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112446
17999	NC_004337	GTA	2	6	1083356	1083361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112446
18000	NC_004337	GTG	2	6	1083384	1083389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112446

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