MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_004337	GCG	2	6	901158	901163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112276
15003	NC_004337	ATC	2	6	901164	901169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112276
15004	NC_004337	CTG	2	6	901176	901181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112276
15005	NC_004337	GGA	2	6	901211	901216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112276
15006	NC_004337	CTG	2	6	901275	901280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112276
15007	NC_004337	AAT	2	6	901303	901308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112276
15008	NC_004337	GAA	2	6	901359	901364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112277
15009	NC_004337	CGG	2	6	901367	901372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112277
15010	NC_004337	AG	3	6	901401	901406	50 %	0 %	50 %	0 %	24112277
15011	NC_004337	GCA	2	6	901468	901473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112277
15012	NC_004337	CAA	2	6	901848	901853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112278
15013	NC_004337	CAC	2	6	902006	902011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112278
15014	NC_004337	TTC	2	6	902025	902030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112278
15015	NC_004337	GAA	2	6	902039	902044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112278
15016	NC_004337	CAG	2	6	902067	902072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112278
15017	NC_004337	CTGC	2	8	902129	902136	0 %	25 %	25 %	50 %	24112278
15018	NC_004337	CCG	2	6	902175	902180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112278
15019	NC_004337	CTG	2	6	902229	902234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112278
15020	NC_004337	GCCCA	2	10	902253	902262	20 %	0 %	20 %	60 %	24112278
15021	NC_004337	AAC	2	6	902288	902293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112278
15022	NC_004337	CAC	2	6	902343	902348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112278
15023	NC_004337	ACC	2	6	902414	902419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112278
15024	NC_004337	GCT	2	6	902440	902445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112278
15025	NC_004337	CTT	2	6	902535	902540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112278
15026	NC_004337	GCT	2	6	902645	902650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112278
15027	NC_004337	T	6	6	902759	902764	0 %	100 %	0 %	0 %	24112279
15028	NC_004337	TCA	2	6	902870	902875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112279
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15030	NC_004337	GGC	2	6	902929	902934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112279
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15032	NC_004337	T	7	7	903006	903012	0 %	100 %	0 %	0 %	24112279
15033	NC_004337	TGT	2	6	903027	903032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112279
15034	NC_004337	CCT	2	6	903210	903215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24112280
15035	NC_004337	TG	3	6	903230	903235	0 %	50 %	50 %	0 %	24112280
15036	NC_004337	TGCA	2	8	903250	903257	25 %	25 %	25 %	25 %	24112280
15037	NC_004337	TTC	2	6	903268	903273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112280
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15039	NC_004337	CTGC	2	8	903339	903346	0 %	25 %	25 %	50 %	24112280
15040	NC_004337	CGC	2	6	903466	903471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112280
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15045	NC_004337	A	7	7	904038	904044	100 %	0 %	0 %	0 %	24112281
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15051	NC_004337	CTG	2	6	904419	904424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112282
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15053	NC_004337	GTCTG	2	10	904700	904709	0 %	40 %	40 %	20 %	24112282
15054	NC_004337	TAA	2	6	904808	904813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112282
15055	NC_004337	CGT	2	6	904872	904877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112282
15056	NC_004337	ATC	2	6	904924	904929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112282
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15059	NC_004337	TTCG	2	8	905132	905139	0 %	50 %	25 %	25 %	56479759
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15061	NC_004337	A	6	6	905200	905205	100 %	0 %	0 %	0 %	56479759
15062	NC_004337	TTTGA	2	10	905265	905274	20 %	60 %	20 %	0 %	56479759
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15067	NC_004337	AAAAT	2	10	905537	905546	80 %	20 %	0 %	0 %	24112284
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15072	NC_004337	AC	3	6	906408	906413	50 %	0 %	0 %	50 %	24112285
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15086	NC_004337	ACCGC	2	10	907325	907334	20 %	0 %	20 %	60 %	532141219
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15089	NC_004337	TTCA	2	8	907556	907563	25 %	50 %	0 %	25 %	532141219
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15101	NC_004337	CTCG	2	8	909186	909193	0 %	25 %	25 %	50 %	24112288
15102	NC_004337	T	6	6	909208	909213	0 %	100 %	0 %	0 %	24112288
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15488	NC_004337	AG	3	6	935362	935367	50 %	0 %	50 %	0 %	24112311
15489	NC_004337	TCA	2	6	935390	935395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112311
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15491	NC_004337	ACGGCC	2	12	935442	935453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	24112311
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15493	NC_004337	ATC	2	6	935572	935577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112311
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