MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004337	GCA	2	6	870892	870897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479754
14502	NC_004337	CCG	2	6	870990	870995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479754
14503	NC_004337	CT	3	6	871063	871068	0 %	50 %	0 %	50 %	56479754
14504	NC_004337	CAC	2	6	871138	871143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479754
14505	NC_004337	AGCA	2	8	871173	871180	50 %	0 %	25 %	25 %	56479754
14506	NC_004337	ACG	2	6	871356	871361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479754
14507	NC_004337	TGC	2	6	871407	871412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479754
14508	NC_004337	TTG	2	6	871526	871531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479754
14509	NC_004337	GTG	2	6	871625	871630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479754
14510	NC_004337	TCG	2	6	871689	871694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112255
14511	NC_004337	TGA	2	6	871710	871715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112255
14512	NC_004337	TTG	2	6	871775	871780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112255
14513	NC_004337	TGA	2	6	871808	871813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112255
14514	NC_004337	CCA	2	6	871838	871843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112255
14515	NC_004337	CCG	2	6	871988	871993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112255
14516	NC_004337	TGC	2	6	872042	872047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112255
14517	NC_004337	GGCTGG	2	12	872051	872062	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	24112255
14518	NC_004337	TAT	2	6	872077	872082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112255
14519	NC_004337	GGT	2	6	872098	872103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112255
14520	NC_004337	CG	3	6	872124	872129	0 %	0 %	50 %	50 %	24112255
14521	NC_004337	TGA	2	6	872135	872140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112255
14522	NC_004337	CGG	2	6	872142	872147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112255
14523	NC_004337	ACCG	2	8	872169	872176	25 %	0 %	25 %	50 %	24112255
14524	NC_004337	GCT	2	6	872278	872283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112255
14525	NC_004337	TCC	2	6	872331	872336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24112255
14526	NC_004337	TGT	2	6	872376	872381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112255
14527	NC_004337	CTGG	2	8	872393	872400	0 %	25 %	50 %	25 %	24112255
14528	NC_004337	ATGGC	2	10	872437	872446	20 %	20 %	40 %	20 %	24112255
14529	NC_004337	ATT	2	6	872494	872499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112255
14530	NC_004337	GGT	2	6	872514	872519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112255
14531	NC_004337	GTG	2	6	872530	872535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112255
14532	NC_004337	CGC	2	6	872541	872546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112255
14533	NC_004337	CAAA	2	8	872547	872554	75 %	0 %	0 %	25 %	24112255
14534	NC_004337	CAG	2	6	872641	872646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112255
14535	NC_004337	ACG	2	6	872657	872662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112255
14536	NC_004337	AAC	2	6	872681	872686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112255
14537	NC_004337	CCTGCG	2	12	872724	872735	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	24112255
14538	NC_004337	ATGTTG	2	12	872744	872755	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	24112255
14539	NC_004337	GCG	2	6	872777	872782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112255
14540	NC_004337	ATT	2	6	872783	872788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112255
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14542	NC_004337	CGC	2	6	872884	872889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112255
14543	NC_004337	GAA	2	6	872971	872976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112255
14544	NC_004337	TGC	2	6	873005	873010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112255
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14547	NC_004337	TGG	2	6	873239	873244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112255
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14549	NC_004337	GCT	3	9	873498	873506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112255
14550	NC_004337	TGG	2	6	873743	873748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112256
14551	NC_004337	CCAT	2	8	873791	873798	25 %	25 %	0 %	50 %	24112256
14552	NC_004337	TGG	2	6	873804	873809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112256
14553	NC_004337	AAT	2	6	873810	873815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24112256
14554	NC_004337	CGC	3	9	873831	873839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112256
14555	NC_004337	AAACC	2	10	873854	873863	60 %	0 %	0 %	40 %	24112256
14556	NC_004337	TTG	2	6	873872	873877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112256
14557	NC_004337	ACGA	2	8	874235	874242	50 %	0 %	25 %	25 %	24112257
14558	NC_004337	CTGG	2	8	874243	874250	0 %	25 %	50 %	25 %	24112257
14559	NC_004337	GAA	2	6	874268	874273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112257
14560	NC_004337	ATG	2	6	874326	874331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112257
14561	NC_004337	TTCTT	2	10	874373	874382	0 %	80 %	0 %	20 %	24112257
14562	NC_004337	ATG	2	6	874383	874388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112257
14563	NC_004337	CCG	2	6	874455	874460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112257
14564	NC_004337	TCAA	2	8	874581	874588	50 %	25 %	0 %	25 %	56479755
14565	NC_004337	GC	3	6	874625	874630	0 %	0 %	50 %	50 %	56479755
14566	NC_004337	GCT	2	6	874675	874680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479755
14567	NC_004337	CTGC	2	8	874781	874788	0 %	25 %	25 %	50 %	56479755
14568	NC_004337	AC	3	6	874806	874811	50 %	0 %	0 %	50 %	56479755
14569	NC_004337	TCC	2	6	874865	874870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56479755
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14572	NC_004337	TCT	2	6	875024	875029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479755
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14580	NC_004337	AGC	2	6	875391	875396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479755
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14583	NC_004337	TCGA	2	8	875624	875631	25 %	25 %	25 %	25 %	56479755
14584	NC_004337	ATC	2	6	875645	875650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479755
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14587	NC_004337	CGA	2	6	875782	875787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479755
14588	NC_004337	GTG	2	6	875861	875866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479755
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14591	NC_004337	CTGA	2	8	875984	875991	25 %	25 %	25 %	25 %	56479755
14592	NC_004337	CGGT	2	8	876036	876043	0 %	25 %	50 %	25 %	56479755
14593	NC_004337	TGC	3	9	876255	876263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479755
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14596	NC_004337	TGA	2	6	876381	876386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479755
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14600	NC_004337	ACA	2	6	876510	876515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479755
14601	NC_004337	ATC	2	6	876528	876533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479755
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14604	NC_004337	CTGG	2	8	876640	876647	0 %	25 %	50 %	25 %	56479755
14605	NC_004337	A	6	6	876713	876718	100 %	0 %	0 %	0 %	56479755
14606	NC_004337	CTG	2	6	876734	876739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479755
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14609	NC_004337	AGC	2	6	876841	876846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479755
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14615	NC_004337	CGG	2	6	878191	878196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112260
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14984	NC_004337	TGT	2	6	899854	899859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24112276
14985	NC_004337	TCT	2	6	899963	899968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112276
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14987	NC_004337	CTGC	2	8	900111	900118	0 %	25 %	25 %	50 %	24112276
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