MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_004337	TGA	2	6	785101	785106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112173
13003	NC_004337	CGA	2	6	785185	785190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112173
13004	NC_004337	GAAGGG	2	12	785191	785202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24112173
13005	NC_004337	CAGT	2	8	785262	785269	25 %	25 %	25 %	25 %	24112173
13006	NC_004337	ACTG	2	8	785276	785283	25 %	25 %	25 %	25 %	24112173
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13009	NC_004337	CGG	2	6	786008	786013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112174
13010	NC_004337	GA	4	8	786066	786073	50 %	0 %	50 %	0 %	24112174
13011	NC_004337	AGT	2	6	786097	786102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112174
13012	NC_004337	A	6	6	786190	786195	100 %	0 %	0 %	0 %	24112174
13013	NC_004337	T	6	6	786214	786219	0 %	100 %	0 %	0 %	24112174
13014	NC_004337	AT	3	6	786225	786230	50 %	50 %	0 %	0 %	24112174
13015	NC_004337	CGC	2	6	786371	786376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112175
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13018	NC_004337	CCGGG	2	10	786635	786644	0 %	0 %	60 %	40 %	24112175
13019	NC_004337	TCA	2	6	786655	786660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112175
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13021	NC_004337	TGGC	2	8	786772	786779	0 %	25 %	50 %	25 %	24112175
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13041	NC_004337	CGCC	2	8	787407	787414	0 %	0 %	25 %	75 %	24112176
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13054	NC_004337	AGCC	2	8	788065	788072	25 %	0 %	25 %	50 %	24112176
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13245	NC_004337	TGG	2	6	799384	799389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112186
13246	NC_004337	GCA	2	6	799435	799440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112186
13247	NC_004337	GCT	2	6	799534	799539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112186
13248	NC_004337	CAGTA	2	10	799550	799559	40 %	20 %	20 %	20 %	24112186
13249	NC_004337	CAT	2	6	799601	799606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112186
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13251	NC_004337	ACA	2	6	799758	799763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24112186
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13255	NC_004337	CGG	2	6	800163	800168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24112187
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13257	NC_004337	CTGG	2	8	800495	800502	0 %	25 %	50 %	25 %	24112187
13258	NC_004337	CGA	2	6	800559	800564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112187
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13262	NC_004337	ATC	3	9	800638	800646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112187
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13264	NC_004337	CTG	2	6	800773	800778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112187
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13267	NC_004337	TGGAAG	2	12	800981	800992	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	24112187
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13272	NC_004337	TAC	2	6	801178	801183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112187
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13275	NC_004337	ATG	2	6	801379	801384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112187
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13277	NC_004337	GTA	2	6	801596	801601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112187
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13280	NC_004337	CG	3	6	801942	801947	0 %	0 %	50 %	50 %	56479735
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13351	NC_004337	CAG	2	6	805935	805940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112190
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13353	NC_004337	CCA	2	6	806024	806029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24112190
13354	NC_004337	GCGA	2	8	806096	806103	25 %	0 %	50 %	25 %	24112190
13355	NC_004337	CAG	3	9	806145	806153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112190
13356	NC_004337	ATG	2	6	806209	806214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112190
13357	NC_004337	CAG	2	6	806223	806228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112190
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13360	NC_004337	ATC	2	6	806364	806369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24112190
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13362	NC_004337	GC	3	6	806507	806512	0 %	0 %	50 %	50 %	24112190
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13487	NC_004337	CTG	2	6	813423	813428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479736
13488	NC_004337	TGG	3	9	813662	813670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479737
13489	NC_004337	CAC	2	6	813687	813692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479737
13490	NC_004337	TTAC	2	8	813830	813837	25 %	50 %	0 %	25 %	56479737
13491	NC_004337	GGAA	2	8	813852	813859	50 %	0 %	50 %	0 %	56479737
13492	NC_004337	ATC	2	6	813935	813940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479737
13493	NC_004337	CGAT	2	8	813983	813990	25 %	25 %	25 %	25 %	56479737
13494	NC_004337	TTA	2	6	814034	814039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479737
13495	NC_004337	GAT	2	6	814065	814070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479737
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13497	NC_004337	AAC	2	6	814249	814254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479737
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13499	NC_004337	TGC	2	6	814268	814273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479737
13500	NC_004337	CTG	2	6	814324	814329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479737

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