MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_004337	CT	3	6	689740	689745	0 %	50 %	0 %	50 %	56479709
11503	NC_004337	AGA	2	6	689748	689753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479709
11504	NC_004337	AG	3	6	689758	689763	50 %	0 %	50 %	0 %	56479709
11505	NC_004337	AG	3	6	689828	689833	50 %	0 %	50 %	0 %	56479709
11506	NC_004337	ACA	2	6	689876	689881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479709
11507	NC_004337	ATT	2	6	689926	689931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479709
11508	NC_004337	GAG	2	6	690001	690006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56479709
11509	NC_004337	ACA	2	6	690029	690034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479709
11510	NC_004337	CTG	2	6	690404	690409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112072
11511	NC_004337	TCTG	2	8	690500	690507	0 %	50 %	25 %	25 %	24112072
11512	NC_004337	CCT	2	6	690516	690521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24112072
11513	NC_004337	CCG	2	6	690589	690594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112072
11514	NC_004337	TGA	2	6	690718	690723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24112072
11515	NC_004337	A	6	6	690777	690782	100 %	0 %	0 %	0 %	24112072
11516	NC_004337	GCT	2	6	690952	690957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112072
11517	NC_004337	AAG	2	6	690969	690974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112072
11518	NC_004337	GTCTG	2	10	690997	691006	0 %	40 %	40 %	20 %	24112072
11519	NC_004337	TGG	2	6	691008	691013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24112072
11520	NC_004337	GAA	2	6	691031	691036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24112072
11521	NC_004337	ATT	2	6	691037	691042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24112072
11522	NC_004337	GCC	2	6	691110	691115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112072
11523	NC_004337	ACGTT	2	10	691132	691141	20 %	40 %	20 %	20 %	24112072
11524	NC_004337	CGA	2	6	691156	691161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112072
11525	NC_004337	TGC	2	6	691198	691203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24112072
11526	NC_004337	CTT	2	6	691224	691229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112072
11527	NC_004337	GA	3	6	691382	691387	50 %	0 %	50 %	0 %	24112073
11528	NC_004337	T	6	6	691419	691424	0 %	100 %	0 %	0 %	24112073
11529	NC_004337	CGC	2	6	691425	691430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24112073
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11532	NC_004337	CGTA	2	8	691494	691501	25 %	25 %	25 %	25 %	24112073
11533	NC_004337	CTT	2	6	691503	691508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24112073
11534	NC_004337	CAG	2	6	691518	691523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112073
11535	NC_004337	CAG	2	6	691545	691550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24112073
11536	NC_004337	CAT	2	6	691701	691706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141213
11537	NC_004337	AAT	2	6	691707	691712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532141213
11538	NC_004337	GCG	3	9	691714	691722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532141213
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11540	NC_004337	GC	4	8	691753	691760	0 %	0 %	50 %	50 %	532141213
11541	NC_004337	CGC	2	6	691889	691894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532141213
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11543	NC_004337	GCAA	2	8	691929	691936	50 %	0 %	25 %	25 %	532141213
11544	NC_004337	GGC	2	6	691976	691981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532141213
11545	NC_004337	GCCAGC	2	12	692019	692030	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532141213
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11548	NC_004337	CAT	2	6	692146	692151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141213
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11550	NC_004337	CCTG	2	8	692187	692194	0 %	25 %	25 %	50 %	532141213
11551	NC_004337	CCA	2	6	692200	692205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532141213
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11553	NC_004337	GAAG	2	8	692232	692239	50 %	0 %	50 %	0 %	532141213
11554	NC_004337	GTC	2	6	692256	692261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141213
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11557	NC_004337	ATC	2	6	692351	692356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532141213
11558	NC_004337	GC	3	6	692357	692362	0 %	0 %	50 %	50 %	532141213
11559	NC_004337	CGT	2	6	692395	692400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141213
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11987	NC_004337	TGG	2	6	722551	722556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532141215
11988	NC_004337	TGG	2	6	722802	722807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532141215
11989	NC_004337	TCG	2	6	722867	722872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141215
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